核磁気共鳴法による巨大蛋白質の立体構造の新規解析法の開発

• 研究課題/領域番号: 23770111
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 宮ノ入 洋平 名古屋大学, 理学研究科, 特任助教 (80547521)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: NMR / 蛋白質 / 核磁気共鳴法 / 高分子量蛋白質 / SAIL / SAIL法

研究概要

核緩和機構を制御した新規芳香族アミノ酸を開発し、効率よく目的蛋白質に導入する方法を確立した。このアミノ酸を分子量 82kDa の巨大蛋白質に導入し、芳香環CH シグナルを高感度かつ先鋭的に観測し、帰属する事に成功した。また、芳香環シグナルとメチル基およびアミド基との間の距離情報を高精度に解析する方法も確立した。このことにより、従来の方法では困難であった巨大蛋白質の溶液立体構造の決定が可能となった。

研究成果

• [雑誌論文] Molecular bases of multimodal regulation of a fungal transient receptor potential (TRP) channel (2013)
  • 著者名/発表者名: Ihara M,Hamamoto S, Miyanoiri Y, Takeda M, Kainosho M, Yabe I, Uozumi N, Yamashita A
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: (in press) 号: 21 ページ: 15303-17
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.434795
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular bases of multimodal regulation of a fungal transient receptor potential (TRP) channel (2013)
  • 著者名/発表者名: Ihara Makoto
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stereo-array isotope labeling method for studying protein structure and dynamics (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮ノ入 洋平
  • 雑誌名: Advances in Experimental Medicine and Biology 巻: 992 ページ: 83-93
  • DOI: 10.1007/978-94-007-4954-2_5
  • ISBN: 9789400749535, 9789400749542
• [雑誌論文] Alternative SAIL-Trp for robust aromatic signal assignment and determination of the X(2) conformation by intra-residue NOEs (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Miyanoiri, M.Takeda, J.-G.Jee, A.M.Ono, K.Okuma, T.Terauchi, M.Kainosho
  • 雑誌名: J.Biomol.NMR 巻: 51 号: 4 ページ: 425-435
  • DOI: 10.1007/s10858-011-9568-3
  • 査読あり
• [学会発表] SAIL 法による巨大蛋白質の新規立体構造解析法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮ノ入洋平, 武田光広, 大熊宏昌, 小野明, 寺内勉, 甲斐荘正恒
  • 学会等名: 第51回 NMR 討論会
  • 発表場所: ウインクあいち(愛知県名古屋市)
• [学会発表] SAIL aromatic CH TROSY to investigate larger proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyanoiri Y, Takeda M, Ono AM, Okuma K, Terauchi T, Kainosho M
  • 学会等名: International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems LYON 2012
  • 発表場所: Lyon Convention Centre(Lyon, France)
• [学会発表] SAIL aromatic CH TROSY to investigate larger proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyanoiri Yohei
  • 学会等名: International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems LYON 2012
  • 発表場所: Lyon Convention Centre (Lyon, France)
• [学会発表] SAIL法による巨大蛋白質の新規立体構造解析法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮ノ入洋平
  • 学会等名: 第５１回NMR討論会
  • 発表場所: ウインクあいち(愛知県)
• [学会発表] SAIL aromatic CH TROSY to investigate larger proteins and protein complexes (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyanoiri Y, Takeda M, Jee J, Ono AM, Okuma K, Terauchi T, Kainosho M
  • 学会等名: The international Symposium on Nuclear Magnetic Resonance 2011
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川県横浜市)
• [学会発表] Various applications of SAIL aromatic amino acids for NMR studies of proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyanoiri Y, Takeda M, Jee J, Ono AM, Okuma K, Terauchi T, Kainosho M
  • 学会等名: The 4thAsia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Central Garden Beijing Hotel (Beijing, China)
• [学会発表] Various applications of SAIL aromatic amino acids for NMR studies of proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Yohei Miyanoiri, Mitsuhiro Takeda, JunGoo Jee, Akira Mei Ono, Kosuke Okuma, Tsutomu Terauchi, Masatsune Kainosho
  • 学会等名: The 4th Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Beijing, China
• [学会発表] SAIL aromatic CH TROSY to investigate larger proteins and protein complexes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yohei Miyanoiri, Mitsuhiro Takeda, JunGoo Jee, Akira Mei Ono, Kosuke Okuma, Tsutomu Terauchi, Masatsune Kainosho
  • 学会等名: The International Symposium on Nuclear Magnetic Resonance 2011
  • 発表場所: Yokohama, Japan
• [備考]
  • URL: http://str.bio.nagoya-u.ac.jp:8080/Plone/753265908358
• [備考] 名古屋大学大学院理学研究科附属構造生物学研究センター 甲斐荘グループ
  • URL: http://str.bio.nagoya-u.ac.jp:8080/Plone/753265908358