平成25年5月31日現在次世代シークエンサーによる脂肪細胞特異的な転写制御調節機構の研究

• 研究課題/領域番号: 23791020
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 代謝学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 脇 裕典 東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (00466765)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2011年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 分化 / 遺伝子 / ゲノム / 糖尿病 / 脂肪細胞 / FAIRE / クロマチン / PPARg / 転写 / クロマチン免疫沈降 / 次世代シークエンサー / NFI

研究概要

脂肪細胞に特異的な転写制御調節機構を、次世代シークエンサーを用いてオープンクロマチン領域を検出するFAIRE-seqや、ヒストン修飾、PPARγの結合を検出するChIP-seqを施行した。従来の方法で明らかにされなかった標的遺伝子の遠位に存在する脂肪細胞特異的写制御領域の重要性が明らかとなった。またFAIRE-seqとモチーフ解析の組み合せは脂肪細胞特異的転写制御因子のバイアスのない同定に有効であり、脂肪細胞分化を制御する新規転写因子としてNFIファミリーを同定した。

研究成果

• [雑誌論文] The Epigenome and Its Role in Diabetes (2012)
  • 著者名/発表者名: Waki H, Yamauchi T, Kadowaki T
  • 雑誌名: Curr Diab Rep 巻: 7 号: 6 ページ: 673-685
  • DOI: 10.1007/s11892-012-0328-x
• [雑誌論文] Global Mapping of Cell Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation (2011)
  • 著者名/発表者名: Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, Jing Yu, Lisa Hirose-Yotsuya, Kazumi Take, Wei Sun, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Takanori Fujita, Tomohisa Aoyama, Shuichi Tsutsumi, Kohjiro Ueki, Tatsuhiko Kodama, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani, Takashi Kadowaki
  • 雑誌名: PLoS Genet 巻: 7(10)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global mapping of cell type-specific open chromatin by FAIRE-seq reveals the regulatory role of the NFI family in adipocyte differentiation (2011)
  • 著者名/発表者名: Waki H, Nakamura M, Yamauchi T, Wakabayashi K, Yu J, Hirose-Yotsuya L, Take K, Sun W, Iwabu M, Okada-Iwabu M, Fujita T, Aoyama T, Tsutsumi S, Ueki K, Kodama T, Sakai J, Aburatani H, Kadowaki
  • 雑誌名: PLos Genetics 巻: 7 号: 10 ページ: e1002311-e1002311
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002311
  • 査読あり
• [学会発表] ワークショップ:代謝と生活習慣病をつなぐエピ ジェネティクス制御機構 Epigenetic mechanism linking metabolism and life-style disease 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 【Adiposcienceの新展開:肥満症の基礎研究】脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岡田美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇孝
  • 学会等名: 第33回日本肥満学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-10-12
• [学会発表] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエピゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典
  • 学会等名: 第17回アディポサイエンス研究会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2012-08-25
• [学会発表] Global Mapping of Cell-Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, , Ken-ichi Wakabayashi, Jing Yu, Lisa Hirose Yotsuya, Kazumi Take, Wei Sun, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, , Takanori Fujita, Tomohisa Aoyama, Shuichi Tsutsumi, Kohjiro Ueki, Tatsuhiko Kodama, Juro Sakai, Hiroyuki Aburatani, and Takashi Kadowaki
  • 学会等名: Keystone Symposia Genetic and Molecular Basis of Obesity and Body Weight Regulation (J7) Epigenetics
  • 発表場所: Santa Fe
• [学会発表] Global Mapping of Cell-Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, et al
  • 学会等名: The 64th Fujihara Seminar, International Symposium on Adiponectin Biology and Medicine
  • 発表場所: 北海道 苫小牧
• [学会発表] Global Mapping of Cell-Type-Specific Open Chromatin by FAIRE-seq Reveals the Regulatory Role of the NFI Family in Adipocyte Differentiation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hironori Waki, Masahiro Nakamura, Toshimasa Yamauchi, Ken-ichi Wakabayashi, et al
  • 学会等名: BENZON SYMPOSIUM No. 58 Adipose Tissue in health and Disease
  • 発表場所: COPENHAGEN, DENMARK
• [学会発表] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第49回日本臨床分子医学会学術集会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIファミリーの同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第85回日本内分泌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第6回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] FAIRE-seqによる脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析と分化におけるNFIファミリーの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第55回日本糖尿病学会年次学術集会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第30回日本肥満症治療学会学術集会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内敏正、于 静、中村正裕、若林賢一、青山倫久、四谷理沙、武和巳、孫威、亀井望、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第30回日本肥満症治療学会学術集会
  • 発表場所: 大阪
  • 招待講演
• [学会発表] 脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析による脂肪細胞分化制御因子NFIの同定 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村正裕、山内敏正、若林賢一、于 静、四谷理沙、武和巳、孫威、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、青山倫久、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第33回日本肥満学会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内 敏正、中村 正裕、于 静、ほか
  • 学会等名: 第33回日本肥満学会 シンポジウム
  • 発表場所: 京都
  • 招待講演
• [学会発表] 脂肪細胞分化におけるクロマチン構造変化とエビゲノム制御の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内敏正、于 静、中村正裕、若林賢一、青山倫久、四谷理沙、武和巳、孫威、亀井望、岩部真人、岩部美紀、藤田隆教、堤修一、植木浩二郎、児玉龍彦、酒井寿郎、油谷浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会 ワークショップ
  • 発表場所: 福岡
  • 招待講演
• [学会発表] Global mapping of cell type-specific open chromatin by FAIRE-seq reveals the regulatory role of the NFI family in adipocyte differentiation
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村 正裕、山内 敏正、若林 賢一、于 静、四谷 理沙、武 和巳、孫 威、（一部略）、堤 修一、植木 浩二郎、児玉 龍彦、酒井 寿郎、油谷 浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: Keystone Symposia, Genetic and Molecular Basis of Obesity and Body Weight Regulation (J7)
  • 発表場所: アメリカ合衆国 New Mexico州 Santa Fe
• [学会発表] Global mapping of cell type-specific open chromatin by FAIRE-seq reveals the regulatory role of the NFI family in adipocyte differentiation
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村 正裕、山内 敏正、若林 賢一、于 静、四谷 理沙、武 和巳、孫 威、（一部略）、堤 修一、植木 浩二郎、児玉 龍彦、酒井 寿郎、油谷 浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜市 パシフィコ横浜
• [学会発表] Global mapping of cell type-specific open chromatin by FAIRE-seq reveals the regulatory role of the NFI family in adipocyte differentiation
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、中村 正裕、山内 敏正、若林 賢一、于 静、四谷 理沙、武 和巳、孫 威、（一部略）、堤 修一、植木 浩二郎、児玉 龍彦、酒井 寿郎、油谷 浩幸、門脇 孝
  • 学会等名: Nuclear receptors EMBO 16-20 Conference Series
  • 発表場所: スペイン ES-Sitges, Barcelona
• [学会発表] FAIRE-seqによる脂肪細胞特異的オープンクロマチン領域のゲノムワイド解析
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内 敏正、中村 正裕、若林 賢一、于 静、武 和巳、岩部 真人、岡田 美紀、藤田 隆教、廣瀬 理沙、堤 修一、児玉 龍彦、油谷 浩幸、酒井 寿郎、門脇 孝
  • 学会等名: 第54回日本糖尿病学会年次学術集会
  • 発表場所: 北海道 札幌市
• [図書] 糖尿病学2012 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典
• [図書] 肥満研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典
• [図書] 医学のあゆみ (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇裕典、山内敏正、門脇孝
• [図書] 医学のあゆみ 白色脂肪細胞のエピジェネティックス (2012)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内敏正、門脇 孝
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: 医歯薬出版株式会社
• [図書] 医学のあゆみ エネルギー代謝転写因子ネットワークと生活習慣病 脂肪細胞と転写因子ネットワーク研究：最近の展開―次世代シークエンサーが切り開くエピゲノム・転写因子研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 脇 裕典、山内 敏正、門脇 孝.
  • 出版者: 医歯薬出版
• [備考]
  • URL: http://researchmap.jp/hironori.waki/?lang=japanese
• [備考]
  • URL: http://researchmap.jp/hironori.waki/