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孔形成タンパク質の多量体化機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23780107
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 応用生物化学
研究機関長崎大学

研究代表者

郷田 秀一郎  長崎大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (00346587)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードタンパク質工学 / 蛋白質 / タンパク質 / 生体分子 / 糖鎖
研究概要

孔形成タンパク質は細胞表面で多量体化することによって膜孔を形成し、細胞を破壊する。本研究では、X線小角散乱、X線結晶構造解析法によって、膜孔形成多量体の多量体化における構造変化及び多量体の構造を明らかとした。X線小角散乱測定より海産無脊椎動物グミ由来溶血性レクチンは、まず初めに最小単位である7量体を形成し、その後、さらに7量体が3分子会合することによって21量体を形成すること、また、界面活性剤によって7量体に解離することを見出した。これらのことから界面活性剤存在下での結晶化を試み、良好な回折点を生じる結晶を得ることに成功した。

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (29件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic study of oligomers of the haemolytic lectin CEL-III from the sea cucumber Cucumaria echinata2013

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Unno, Keigo Hisamatsu, Tomonao Nagao, Yuki Tateya, Naoki Matsumoto, Shuichiro Goda, and Tomomitsu Hatakeyama
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: F69 号: 4 ページ: 416-420

    • DOI

      10.1107/s1744309113004065

    • NAID

      120006985934

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of Detergents on the Oligomeric Structures of Hemolytic Lectin CEL-III as Determined by Small-Angle X-Ray Scattering2013

    • 著者名/発表者名
      Shuichiro Goda, Hitoshi Sadakata, Hideaki Unno, and Tomomitsu Hatakeyama
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 77 号: 3 ページ: 679-681

    • DOI

      10.1271/bbb.120981

    • NAID

      10031164799

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alteration of the Carbohydrate-Binding Specificity of a C-type Lectin CEL-I Mutant with an EPN Carbohydrate-Binding Motif2013

    • 著者名/発表者名
      Tomomitsu Hatakeyama
    • 雑誌名

      Protein and Peptide Letters

      巻: in printing

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Assay for Carbohydrate-Binding Activity of Lectins Using Polyamidoamine Dendrimer Conjugated with Carbohydrates2012

    • 著者名/発表者名
      Tomomitsu Hatakeyama, Ryota Karino, Yasuaki Terai, Masanari Kimura, Hideaki Unno, Shuichiro Goda
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 76 号: 10 ページ: 1999-2001

    • DOI

      10.1271/bbb.120520

    • NAID

      130004054025

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and thermodynamic characterization of the self-adhesive properties of human P-cadherin.2012

    • 著者名/発表者名
      Kudo S
    • 雑誌名

      Mol Biosyst.

      巻: Aug;8(8) 号: 8 ページ: 2050-2053

    • DOI

      10.1039/c2mb25161b

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Substrate-induced change in the quaternary structure of type 2 isopentenyl diphosphate isomerase from Sulfolobus shibatae2012

    • 著者名/発表者名
      Nakatani, H.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol.

      巻: 194(in press) 号: 12 ページ: 3216-3224

    • DOI

      10.1128/jb.00068-12

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An assay for Carbohydrate-Binding Activity of Lectins using Polyamidoamine Dendrimer Conjugated with Carbohydrates2012

    • 著者名/発表者名
      Tomomitsu Hatakeyama
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem

      巻: 76 ページ: 1999-2001

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural modeling of RNase P RNA of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT32011

    • 著者名/発表者名
      Christian Zwieb, Yuji Nakao, Takashi Nakashima, Hisanori Takagi, Shuichiro Goda, Ebbe S Andersen, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      巻: 414 号: 3 ページ: 517-522

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.09.098

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural modeling of RNase P RNA of the hyper2011

    • 著者名/発表者名
      Christian Zwieb
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      巻: 414 ページ: 517-522

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alteration of the Carbohydrate-Binding Specificity of a C-type Lectin CEL-I Mutant with an EPN Carbohydrate-Binding Motif

    • 著者名/発表者名
      Tomomitsu Hatakeyama, Tomohiro Ishimine, Tomohiro Baba, Masanari Kimura, Hideaki Unno, and Shuichiro Goda
    • 雑誌名

      Protein and Peptide Letters in press

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 棘皮動物グミ由来溶血性レクチンCEL-IIIの細胞膜貫通オリゴマー構造2013

    • 著者名/発表者名
      畠山智充
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      東北大学川内北キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIオリゴマーの結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      畠山 智充
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] サンゴ由来溶血性レクチン相同性タンパク質の糖認識の解明2012

    • 著者名/発表者名
      工藤 彰洋
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場、マリンメッセ福岡
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of the structural change of the pore forming toxin by stopped-flow small-angle X-ray scattering2012

    • 著者名/発表者名
      Shuichiro Goda
    • 学会等名
      3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
    • 発表場所
      University of Florence Florence イタリア
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystallization of the pore forming toxin CEL-III from marine invertebrate, Cucumaria echinata2012

    • 著者名/発表者名
      Tomonao Nagao
    • 学会等名
      3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
    • 発表場所
      University of Florence Florence イタリア
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの膜孔形成複合体結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      海野英昭
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      フェニックスシーガイアリゾートサンホテルフェニックス"
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] サンゴ由来レクチン相同性タンパク質の糖特異性の解明2012

    • 著者名/発表者名
      工藤彰洋
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      フェニックスシーガイアリゾートサンホテルフェニックス
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの多量体化機構のX線小角散乱測定による解明2012

    • 著者名/発表者名
      郷田秀一郎
    • 学会等名
      第29回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of the structural change of the pore forming toxin by stopped-flow small-angle X-ray scattering2012

    • 著者名/発表者名
      Shuichiro Goda
    • 学会等名
      3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
    • 発表場所
      University of Florence
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Crystallization of the pore forming toxin CEL-III from marine invertebrate, Cucumaria echinata2012

    • 著者名/発表者名
      Tomonao Nagao
    • 学会等名
      3rd International Workshop on Expression, Structure and Function of Membrane Proteins
    • 発表場所
      University of Florence
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIオリゴマーの結晶構造解析

    • 著者名/発表者名
      畠山智充
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] サンゴ由来溶血性レクチン相同性タンパク質の糖認識の解明

    • 著者名/発表者名
      工藤彰洋
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] サンゴ由来レクチン相同性タンパク質の糖特異性の解明

    • 著者名/発表者名
      工藤彰洋
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      フェニックスシーガイアリゾート
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの膜孔形成複合体結晶構造解析

    • 著者名/発表者名
      海野英昭
    • 学会等名
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      フェニックスシーガイアリゾート
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 好熱性アーキア由来タイプ2イソペンテニル二リン酸イソメラーゼの四次構造に対する基質結合の影響

    • 著者名/発表者名
      中谷仁美
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] イトマキヒトデレクチンおよびその変異体の糖結合活性測定

    • 著者名/発表者名
      畠山智充
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンCEL-IIIの多量体化機構のX線小角散乱測定による解明

    • 著者名/発表者名
      郷田秀一郎
    • 学会等名
      第29回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンの多量体化機構のX線小角散乱法による解析

    • 著者名/発表者名
      郷田秀一郎
    • 学会等名
      第35回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      福岡市東区
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンに相同性を示すサンゴ由来機能未知タンパク質の発現系の構築

    • 著者名/発表者名
      牛島佑樹
    • 学会等名
      第35回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      福岡市東区
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 超好熱アーキアPyrococcus horikoshii由来糖認識タンパク質の探索及び遺伝子組換え体

    • 著者名/発表者名
      山下謙一郎
    • 学会等名
      第35回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      福岡市東区
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 海産無脊椎動物グミ(Cucumaria echinata)由来CEL-IIIの多量体機構の解明

    • 著者名/発表者名
      長尾知直
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 溶血性レクチンに相同性を示すサンゴ由来タンパク質の発現系の構築

    • 著者名/発表者名
      牛島佑樹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来ロイコシジン相同体のin vitroでの多量体化条件の探索

    • 著者名/発表者名
      田中伸弥
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖鎖付加デンドリマーを用いたレクチン活性測定法の開発

    • 著者名/発表者名
      狩野良太
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会
    • 発表場所
      宮崎市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖結合部位に変異を導入したC型レクチンCEL-IVの糖結合特異性と立体構造の解明

    • 著者名/発表者名
      本多麻美
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会
    • 発表場所
      宮崎市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] C型レクチンCEL-Iの糖結合部位アミノ酸置換による結合特異性の変化

    • 著者名/発表者名
      馬場智大
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会
    • 発表場所
      宮崎市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 超好熱古細菌RNasePRNAの高次構造モデル

    • 著者名/発表者名
      中尾祐士
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会
    • 発表場所
      宮崎市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 超好熱アーキア由来膜タンパク質の緑色蛍光タンパク質融合体としての生産

    • 著者名/発表者名
      眞方山慶佑
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本支部・中四国支部合同大会
    • 発表場所
      宮崎市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] ストップドフローX線小角散乱測定による溶血性レクチンの構造変化の解明

    • 著者名/発表者名
      郷田秀一郎
    • 学会等名
      第28回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば市
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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