プロテオミクスによる白色腐朽菌の選択的リグニン分解機構と鍵代謝物生合成系の解明

• 研究課題/領域番号: 23780183
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 木質科学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 渡邊 崇人 京都大学, 生存圏研究所, 助教 (30362403)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2013
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2011年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: リグニン / 白色腐朽菌 / 脂質関連代謝物 / プロテオーム

研究概要

白色腐朽菌 Ceriporiopsis subvermispora は，セルロースを極力壊さずにリグニンを選択的に分解する．その選択的リグニン分解機構を解明する一環として，今回は，リグニン分解フラグメントの１つであるバニリンに対する細胞応答を調べた．蛍光ディファレンスゲル二次元電気泳動を行い，バニリン存在下と非存在下での発現プロファイルを取得した結果，バニリンで発現が誘導される，または，抑制されるタンパク質が見つかった．また，サプレッションサブトラクティブハイブリダイゼーションによりバニリンで誘導される遺伝子を数多く取得した．

研究成果

• [雑誌論文] Vanillin-induced cellular response in the white rot fungus, Ceriporiopsis subvermispora (2013)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Nishimura, H, Watanabe, T
  • 雑誌名: Sustainable Humanosphere 巻: 9 ページ: 2-2
  • NAID: 120005465870
  • URL: http://www.rish.kyoto-u.ac.jp/ISSN/1880-6503/
• [雑誌論文] Vanillin-induced cellular response in the white rot fungus, Ceriporiopsis subvermispora (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahito Watanabe, Hiroshi Nishimura, Takashi Watanabe
  • 雑誌名: Sustainable Humanosphere 巻: 9 ページ: 2-2
  • NAID: 120005465870
• [雑誌論文] Comparative genomics of Ceriporiopisis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium provide insight into selective ligninolysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Elena Fernandez-Fueyo, Chiaki Hori, et.al.
  • 雑誌名: PNAS 巻: 109 号: 14 ページ: 5458-5463
  • DOI: 10.1073/pnas.1119912109
  • 査読あり
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌Ceriporiopsis subvermisporaのバニリンに対する細胞応答 (2013)
  • 著者名/発表者名: 渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,西村裕志,本田与一,渡辺隆司
  • 学会等名: 第13回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2013-11-21
• [学会発表] 選択的リグニン分解菌のバニリンに対する細胞応答 (2013)
  • 著者名/発表者名: 渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,和泉千尋,津田冴子,西村裕志,渡辺隆司
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度(平成25年度)大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2013-03-26
• [学会発表] 選択的リグニン分解菌のバニリンに対する細胞応答 (2013)
  • 著者名/発表者名: 渡邊崇人
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度（平成25年度）大会
  • 発表場所: 東北大学（仙台市）
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌Ceriporiopsis subvermisporaのリグニン分解フラグメントに対する転写応答及び代謝物解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森賢一郎,高田理江,渡邊崇人,本田与一,渡辺隆司
  • 学会等名: 第62回日本木材学会大会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2012-03-17
• [学会発表] Cellular response of a selective lignin-degrading fungus to vanillin. Lignobiotech II Symposium (2012)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Mori, K., Kido, A., Izumi, C., Hasegawa, T., Tsuda, S., Nishimura, H., Honda, Y., Watanabe, T
  • 学会等名: 2nd Symposium on Biotechnology Applied to Ligonocelluloses
  • 発表場所: Fukuoka
• [学会発表] Cellular response of a selective lignin-degrading fungus to vanillin (2012)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T.
  • 学会等名: Lignobiotech II Symposium, 2nd Symposium on Biotechnology Applied to Lignocelluloses
  • 発表場所: アクロス福岡（福岡市）
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌 Ceriporiopsis subvermispora のリグニン分解フラグメントに対する転写応答及び代謝物解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森賢一郎
  • 学会等名: 第62回日本木材学会大会
  • 発表場所: 北海道大学（札幌）
• [学会発表] 選択的白色腐朽菌 Ceriporiopsis subvermispora のバニリンに対する細胞応答
  • 著者名/発表者名: 渡邊崇人，森賢一郎，木戸彩子，長谷川隆大，西村裕志，本田与一，渡辺隆司
  • 学会等名: 第13回糸状菌分子生物学コンファレンス
  • 発表場所: つくば国際会議場