立体構造情報に基づいた白血病原因蛋白質に結合する新規RNAアプタマーの創製

• 研究課題/領域番号: 23870026
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京理科大学
• 研究代表者: 野村 祐介 東京理科大学, 理学部・応用化学科, 助教 (10609308)
• 研究期間 (年度): 2011 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2011年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: RNA アプタマー / 立体構造 / RNAアプタマー / AML / SELEX / 白血病原因タンパク質 / 核酸-蛋白質相互作用

研究概要

本研究では AML1 に対する RNA アプタマーの立体構造の情報を基に,RNA アプタマーを設計し,Runt への親和性の向上を目指した.
1.融合型 RNA アプタマーの Apt14 において,Runt へ高い親和性を示すことが明らかとなった.
2.Apt14 変異体と Runt の相互作用解析から,内部ループと末端のステム構造が重要であることが示唆された.

研究成果

• [雑誌論文] The Runt domain of AML1 (RUNX1) binds a sequence-conserved RNA motif that mimics a DNA element (2013)
  • 著者名/発表者名: Jun-ichi Fukunaga*, Yusuke Nomura*, Yoichiro Tanaka*, Taku Tanaka, Yoshikazu Nakamura, Gota Kawai, Taiichi Sakamoto, and Tomoko Kozu
  • 雑誌名: RNA 巻: 19 ページ: 927-936
  • 査読あり
• [学会発表] NMR analysis of the interaction between AML1 Runt domain and RNA aptamer (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryo Amano, Yusuke Nomura, Takashi Nagata, Jun-ichi Fukunaga, Yoichiro Tanaka, Masato Katahira, Yoshikazu Nakamura, Tomoko Kozu and Taiichi Sakamoto
  • 学会等名: 2012 ICMRBS
  • 発表場所: Lyon France
• [学会発表] AML1 Runt domain に結合する RNA アプタマーの改良 (2012)
  • 著者名/発表者名: 野村祐介,山崎 香,福永淳一,田中陽一郎,中村義一,神津知子,坂本泰一,鳥越秀峰
  • 学会等名: 第14回 RNA ミーティング
  • 発表場所: 東北大学百周年記念会館川内萩ホール
• [学会発表] RNA アプタマーと AML1 Runt domain の相互作用解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 天野亮,野村祐介,永田崇,福永淳一,田中陽一郎,片平正人,中村義一,神津知子,坂本泰一
  • 学会等名: 第14回 RNA ミーティング
  • 発表場所: 東北大学百周年記念会館川内萩ホール
• [学会発表] RNAアプタマーとAML1 Runt domainの相互作用解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 天野亮，野村祐介，永田崇，福永淳一，田中陽一郎， 片平正人，中村義一，神津知子，坂本泰一
  • 学会等名: 第14回RNAミーティング
  • 発表場所: 東北大学
• [学会発表] AML1 Runt domainに結合するRNAアプタマーの改良 (2012)
  • 著者名/発表者名: 野村祐介，山崎 香，福永淳一，田中陽一郎，中村義一， 神津知子，坂本泰一，鳥越秀峰
  • 学会等名: 第14回RNAミーティング
  • 発表場所: 東北大学
• [学会発表] 転写因子 AML1 の DNA 結合ドメインに結合する RNA モチーフの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 福永淳一,野村祐介,中村義一,坂本泰一,神津知子
  • 学会等名: CREST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」研究領域シンポジウム
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス
• [学会発表] RNA アプタマーの立体構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 坂本泰一,野村祐介
  • 学会等名: CREST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」研究領域シンポジウム
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス
• [学会発表] RNAアプタマーの立体構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 坂本泰一、野村祐介
  • 学会等名: CREST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」研究領域シンポジウム
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス
• [学会発表] 転写因子AML1のDNA結合ドメインに結合するRNAモチーフの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 福永淳一, 野村祐介, 他3名
  • 学会等名: CREST「生命現象の解明と応用に資する新しい計測・分析基盤技術」研究領域シンポジウム
  • 発表場所: 東京ガーデンパレス