ゲノムワイド関連解析およびコピー数多型解析による日本人自閉症者遺伝子解析

• 研究課題/領域番号: 23791323
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 精神神経科学
• 研究機関: 浜松医科大学
• 研究代表者: イスメール サンシーム 浜松医科大学, 医学部, 特任研究員 (60569846)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2012年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2011年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
• キーワード: 臨床精神分子遺伝学 / 児童・思春期精神医学 / 自閉症 / コピー数多型 / ゲノムワイド解析 / CNV / 欠失 / de novo / マイクロアレイ

研究概要

本研究では、日本人自閉症者とその両親のDNAサンプル(トリオサンプル)を用いて自閉症と関連する新たなコピー数多型(CNVs)を同定し、新規の自閉症感受性遺伝子を見出すことを目的とした。まず、DSM-IV-TRの診断基準に従いADI-Rを用いて診断された日本人自閉症トリオサンプル250組を収集した。ゲノムDNAをAffymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0 アレイにより解析し、平成24年度末までに、150トリオサンプルの解析を終了した。その結果、12個の新規CNVを見いだした。これら12個の領域から、これまでに報告のない新規の自閉症感受性遺伝子候補を複数同定した。これらの遺伝子は全て両親にはみられないde novo CNVであった。以上から、孤発例の多い自閉症の病態形成メカニズムにde novo CNVが関与していることが示唆される

研究成果

• [雑誌論文] Brain-region specific altered expression, and association of mitochondria-related genes in autism (2012)
  • 著者名/発表者名: Anitha A, Nakamura K, Thanseem I, Yamada K, Iwayama Y, Toyota T, Matsuzaki H, Miyachi T, Yamada S, Tsujii M, Tsuchiya KJ, Matsumoto K, Iwata Y, Suzuki K, Ichikawa H, Sugiyama T, Yoshikawa T, Mori N
  • 雑誌名: Mol Autism 巻: 3(1) ページ: 12-12
• [雑誌論文] H. B. C. Study Team. Seasonal variations of neuromotor development by 14 months of age: Hamamatsu Birth Cohort for mothers and children (HBC Study) (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsuchiya KJ, Tsutsumi H, Matsumoto K, Takei N, Narumiya M, Honda M, Thanseem I, Anitha A, Suzuki K, Matsuzaki H, Iwata Y, Nakamura K, Mori N
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7(12)
• [雑誌論文] Vldlr overexpression causes hyperactivity in rats (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwata K, Izumo N, Matsuzaki H, Manabe T, Ishibashi Y, Ichitani Y, Yamada Y, Thanseem I, Anitha A, Vasu MM, Shimmura C, Wakuda T, Kameno Y, Takahashi T, Iwata Y, Suzuki K, Nakamura K, Mori N
  • 雑誌名: Mol Autism 巻: 3(1) ページ: 11-11
• [雑誌論文] Protocadherin α(PCDHA) as a novel susceptibility gene for autism (2012)
  • 著者名/発表者名: Anitha A, Thanseem I (equal contribution), Nakamura K, Yamada K, Iwayama Y, Toyota T, Iwata Y, Suzuki K, Sugiyama T, Tsujii M, Yoshikawa T, Mori N
  • 雑誌名: J Psychiatry Neurosci 巻: 37(6) ページ: 120058-120058
• [雑誌論文] Elevated transcription factor Sp1 in autism brains alters the expression of autism candidate genes (2012)
  • 著者名/発表者名: Thanseem I, Anitha A, Nakamura K, Suda S, Iwata K, Matsuzaki H, Ohtsubo M, Ueki T, Katayama T, Iwata Y, Suzuki K, Minoshima S, Mori N
  • 雑誌名: Biol Psychiatry 巻: 71(5) ページ: 410-418
• [雑誌論文] Brain-region specific altered expression, and association of mitochondria-related genes in autism. (2012)
  • 著者名/発表者名: Anitha A
  • 雑誌名: Mol Autism 巻: 3 ページ: 12-12
  • DOI: 10.1186/2040-2392-3-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elevated transcription factor Sp1 in autism brains alters the expression of autism candidate genes. (2012)
  • 著者名/発表者名: Thanseem I
  • 雑誌名: Biol. Psychiatry. 巻: 71 ページ: 410-418
  • DOI: 10.1016/j.biopsych.2011.09.020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of transcription factor gene LMX1B with autism (2011)
  • 著者名/発表者名: Thanseem I, Nakamura K, Anitha A, Suda S, Yamada K, Iwayama Y, Toyota T, Tsujii M, Iwata Y, Suzuki K, Matsuzaki H, Iwata K, Sugiyama T, Yoshikawa T, Mori N
  • 雑誌名: PLoS ONE. 巻: 6(8)
• [雑誌論文] Decreased expression of axon-guidance receptors in the anterior cingulate cortex in autism (2011)
  • 著者名/発表者名: Suda S, Iwata K, Shimmura C, Kameno Y, Anitha A, Thanseem I, Nakamura K, Matsuzaki H, Tsuchiya KJ, Sugihara G, Iwata Y, Suzuki K, Koizumi K, Higashida H, Takei N, Mori N
  • 雑誌名: Mol Autism 巻: 2(1) ページ: 14-14
• [雑誌論文] Association of transcription factor gene LMX1B with autism. (2011)
  • 著者名/発表者名: Thanseem I, Nakamura K, Anitha A, Suda S, Yamada K, Iwayama Y, Toyota T, Tsujii M, Iwata Y, Suzuki K, Matsuzaki H, Iwata K, Sugiyama T, Yoshikawa T, Mori N.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decreased expression of axon-guidance receptors in the anterior cingulate cortex in autism. (2011)
  • 著者名/発表者名: Suda S, Iwata K, Shimmura C, Kameno Y, Anitha A, Thanseem I, Nakamura K, Matsuzaki H, Tsuchiya KJ, Sugihara G, Iwata Y, Suzuki K, Koizumi K, Higashida H, Takei N, Mori N.
  • 雑誌名: Mol Autism 巻: 2 ページ: 14-14
  • 査読あり
• [学会発表] Rare de novo copy number variation in Japanese autism subjects (2012)
  • 学会等名: at the 8th Hamamatsu Medical Science symposium
  • 発表場所: Hamamatsu, Japan
• [学会発表] De novo copy number variation in Japanese autism subjects (2012)
  • 学会等名: the 20th World Congress of Psychiatric Genetics
  • 発表場所: Hamburg, Germany
• [学会発表] ENHANCED EXPRESSION OF TRANSCRIPTION FACTOR SPI IN POSTMORTEM BRAIN TISSUES AND ALTERED REGULATION OF SEVERAL AUTISM CANDIDATE GENES (2011)
  • 著者名/発表者名: Thanseem ismail
  • 学会等名: WCPG 2011(世界精神遺伝学会議）
  • 発表場所: Omni Shoreham Hotel（米国）
• [学会発表] Rare de novo copy number variation in Japanese autism subjects
  • 著者名/発表者名: Thanseem I
  • 学会等名: 8th Hamamatsu Medical Science symposium
  • 発表場所: Hamamatsu, Japan
• [学会発表] De novo copy number variation in Japanese autism subjects
  • 著者名/発表者名: Thanseem I
  • 学会等名: 20th World Congress of Psychiatric Genetics
  • 発表場所: Hamburg, Germany