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植物の遠縁交雑後の世代で進むエピジェネティックな遺伝子発現変化

研究課題

研究課題/領域番号 23780011
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 育種学
研究機関独立行政法人農業生物資源研究所

研究代表者

深井 英吾  独立行政法人農業生物資源研究所, 植物科学研究領域・植物共生機構研究ユニット, 特別研究員 (00570657)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2011年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード遠縁交雑 / エピジェネティクス / トランスポゾン / 次世代シークエンサー / トランスクリプトーム / ゲノム / ミヤコグサ / 種間交雑 / マメ科
研究概要

遺伝的に遠い両親間の交雑後代では、通常のメンデル遺伝では説明できないような、エピジェネティックな遺伝子発現変動が生じると考えられている。本研究ではミヤコグサの遠縁交雑集団において、両親と比較して発現変動した転写産物を複数同定した。またその一つであるレトロトランスポゾンについて、エピジェネティックマークの1つであるDNAメチル化の変動を解析した。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Activation of an endogenous retrotransposon associated with epigenetic changes in Lotus japonicus: A tool for functional genomics in legumes2013

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai, Jens Stougaard, Makoto Hayashi
    • 雑誌名

      The Plant Genome

      巻: (Accepted)

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the exon-targeting endogenous retrotransposon LORE12012

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Hideki Hirakawa, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 69 号: 4 ページ: 720-730

    • DOI

      10.1111/j.1365-313x.2011.04826.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化2013

    • 著者名/発表者名
      深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
    • 学会等名
      日本育種学会第123回講演会
    • 発表場所
      東京農業大学
    • 年月日
      2013-03-27
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ミヤコグサの種間交雑RIL集団におけるレトロトランスポゾンの活性化2013

    • 著者名/発表者名
      深井英吾, Niels Sandal, 吉川学, 平川英樹, 梅原洋佐, 河内宏, 佐藤修正, Jens Stougaard, 廣近洋彦, 林誠
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会 第54回
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2013-03-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the endogenous retrotransposon LORE1.2012

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai, Takashi Soyano, Yosuke Umehara, Shinobu Nakayama, Satoshi Tabata, Shusei Sato, Makoto Hayashi
    • 学会等名
      VI International conference on Legume Genomics and Genetics
    • 発表場所
      Hyderabad, India
    • 年月日
      2012-10-10
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 内在性レトロトランスポゾンLORE1によるマメ科モデル植物ミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発2012

    • 著者名/発表者名
      深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発2012

    • 著者名/発表者名
      深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
    • 学会等名
      日本植物生理学会年会 第53回
    • 発表場所
      京都産業大学
    • 年月日
      2012-03-16
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Establishment of a Lotus japonicus gene tagging population using the endogenous retrotransposon LORE1.2012

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai
    • 学会等名
      VI International conference on Legume Genomics and Genetics
    • 発表場所
      Hyderabad Marriott Hotel & Convention Centre, Hyderabad, India
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発2012

    • 著者名/発表者名
      深井英吾、征矢野敬、梅原洋佐、中山しのぶ、平川英樹、田畑哲之、佐藤修正、林誠
    • 学会等名
      第53回 日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      京都産業大学
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 内在性レトロトランスポゾン LORE1 によるマメ科モデル植物ミヤコグサの大規模遺伝子タギング系の開発2012

    • 著者名/発表者名
      深井英吾、征矢野敬、梅原洋佐、中山しのぶ、平川英樹、田畑哲之、佐藤修正、林誠
    • 学会等名
      日本育種学会 第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系2011

    • 著者名/発表者名
      深井英吾, 征矢野敬, 梅原洋佐, 中山しのぶ, 岸田佳恵、平川英樹, 田畑哲之, 佐藤修正, 林誠
    • 学会等名
      植物微生物研究会第21回研究交流会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-09-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 内在のレトロトランスポゾンLORE1を用いたミヤコグサの大規模遺伝子タギング系2011

    • 著者名/発表者名
      深井英吾,征矢野敬,梅原洋佐,中山しのぶ,岸田佳恵,平川英樹,田畑哲之,佐藤修正,林誠
    • 学会等名
      植物微生物研究会 第21回研究交流会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [備考] 所属研究室のウェブサイト

    • URL

      http://www.nias.affrc.go.jp/org/DivPlant/Symbiosis/

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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