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次世代シークエンサーによるグリオーマLOH領域の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 23791608
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 脳神経外科学
研究機関九州大学

研究代表者

秦 暢宏  九州大学, 大学病院, 助教 (10596034)

研究期間 (年度) 2011 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2012年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2011年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
キーワード脳腫瘍 / 神経膠腫 / next-generation sequencing / LOH / IDH1 / IDH2 / glioma / glioblastoma / cancer stem cell / micro RNA / genome sequencer / chromosome 10 / 1p/19q LOH
研究概要

摘出脳腫瘍標本における遺伝子変異解析:九州大学脳神経外科手術症例のうち、神経膠腫162例に対して、capillary sequencerを用いてIDH1/2変異解析および1p,19q 10, 17p のLOH解析を行い、臨床像や予後との関連を検討した。IDH1に変異を認めるprimary glioblastomaは特異的な臨床像を呈することが判明し、またgrade IIIのoligodendroglial tumorにおいては、IDH変異と1p/19q LOHの結果から臨床経過が明確に異なる3つのタイプに分類できることを示した。次世代シークエンサーを用いた脳腫瘍幹細胞における網羅的遺伝子変異解析:九州大学脳神経外科における摘出腫瘍から確立した、神経膠芽腫の腫瘍幹細胞株4例を対象に、TruSeq_Amplicon_Cancer_Panelを用いてアンプリコンPCRを行いillumina miSeq にてシークエンスを実施し、CLC Genomics WorkBenchを用いてマッピングおよび変異解析を行った

報告書

(3件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (13件)

  • [雑誌論文] Molecular biomarkers of glioblastoma: current targets and clinical implications2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto K, Mizoguchi M, Hata N, et. al.
    • 雑誌名

      Current Biomarker Findings

      巻: 2 ページ: 63-76

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Associations between microRNA expression and mesenchymal marker gene expression in glioblastoma.2012

    • 著者名/発表者名
      Ma X, Yoshimoto K, Guan Y, Hata N, Mizoguchi M, et. al.
    • 雑誌名

      Neuro Oncol.

      巻: 14 ページ: 1153-1162

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular characteristics of glioblastoma with 1p/19q co-deletion2012

    • 著者名/発表者名
      Mizoguchi M, Yoshimoto K, Ma X, Guan Y, Hata N, et. al.
    • 雑誌名

      Brain Tumor Pathol.

      巻: 29 ページ: 148-153

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 高齢者に対するテモダール放射線同期療法の治療成績2013

    • 学会等名
      第26回日本老年脳神経外科学会
    • 発表場所
      東京ステーションコンファレンス(東京)
    • 年月日
      2013-03-01
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Long-term outcome of patients with oligodendroglial tumors treated up-front2013

    • 学会等名
      PAV therapy Joint Neurosurgical Convention 2013
    • 発表場所
      Hawaii Wailkoloa Village (Hawaii)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Long-term outcome of patients with oligodendroglial tumors treated up-front with PAV therapy2013

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      Joint Neurosurgical Convention 2013
    • 発表場所
      Hawaii Wailkoloa Village (Hawaii)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] IDH1 /2変異解析簡便化の試み2012

    • 学会等名
      第30回日本脳腫瘍学会学術集会
    • 発表場所
      グランドプリンスホテル広島(広島)
    • 年月日
      2012-11-26
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] テモダール時代において、PAV 療法はOligodendroglial tumorに対する有用な選択肢となり得るか?2012

    • 学会等名
      日本脳神経外科学会第71回学術総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪)
    • 年月日
      2012-10-17
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] HRM法によるIDH1 mutation解析2012

    • 学会等名
      第30回日本脳腫瘍病理学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • 年月日
      2012-05-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ダイレクトシークエンス法によるIDH1 mutation解析:グリオーマ126例での検討2011

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第29回日本脳腫瘍病理学会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] grade II, IIIグリオーマの遺伝子解析と治療成績:IDH1 mutationは予後因子か?2011

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第70回日本脳神経外科学会総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] IDH mutant primary GBMの臨床像2011

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第29回日本脳腫瘍学会
    • 発表場所
      下呂温泉水明館(岐阜)
    • 関連する報告書
      2011 実施状況報告書
  • [学会発表] HRM法によるIDH1 mutation解析

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第30回日本脳腫瘍病理学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] テモダール時代において、PAV療法はOligodendroglial tumorに対する有用な選択肢となり得るか?

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      日本脳神経外科学会第71回学術総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] IDH1 /2変異解析簡便化の試み

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第30回日本脳腫瘍学会学術集会
    • 発表場所
      グランドプリンスホテル広島(広島)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 高齢者に対するテモダール放射線同期療法の治療成績

    • 著者名/発表者名
      秦 暢宏
    • 学会等名
      第26回日本老年脳神経外科学会
    • 発表場所
      東京ステーションコンファレンス(東京)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2011-08-05   更新日: 2019-07-29  

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