共通のゲノム異常に起因する新規症候群の定義と病態解析

• 研究課題/領域番号: 23791155
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 小児科学
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 林 深 東京医科歯科大学, 硬組織疾患ゲノムセンター, 特任講師 (50596244)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2011年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 遺伝 / 先天異常学 / 新規症候群 / アレイCGH / 先天異常疾患 / 発達遅滞 / 疾患原因遺伝子 / 遺伝・先天異常学

研究概要

報告者らはこれまでに臨床的に診断がつかず染色体核型正常である多発奇形を伴う発達遅滞症例を収集し、アレイCGHをはじめとする種々のゲノム解析技法を用いて原因探索を行ってきた。本研究ではこれらのスクリーニングで見いだされた新規症候群であることが疑われる類似した臨床症状を呈する5症例を対象に、疾患原因遺伝子探索を施行した。

研究成果

• [雑誌論文] Clinical and radiological features of Japanese patients with a severe phenotype due to CASK mutations. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takanashi J, Okamoto N, Yamamoto Y, Hayashi S, Arai H, Takahashi Y, Maruyama K, Mizuno S, Shimakawa S, Ono H, Oyanagi R, Kubo S, Barkovich AJ, Inazawa J.
  • 雑誌名: Am J Med Genet A. 巻: 158A 号: 12 ページ: 3112-8
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35640
  • 査読あり
• [雑誌論文] The incidence of hypoplasia of the corpus callosum in patients with dup(X)(q28) involving MECP2 is associated with the location of distal breakpoints. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Hayashi S, Nakane T, Imoto I, Kurosawa K, Mizuno S, Okamoto N, Kato M, Kubota T, Nakagawa E, Goto Y, Inazawa J.
  • 雑誌名: Am J Med Genet A. 巻: 158A ページ: 1292-303
• [雑誌論文] Deletion at chromosome 10p11.23-p12.1 defines characteristic phenotypes with marked midface retrusion (2012)
  • 著者名/発表者名: Okamoto N, Hayashi S, Masui A, Kosaki R, Oguri I, Hasegawa T, Imoto I, Makita Y, Hata A, Moriyama K, Inazawa J
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57(3) 号: 3 ページ: 191-196
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.154
  • 査読あり
• [雑誌論文] Japanese Mental Retardation Consortium. Concomitant microduplications of MECP2 and ATRX in male patients with severe mental retardation (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Satomura S, Hayashi S, Imoto I, Nakagawa E, Goto Y, Inazawa J
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57(1) 号: 1 ページ: 73-77
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.131
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel intragenic duplications and mutations of CASK in patients with mental retardation and microcephaly with pontine and cerebellar hypoplasia (MICPCH) (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Okamoto N, Chinen Y, Takanashi JI, Makita Y, Hata A, Imoto I, Inazawa J
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131(1) 号: 1 ページ: 99-110
  • DOI: 10.1007/s00439-011-1047-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] The incidence of hypoplasia of the corpus callosum in patients with dup (X)(q28) involving MECP2 is associated with the location of distal breakpoints. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, et al.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 158A 号: 6 ページ: 1292-1303
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel intragenic duplications and mutations of CASK in patients with mental retardation and microcephaly with pontine and cerebellar hypoplasia (MICPCH) (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Okamoto N, Chinen Y, Takanashi J, Makita Y, Hata A, Imoto I, Inazawa J.
  • 雑誌名: Hum Genet 巻: 131 ページ: 99-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Concomitant microduplications of MECP2 and ATRX in male patients with severe mental retardation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, Satomura S, Hayashi S, Imoto I, Nakagawa E, Goto Y, Inazawa J, Japanese Mental Retardation Consortium.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 73-77
  • NAID: 10030662505
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deletion at chromosome 10p11.23-p12.1 defines characteristic phenotypes with marked midfacial hypoplasia. (2012)
  • 著者名/発表者名: Okamoto N, Hayashi S, Masui A, Kosaki R, Oguri I, Hasegawa T, Imoto I, Makita Y, Hata A, Moriyama K, Inazawa J.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 191-196
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clinical application of array-based comparative genomic hybridization by two-stage screening for 536 patients with mental retardation and multiple congenital anomalies (2011)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Imoto I, Aizu Y, Okamoto N, Mizuno S, Kurosawa K, Okamoto N, Honda S, Araki S, Mizutani S, Numabe H, Saitoh S, Kosho T, Fukushima Y, Mitsubuchi H, Endo F, Chinen Y, Kosaki R, Okuyama T, Ohki H, Yoshihashi H, Ono M, Takada F, Ono H, Yagi M, Matsumoto H, Makita Y, Hata A, Inazawa J
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 56 号: 2 ページ: 110-124
  • DOI: 10.1038/jhg.2010.129
• [雑誌論文] アレイCGHを用いた先天異常疾患の網羅的ゲノム異常解析と疾患原因遺伝子の探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林深，稲澤讓治，蒔田芳男
  • 雑誌名: 小児科 巻: 52 ページ: 1583-1590
• [学会発表] 高解像度アレイを用いたpathogenicCNVを付加的に修飾する微細CNVの探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 林深,Daniela Tiaki Uehara,長縄光代,稲澤譲治.
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-10-27
• [学会発表] 重度精神遅滞を呈する男児例に同時に見られたMECP2,ATRXの重複 (2012)
  • 著者名/発表者名: 林深,本田尚三,里村茂子,井本逸勢,中川栄二,後藤雄一,稲澤譲治.
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-10-26
• [学会発表] Investigation of the Parental Origin and Genomic Mechanisms Involved in de novo Pathogenic CNVs in Congenital Disorders (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Naganawa M, Uehara DT, Inazawa J.
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 62nd annual meeting
  • 発表場所: San Fransisco
• [学会発表] Investigation of the Parental Origin and Genomic Mechanisms Involved in de novo Pathogenic CNVs in Congenital Disorders (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S
  • 学会等名: The American Society of Human Genetics 62nd
  • 発表場所: San Francisco, USA
• [学会発表] オリゴアレイ・SNPアレイを用いた先天異常疾患症例におけるゲノム異常評価とアレイポテンシャルの比較 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林深,Daniela Chiaki Uehara,長縄光代,井本逸勢,蒔田芳男,羽田明,稲澤譲治.
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2011-11-10
• [学会発表] Pathogenic CNVs and causative genes detected by two-stage screening in647 patients with mental retardation andmultiple congenital anomalies of unknown etiology (2011)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Imoto I, Makita Y, Hata A, Inazawa J.
  • 学会等名: 12th International Congress of Human Genetics / The American Society of Human Genetics 61st annual meeting
  • 発表場所: Montereal
• [学会発表] BACアレイ・SNPアレイを用いた日系ブラジル人100家系のトリオ解析による日本人健常者CNVデータベースの構築 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林深，長縄光代，Daniela Chiaki Uehara，井本逸勢，稲澤譲治
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第55回大会
  • 発表場所: 千葉
• [学会発表] オリゴアレイ・SNPアレイを用いた先天異常疾患症例におけるゲノム異常評価とアレイポテンシャルの比較 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林深，Daniela Chiaki Uehara，長縄光代，井本逸勢，蒔田芳男，羽田明，稲澤譲治
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第55回大会
  • 発表場所: 千葉
• [学会発表] Pathogenic CNVs and causative genes detected by two-stage screening in 647 patients with mental retardation and multiple congenital anomalies of unknown etiology. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hayashi S, Imoto I, Makita Y, Hata A, Inazawa J.
  • 学会等名: 12th International Congress of Human Genetics / The American Society of Human Genetics 61st annual meeting
  • 発表場所: Montreal, Canada
• [学会発表] 重度精神遅滞を呈する男児例に同時に見られたMECP2, ATRXの重複
  • 著者名/発表者名: 林深
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 高解像度アレイを用いたpathogenic CNVを付加的に修飾する微細CNVの探索
  • 著者名/発表者名: 林深
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第57回大会
  • 発表場所: 東京
• [備考] 日本人健常者の親子のトリオ100組をアレイ解析したデータを基に、日本人健常者集団におけるゲノム多様性であるCNVやLOHの出現頻度を収載する"MCGCNVDatabase"を構築して公開した。
  • URL: http://www.cghtmd.jp/CNVDatabase