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次世代シークエンサーを用いたメタゲノム解析による慢性膵炎の病原体候補の探求

研究課題

研究課題/領域番号 23790764
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 消化器内科学
研究機関東北大学

研究代表者

粂 潔  東北大学, 大学病院, 助教 (30431563)

研究期間 (年度) 2011 – 2013
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2013年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2011年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワード膵炎 / 感染症 / レクチン
研究概要

膵炎の成因として一部のウイルス感染などがしられているが、その関連性については十分解明されていない。今回、次世代シークエンサーによる網羅的なメタゲノム解析により膵組織から感染性病原体の同定を試みたが解明には至っておらず、今後の解析が待たれる。また免疫の主要な構成要素であるMannose binding lectinについて、その機能障害と関連するコドン54の遺伝子異常が、急性膵炎後の感染合併例の50%に認められ、感染非合併例における頻度27%に比べやや高率であったが、統計学的有意差を認めなかった。さらに症例を蓄積して検討する必要があると考えられた。

報告書

(4件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2014 2013 2012 2011 2009

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] PRSS1 c.623G>C (p.G208A) variant is associated with pancreatitis in Japan2014

    • 著者名/発表者名
      Masamune A, Nakano E, Kume K, Takikawa T, Kakuta Y, Shimosegawa T
    • 雑誌名

      Gut

      巻: 63 ページ: 366-366

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] PRSS1 c.623G>C (p.G208A) variant is associated with pancreatitis in Japan.2014

    • 著者名/発表者名
      Masamune A, Nakano E, Kume K, Takikawa T, Kakuta Y, Shimosegawa T.
    • 雑誌名

      Gut

      巻: 63 ページ: 366-366

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variants in CPA1 are strongly associated with early onset chronic pancreatitis2013

    • 著者名/発表者名
      Witt H, Beer S, Rosendahl J, Chen JM, Chandak GR, Masamune A, Bence M, Szmola R, Oracz G, Macek M Jr, Bhatia E, Steigenberger S, Lasher D, Bühler F, Delaporte C, Tebbing J, Ludwig M, Pilsak C, Saum K, Bugert P, Masson E, Paliwal S, Bhaskar S, Sobczynska-Tomaszewska A, Bak D, Balascak I, Choudhuri G, Nageshwar Reddy D, Rao GV, Thomas V, Kume K, Nakano E, Kakuta Y, Shimosegawa T, Durko L, Szabó A, Schnúr A, Hegyi P, Rakonczay Z Jr, Pfützer R, Schneider A, Groneberg DA, Braun M, Schmidt H, Witt U, Friess H, Algül H, Landt O, Schuelke M, Krüger R, Wiedenmann B, Schmidt F, Zimmer KP, Kovacs P, Stumvoll M, Blüher M, Müller T, Janecke A, Teich N, Grützmann R, Schulz HU, Mössner J, Keim V, Löhr M, Férec C, Sahin-Tóth M.
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 45 ページ: 1216-1220

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of novel missense CTRC variants in Japanese patients with chronic pancreatitis2013

    • 著者名/発表者名
      Masamune A, Nakano E, Kume K, Kakuta Y, Ariga H, Shimosegawa T
    • 雑誌名

      Gut

      巻: 62 ページ: 653-654

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variants in CPA1 are strongly associated with early onset chronic pancreatitis.2013

    • 著者名/発表者名
      Witt H, Beer S, Rosendahl J, Chen JM, Chandak GR, Masamune A, Bence M, Kume K, Nakano E, Kakuta Y, Shimosegawa T, Wiedenmann B, et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 45 ページ: 1216-1220

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of novel missense CTRC variants in Japanese patients with chronic pancreatitis.2013

    • 著者名/発表者名
      Masamune A, Nakano E, Kume K, Kakuta Y, Ariga H, Shimosegawa T.
    • 雑誌名

      Gut

      巻: 62 ページ: 653-654

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Do genetic variants in the SPINK1 gene affect the level of serum PSTI?2012

    • 著者名/発表者名
      Kume K, Masamune A, Ariga H, Hayashi S, Takikawa T, Miura S, Suzuki N, Kikuta K, Hamada S, Hirota M, Kanno A, Shimosegawa T
    • 雑誌名

      J Gastroenterol

      巻: 47 ページ: 1267-1274

    • NAID

      10031126959

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 遺伝子解析の進展新しい変異は日本で意味があるのか?2012

    • 著者名/発表者名
      粂潔、下瀬川徹
    • 雑誌名

      肝・胆・膵

      巻: 64 ページ: 913-917

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 遺伝子多型は膵炎発症にどのように関与するか2011

    • 著者名/発表者名
      粂潔、下瀬川徹
    • 雑誌名

      分子消化器病

      巻: 8 ページ: 220-226

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 次世代シークエンサーによる膵炎関連遺伝子の網羅的解析2009

    • 著者名/発表者名
      粂潔、正宗淳、下瀬川徹
    • 雑誌名

      Annual Review消化器

      ページ: 239-244

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Whole exome sequenecing might become the new strategy to identify unknown mutations for pancreatitis2013

    • 著者名/発表者名
      粂潔、正宗淳、下瀬川徹
    • 学会等名
      2013 Annual Meeting of the American Gastroenterological Assosiation
    • 発表場所
      Orland
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 世代シークエンサーを用いた全エクソーム解析による膵炎関連遺伝子の検討2013

    • 著者名/発表者名
      粂潔、正宗淳、下瀬川徹
    • 学会等名
      第99回日本消化器病学会総会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Whole exome sequenecing might become the new strategy to identify unknown mutations for pancreatitis.2013

    • 著者名/発表者名
      Kume K, Masamune A, Shimosegawa T.
    • 学会等名
      Annual Meeting of the American Gastroenterological Assosiation
    • 発表場所
      Orland, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 慢性膵炎における遺伝子変異2011

    • 著者名/発表者名
      粂潔、正宗淳、下瀬川徹
    • 学会等名
      第42回日本膵臓学会大会
    • 発表場所
      弘前
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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