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抗生物質に対する耐性メカニズムの分子構造論的研究と創薬への応用

研究課題

研究課題/領域番号 23790054
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 物理系薬学
研究機関上智大学

研究代表者

近藤 次郎  上智大学, 理工学部, 助教 (10546576)

研究協力者 HANESSIAN Stephen  モントリオール大学, 教授
BAASOV Timor  テクニオン工科大学, 教授
研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2013年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2011年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
キーワード薬剤耐性菌 / 抗生物質 / リボソーム / X線結晶解析 / ドラッグデザイン / X線結晶解析
研究概要

アミノグリコシドは様々な細菌に対して殺菌効果を示す抗生物質であり、細菌リボソームの活性部位Aサイトに結合することでタンパク質合成の正確性を低下させる。これに対して細菌は、リボソームRNAの1408番目のAをGまたは1-methyl-Aに変異させることで薬剤耐性を獲得する。申請者は本研究で、薬剤耐性菌がもつ変異型リボソームRNAの立体構造をX線結晶解析によって明らかにし、薬剤耐性獲得メカニズムを分子レベルで解明した。さらに得られた構造情報を基に、薬剤耐性菌や感染性原虫にも効く新規薬剤のデザインにも成功した。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (24件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Identification of the molecular attributes required for aminoglycoside activity against Leishmania2013

    • 著者名/発表者名
      Moran Shalev, Jiro Kondo, Dmitry Kopelyanskiy, Charles L. Jaffe, Noam Adir, Timor Baasov
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 110 号: 33 ページ: 13333-1338

    • DOI

      10.1073/pnas.1307365110

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of a bioactive 6'-hydroxy variant of sisomicin bound to the bacterial and protozoal ribosomal decoding sites2013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Juan Pablo Maianti,Vu Linh Ly, Stephen Hanessian
    • 雑誌名

      ChemMedChem

      巻: 8 号: 5 ページ: 733-739

    • DOI

      10.1002/cmdc.201200579

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] リボソームの分子進化 : AサイトRNA分子スイッチの動きからの考察2013

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 雑誌名

      実験医学増刊号

      巻: 31 ページ: 1011-1017

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of the bacterial and protozoal A sites in complex with 6'-hydroxysisomicin2013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Juan Pablo Maianti, Vu Linh Ly, Stephen Hanessian
    • 雑誌名

      Photon Factory Activity Report 2012

      巻: 30 ページ: 285-285

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structures of the bacterial A site in complex with sisomicin2013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Tomoko Kasahara
    • 雑誌名

      Photon Factory Activity Report 2012

      巻: 30 ページ: 286-286

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] リボソームの分子進化:AサイトRNA分子スイッチの動きからの考察2013

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 雑誌名

      実験医学増刊号

      巻: 31 ページ: 1011-1017

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure and specific binding mode of sisomicin to the bacterial ribosomal decoding site2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Tomoko Kasahara
    • 雑誌名

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      巻: 3 号: 9 ページ: 741-744

    • DOI

      10.1021/ml300145y

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A structural basis for the antibiotic resistance conferred by an A1408G mutation in 16S rRNA and for the antiprotozoal activity of aminoglycosides2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 51 号: 2 ページ: 465-468

    • DOI

      10.1002/anie.201106084

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2011 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structures of the bacterial A1408G-mutant A site with and without geneticin2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 雑誌名

      Photon Factory Activity Report 2011

      巻: 29 ページ: 339-339

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ストロンチウムイオン結合モチーフを持つ特殊なRNA二重らせんの立体構造2014

    • 著者名/発表者名
      金澤宏樹、近藤次郎
    • 学会等名
      物構研サイエンスフェスタ2013
    • 発表場所
      つくば国際会議場エポカル(つくば市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ストロンチウムイオン結合モチーフを持つ特殊なRNA二重らせんの立体構造2014

    • 著者名/発表者名
      金澤宏樹、近藤次郎
    • 学会等名
      物構研サイエンスフェスタ2013
    • 発表場所
      つくば国際会議場エポカル(つくば市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒト・ミトコンドリアリボソームRNAの結晶多形性と立体構造との相関2013

    • 著者名/発表者名
      宮崎まい、鉄本環、高橋由紀子、近藤次郎
    • 学会等名
      平成25年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal structures of the protozoal cytoplasmic A site in complex with aminoglycosides. RNA20132013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei
    • 学会等名
      18th annual meeting of the RNA society
    • 発表場所
      スイス・ダボス
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal structures of the protozoal cytoplasmic A site in complex with aminoglycosides2013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei
    • 学会等名
      RNA2013 (18th annual meeting of the RNA society)
    • 発表場所
      スイス・ダボス
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヒト・ミトコンドリアリボソームRNA の結晶多形性と立体構造との相関2013

    • 著者名/発表者名
      宮崎まい、鉄本環、高橋由紀子、近藤次郎
    • 学会等名
      平成25年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] X線結晶解析で見るRNA分子スイッチの「動き」=「働き」2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      第63回結晶化学研究会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 年月日
      2012-12-22
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Towards the structure-based design of antiprozoal agents : crystal structures of aminoglycosides with an unsaturated sugar ring bound to the ribosomal A sites. ISNAC20122012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Tomoko Kasahara, Stephen Hanessian
    • 学会等名
      The 39th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] アミノグリコシド系抗生物質に対する薬剤耐性獲得メカニズムの構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      平成24年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] A structural basis for the antibiotic resistance conferred by an A1408G mutation in 16S rRNA2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 学会等名
      The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 16S rRNAのA1408G変異による薬剤耐性獲得の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細菌リボソームAサイト-シソマイシン複合体の結晶構造2012

    • 著者名/発表者名
      小金井麻衣、笠原朋子、近藤次郎
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細菌リボソームAサイト-シソマイシン複合体のX線結晶解析2012

    • 著者名/発表者名
      小金井麻衣、笠原朋子、近藤次郎
    • 学会等名
      第1回リボソームミーティング
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] アミノグリコシド系抗生物質に対する耐性獲得メカニズムの構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      第1回リボソームミーティング
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細菌リボソームAサイト-シソマイシン複合体の結晶構造2012

    • 著者名/発表者名
      小金井麻衣、笠原朋子、近藤次郎
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 16S rRNAのA1408G変異による薬剤耐性獲得の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      第14回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] A structural basis for the antibiotic resistance conferred by an A1408G mutation in 16S rRNA2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 学会等名
      The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] アミノグリコシド系抗生物質に対する薬剤耐性獲得メカニズムの構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      平成24年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Towards the structure-based design of antiprozoal agents: crystal structures of aminoglycosides with an unsaturated sugar ring bound to the ribosomal A sites2012

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo, Mai Koganei, Tomoko Kasahara, Stephen Hanessian
    • 学会等名
      ISNAC2012 (The 39th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry)
    • 発表場所
      名古屋大学(名古屋市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] X線結晶解析で見るRNA分子スイッチの「動き」=「働き」2012

    • 著者名/発表者名
      近藤次郎
    • 学会等名
      第63回結晶化学研究会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アミノグリコシド系抗生物質に対する耐性獲得メカニズムの構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      近藤 次郎
    • 学会等名
      第1回リボソームミーティング
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌リボソームAサイト-シソマイシン複合体のX線結晶解析2012

    • 著者名/発表者名
      小金井 麻衣、笠原 朋子、近藤 次郎
    • 学会等名
      第1回リボソームミーティング
    • 発表場所
      広島大学(東広島市)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] Structural basis for antibiotic resistance conferred by an A1408G mutation in 16S rRNA, ISNAC20112011

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 学会等名
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural basis for antibiotic resistance conferred by an A1408G mutation in 16S rRNA2011

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 学会等名
      ISNAC2011 (The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry)
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [図書] Claude Sauter & Benoît Masquida. RNA crystallization. In Roland K. Hartmann, Albrecht Bindereif, Astrid Schon & Eric Westhof (eds.), Handbook of RNA Biochemistry, second edition2014

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo
    • 出版者
      Wiley VHC
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] structural decoding of inhibitors targeting the ribosomal decoding A site. In Claudio O. Gualerzi, Letizia Brandi, Attilio Fabbretti & Cynthia L. Pon (eds.), Antibiotics : Targets, Mechanisms and Resistance2013

    • 著者名/発表者名
      Jiro Kondo & Eric Westhof
    • 出版者
      Wiley VHC
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] Biotechdaily - Online bioresearch news - 2013年8月20日 Light shed on differential effectiveness of aminoglycosides against parasitic protozoa

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 化学工業日報 2011年12月12日 「上智大 細菌の抗生物質耐性獲得メカニズム解明 新薬の設計・開発に応用も」

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 上智大学プレスリリース 2011年12月5日 「細菌のアミノグリコシド系抗生物質に対する耐性メカニズムを分子レベルで解明~耐性菌が抗生物質を免れる分子メカニズムを世界で初めて明らかに~」

    • URL

      https://www.sophia.ac.jp/jpn/content/download/22110/.../file/111205press.pdf

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.sophia.ac.jp/jpn/content/download/22110/215757/file/111205press.pdf

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.st.sophia.ac.jp/wordpress/?p=274

    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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