| 研究課題/領域番号 |
23770192
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生物物理学
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| 研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
森 貴治 独立行政法人理化学研究所, 分子機能シミュレーション研究チーム, 基礎科学特別研究員 (90402445)
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| 研究協力者 |
杉田 有治 独立行政法人理化学研究所, 杉田理論分子科学研究室, 主任研究員
小串 典子 独立行政法人理化学研究所, 杉田理論分子科学研究室, 協力研究員
ファイグ マイケル Michigan state university, Department of Biochemistry & Molecular Biology, Associate Professor
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| 研究期間 (年度) |
2011 – 2012
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| 研究課題ステータス |
完了 (2012年度)
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| 配分額 *注記 |
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2011年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
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| キーワード | 膜タンパク質 / 脂質二重膜 / 脂質ラフト / 分子動力学シミュレーション / 拡張アンサンブル法 / レプリカ交換法 / 国際情報交流 |
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| 研究概要 |
膜タンパク質-脂質二重膜複合体の精密な構造モデリング法の確立を目指し、3つの新しい手法、(1)ボロノイ分割モンテカルロ積分法、(2)表面張力レプリカ交換法、(3)溶媒和自由エネルギー計算に基づく膜タンパク質の配向予測法の開発に成功した。これらの手法を用いることで、膜タンパク質系の分子動力学シミュレーションの精密な初期構造モデリング、シミュレーションの妥当性の判断、混合脂質二重膜に対する効率の良い構造モデリングが期待できる。
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