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タンパク質ヒスチジンメチル化を介した恒常性維持の役割と分子機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23H00321
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分38:農芸化学およびその関連分野
研究機関筑波大学

研究代表者

深水 昭吉  筑波大学, 生存ダイナミクス研究センター, 教授 (60199172)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
47,450千円 (直接経費: 36,500千円、間接経費: 10,950千円)
2025年度: 14,950千円 (直接経費: 11,500千円、間接経費: 3,450千円)
2024年度: 14,040千円 (直接経費: 10,800千円、間接経費: 3,240千円)
2023年度: 18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
キーワードタンパク質メチル化 / ヒスチジン残基メチル化 / アルギニン残基メチル化 / リジン残基メチル化 / ヒスチジンメチル化 / アルギニンメチル化 / ヒストンメチル化
研究開始時の研究の概要

血中のメチルヒスチジン(His)は、乳牛の分娩後の栄養状態のバイオマーカーとして、また、ヒトを含め、筋タンパク質代謝を反映する指標とされてきた。しかし、Hisメチル化を触媒する哺乳類のメチル化酵素の同定や、その機能の理解は進んでいない。申請者らは、酵母のHisメチル化酵素Hpm1の哺乳類オルソログと推定されるMETTL18がHisメチル化活性を持つことを見出している。さらに、そのノックアウト(KO)マウスの作製にも成功し、その表現型からMETTL18が広範な生理機能を持つことが示唆される。そこで本研究では、タンパク質Hisメチル化酵素が生体の恒常性維持に果たす役割とその作用機序の解明を目指す。

研究実績の概要

血中のメチルヒスチジン(His)は、乳牛の分娩後の栄養状態のバイオマーカーとして、また、ヒトを含め、筋タンパク質代謝を反映する指標とされてきた。しかし、メチルHisの生成を触媒する哺乳類のメチル化酵素の同定や、その機能の理解は進んでいない。そこで本研究では、タンパク質Hisメチル化酵素が生体の恒常性維持に果たす役割とその作用機序の解明を目的とした。

今年度は、主にヒスチジンメチル化されるタンパク質の同定に取り組み、以下の成果を挙げた。
1) マウスの骨格筋および脳組織を用いて、生化学的手法によるタンパク質の分画と分析化学的手法を組み合わせた解析から、ヒスチジン残基がメチル化修飾される新たな基質として、解糖系酵素エノラーゼのサブユニットであるγ-enolaseを同定した。また、3種類の異なるアミノ酸配列を持つエノラーゼ(α、β、γ)のうち、脳神経系特異的に発現するγ-enolaseの190番目のヒスチジン残基がメチル化されることを明らかにした(J. Biochem. PMID: 37279646, 2023)。

2) これまで確認されていなかったヒストンの翻訳後修飾として、ヒスチジン残基のメチル化を見出した。 ヒストンは、H2A、H2B、H3、H4という4種類のコアヒストンタンパク質が二つずつ集まった8量体で構成されているが、このうちヒスチジンメチル化は、ヒストンH2Aの82番目とH3の39番目のヒスチジン残基に生じていた。ヒストンのメチル化修飾のほとんどはリジン残基に集中していることから、ヒスチジン残基のメチル化は限られた特定の遺伝子領域に存在するヒストンに起こることが示唆された(J. Biol. Chem. PMID: 37543365, 2023)。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

タンパク質のヒスチジン残基のメチル化修飾は、リジン残基とアルギニン残基に続く第3のメチル化修飾として近年注目されている。しかし、その酵素化学的解析や生物学的意義の解明に不可欠である触媒酵素やその基質の報告例が、第1・第2のメチル化修飾に比べて非常に少なく、研究の進展を遅らせている大きな要因となっている。新たなヒスチジンメチル化基質であるγ-enolaseの発見は、解糖系におけるヒスチジンメチル化の重要性の理解や、新規ヒスチジンメチル化酵素の探索のための有用な手掛かりとなることが期待される。また、ヒストンには多くのリジン残基があり、メチル化に加え、ユビキチン化やアセチル化などの多様な翻訳後修飾が生じることが知られている。その組み合わせパターンはヒストンコードと呼ばれ、転写調節を指令する暗号と考えられており、今回のヒスチジン残基のメチル化修飾の発見は、新しいヒストンコードとなる新たな一歩になると期待される。以上の理由から、当初の計画以上に進展していると判断する。

今後の研究の推進方策

2024年度は、作製済みのヒスチジンメチル化酵素遺伝子のノックアウトマウスの解析結果を論文化するとともに、新しいヒスチジンメチル化タンパク質の同定を目指す。

報告書

(2件)
  • 2023 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (20件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Cardiorenal damages in mice at early phase after intervention induced by angiotensin II, nephrectomy, and salt intake2024

    • 著者名/発表者名
      Muromachi Naoto、Ishida Junji、Noguchi Kazuyuki、Akiyama Tomoki、Maruhashi Syunsuke、Motomura Kaori、Usui Joichi、Yamagata Kunihiro、Fukamizu Akiyoshi
    • 雑誌名

      Experimental Animals

      巻: 73 号: 1 ページ: 11-19

    • DOI

      10.1538/expanim.23-0071

    • ISSN
      0007-5124, 1341-1357, 1881-7122
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Histidine Nτ-methylation identified as a new posttranslational modification in histone H2A at His-82 and H3 at His-392023

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Takahiro、Daitoku Hiroaki、Uetake Toru、Kako Koichiro、Fukamizu Akiyoshi
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 299 号: 9 ページ: 105131-105131

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2023.105131

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] γ-enolase (ENO2) is methylated at the <i>N</i>τ position of His-190 among enolase isozymes2023

    • 著者名/発表者名
      Kasai Fumiya、Kako Koichiro、Maruhashi Syunsuke、Uetake Toru、Yao Yuan、Daitoku Hiroaki、Fukamizu Akiyoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 174 号: 3 ページ: 279-289

    • DOI

      10.1093/jb/mvad042

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Themis2 regulates natural killer cell memory function and formation2023

    • 著者名/発表者名
      Nabekura Tsukasa、Deborah Elfira Amalia、Tahara Saeko、Arai Yuya、Love Paul E.、Kako Koichiro、Fukamizu Akiyoshi、Muratani Masafumi、Shibuya Akira
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 7200-7200

    • DOI

      10.1038/s41467-023-42578-8

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ヒスチジンNτ-メチル化修飾の新規基質γ-enolaseの同定2023

    • 著者名/発表者名
      笠井 郁也; 加香 孝一郎; 丸橋 春介; 大徳 浩照; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 質量分析による哺乳類ヒストンのヒスチジンメチル化修飾の同定2023

    • 著者名/発表者名
      林 岳宏; 大徳 浩照; 加香 孝一郎; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 理論と実験から読み解く人・マウスPRMT1のーアミノ酸の相違性2023

    • 著者名/発表者名
      姚 遠; 加香 孝一郎; 本村 香織; 金 俊達; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 心筋細胞特異的PRMT1遺伝子欠損マウスの心臓におけるグルタチオン増加の原因探索2023

    • 著者名/発表者名
      松田 紘奈; 加香 孝一郎; 笠井 郁也; 丸橋 春介; 本村 香織; 大徳 浩照; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 心腎関連モデルマウスの初期心腎障害の病理学的解析2023

    • 著者名/発表者名
      室町 直人; 石田 純治; 野口 和之; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 線虫の精子形成におけるPRMT-9の機能とアルギニンモノメチル化制御機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      平野 寛大; 田島 達也; 大徳 浩照; 加香 孝一郎; 張 文瑜; 鈴木 茉菜芽; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 生化学的手法による線虫(C.elegans) の精子形成滑石化因子の同定2023

    • 著者名/発表者名
      田島 達也; 加香 孝一郎; 大徳 浩照; 福島 希; 福澤 航介; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ヒスチジンメチル化酵素METTL9は糖鎖修飾を受けて細胞化に分泌される2023

    • 著者名/発表者名
      池田 音緒; 大徳 浩照; 関口 直希; 加香 孝一郎; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 心筋細胞での選択的スプライシングに関与するタンパク質アルギニンメチル化酵素PRMT1の新規基質の探索2023

    • 著者名/発表者名
      笠井 郁也; 松田 紘奈; 加香 孝一郎; 大徳 浩照; 深水 昭吉
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 心腎連関モデルマウスの初期病態へのヒスタミンH3アゴニストの作用2023

    • 著者名/発表者名
      室町直人; 石田純治; 野口和之; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 線虫(C. elegans)における精子形成関連因子の同定2023

    • 著者名/発表者名
      田島達也; 加香孝一郎; 大徳浩照; 福島希; 福澤航介; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 解糖系酵素エノラーゼのヒスチジンメチル化と活性評価2023

    • 著者名/発表者名
      笠井郁也; 加香孝一郎; 丸橋春介; 大徳浩照; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] マウス血漿中遊離メチルアルギニンおよびシトルリンの定量分析法の確立2023

    • 著者名/発表者名
      丸橋春介; 加香孝一郎; 松田紘奈; 笠井郁也; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ヒスチジンメチル化酵素METTL9における糖鎖修飾と細胞外分泌の役割2023

    • 著者名/発表者名
      池田音緒; 大徳浩照; 関口直希; 加香孝一郎; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ウシ胸腺ヒストンのヒスチジンメチル化修飾の解析2023

    • 著者名/発表者名
      林岳宏; 大徳浩照; 加香孝一郎; 深水昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] アルギニンモノメチル化酵素PRMT-9による線虫の精子形成制御機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      平野寛大; 田島達也; 大徳浩照; 加香孝一郎; 張文瑜; 鈴木茉菜芽; 深水 昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質アルギニンメチル基転移酵素PRMT1の心臓における役割の解明2023

    • 著者名/発表者名
      松田紘奈; 加香孝一郎; 笠井郁也; 丸橋春介; 本村香織; 大徳浩照; 深水 昭吉
    • 学会等名
      2023年度日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] The molecular and neural regulation of ultraviolet light phototaxis and its food-associated learning behavioral plasticity in C. elegans2023

    • 著者名/発表者名
      Ozawa Kazuki; Shinkai Yoichi; Kako Koichiro; Fukamizu, Akiyoshi;Doi, Motomichi
    • 学会等名
      24th International C.elegans Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Emerging impacts of protein methylation on biological functions2023

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi FUKAMIZU
    • 学会等名
      Wednesday Lecture Series, Stowers Institute of Medical Research, USA
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Emerging impacts of post-translational modification of protein methylation upon arginine and histidine residues2023

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi FUKAMIZU
    • 学会等名
      8th Meeting of the Asian Forum for Chromosome and Chromatin Biology, India
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 深水研究室(ゲノム情報生物学)

    • URL

      http://akif2.tara.tsukuba.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2025-04-17  

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