原発性胆汁性肝硬変の新規ウイルス感染の可能性とアネロウイルス属の疾患関連性の検討

• 研究課題/領域番号: 23790765
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 二宮 匡史 東北大学, 病院, 医員 (70583938)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2011年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 肝臓学 / 肝炎ウイルス / microRNA / 次世代シークエンサー / 原発性胆汁性肝硬変

研究概要

NOD.c3c4マウス、PBCの患者血清よりRDV法にて未知のウイルス遺伝子の同定を試みる前に、慢性C型肝炎患者血清から、HCVの遺伝子を同様の方法で検出可能かどうか試みたが、困難なため、次世代シークエンサーを用いてウイルス遺伝子検出可能かどうか試みた。
8583readsがリファレンスにmappingされた。約0.1%のreadがHCVゲノム由来であった。Coverageは99.8%、平均depthは69.5Xを示した。NS3領域では、アミノ酸塩基5カ所のvariantsを認めた。

研究成果

• [雑誌論文] Murine Models of Nonalcoholic Fatty Liver Disease and Steatohepatitis (2013)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M, Kondo H, Shimosegawa T
  • 雑誌名: ISRN Hepatology 巻: 2013 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1155/2013/237870
  • 査読あり
• [雑誌論文] Animal Models of Cholangiopathies and Possible Endogenous Viral Infecti (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M, Ueno Y, Shimosegawa T
  • 雑誌名: International journal of hepatology 巻: 2012 ページ: 649290-649290
  • DOI: 10.1155/2012/649290
  • 査読あり
• [雑誌論文] Use of illumina deep sequencing technology to differentiate hepatitis Cvirus variants (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M, Ueno Y, Funayama R, Kagashima T, Nishida Y, Kondo Y, Inoue J, Kakazu E, Kimura O, Nakayama K, Shimosegawa T
  • 雑誌名: Journal of clinical microbiology 巻: 50 号: 3 ページ: 857-866
  • DOI: 10.1128/jcm.05715-11
  • 査読あり
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたC型肝炎ウイルスのアミノ酸配列解析と従来のSanger法シークエンスとの比較第48回 (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: 肝臓学会総会
  • 発表場所: 金沢
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いて慢性B型肝炎患者血清内の特異的なmiRNAのプロファイリングを行い (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: 新規miRNAの候補を見いだしたJDDW2012
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Characterization of circulating microRNAs in patients with primary biliary cirrhosis by Illumina deep sequencing (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M
  • 学会等名: AASLD
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] Circulating microRNAs in some patients with viral hepatitis by deep sequencing showed characteristic expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M
  • 学会等名: AASLD
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた、C型肝炎ウイルスゲノム解析と血清内 microRNAのプロファイリング (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: 第39回日本肝臓学会東部会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたC型肝炎ウイルスのアミノ酸配列解析と従来のSanger法シークエンスとの比較 (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: 第48回 肝臓学会総会
  • 発表場所: 金沢
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いて慢性B型肝炎患者血清内の特異的なmiRNAのプロファイリングを行い、新規miRNAの候補を見いだした (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: JDDW2012
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Characterization of circulating microRNAs in patients with primary biliary cirrhosis by Illumina deep sequencing. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya Masashi
  • 学会等名: AASLD2012
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] Circulating microRNAs in some patients with viral hepatitis by deep sequencing showed characteristic expression. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya Masashi
  • 学会等名: AASLD2012
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた、C型肝炎ウイルスゲノム解析と血清内microRNAのプロファイリング (2012)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: 第39回日本肝臓学会東部会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたC型肝炎ウイルスの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史
  • 学会等名: JDDW2011
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Efficiency of detecting hepatitis C virus using deep sequencing technology: high faculty to differentiate the viral variants compared with Sanger sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M
  • 学会等名: AASLD
  • 発表場所: San Francisco, USA
• [学会発表] HBc抗体陽性レシピエントに臍帯血移植を施行、HBV再活性化が認められたde novo B型肝炎の1例 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史 上野義之 福島耕治 近藤泰輝 井上淳 嘉数英二 涌井祐太 下瀬川徹
  • 学会等名: 第193回 日本内科学会東北地方会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Efficiency of detecting hepatitis C virus using deep sequencing technology: high faculty to differentiate the viral variants compared with Sanger sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Masashi Ninomiya, Yoshiyuki Ueno, Ryo Funayama, Yuishiro Nishida, Yasuteru Kondo, Jun Inoue, Eiji Kakazu, Osamu Kimura, Takao Iwasaki, Keiko Nakayama, Tooru Shimosegawa
  • 学会等名: AASLD
  • 発表場所: アメリカ
• [図書] アークメディア肝胆膵 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史、福島耕二、上野義之、下瀬川徹
  • 出版者: ウイルス感染とPBC
• [図書] 肝胆膵 (2011)
  • 著者名/発表者名: 二宮匡史、福島耕二、上野義之、下瀬川徹
  • 出版者: アークメディア