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通し回遊魚の河川沿岸域利用実態の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23H00329
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
審査区分 中区分39:生産環境農学およびその関連分野
研究機関北海道大学

研究代表者

荒木 仁志  北海道大学, 農学研究院, 教授 (20707129)

研究分担者 峰岸 有紀  東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (80793588)
仲岡 雅裕  北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (90260520)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
46,800千円 (直接経費: 36,000千円、間接経費: 10,800千円)
2025年度: 11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2024年度: 11,050千円 (直接経費: 8,500千円、間接経費: 2,550千円)
2023年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円)
キーワード環境DNA / 時空間分布 / 通し回遊魚
研究開始時の研究の概要

本研究では、サケに代表される通し回遊魚について河川・沿岸域の利用実態を最新の環境DNA技術を用いて包括的に明らかにする。これら通し回遊魚は日本人にとって欠かせない資源であり、地域文化的にも重要な魚だが、近年その数は減少傾向にある。また、海と川を行き来する通し回遊魚は生態系間の物質循環の役割を担っており、淡水・陸域の生態系維持にも欠かせない生物である。そこで本研究では、最新の生態学研究技術の一つである環境DNA技術を用い、「野生動物としての通し回遊魚」に着目した長期・広域研究を行うことで、通し回遊魚がどのように河川・沿岸域を利用し、今後どのように変化していくのかを明らかにする。

研究実績の概要

本年度は通し回遊魚の代表的魚種であるサケ(Oncorhynchus keta)の遡上・再生産する主要河川の一つである千歳川およびその支流(内別川、漁川)、千歳川と同じく石狩川水系に属する豊平川において年間を通した定期調査を行い、計10地点から約300サンプルを収集した。これらサンプルの一部はDNA抽出後、半定量環境DNAメタバーコーディング解析に供し、サケの季節的河川利用をはじめ、これら河川に生息するアメマス、ウグイ属等の回遊魚やハナカジカ、フクドジョウ等の純淡水魚の時空間分布に関する情報も得られつつある。このうちフクドジョウについては以前収集していた環境DNAサンプルを基に系統地理解析を実施し、道内のフクドジョウに2つの由来の大きく異なる系統群が存在していることを明らかにした。この結果は生態学のトップジャーナルであるMolecular Ecologyにオンライン掲載されている。またこれらのサンプルからは外来種ブラウントラウトのDNAも検出されており、サケ稚魚のふ化・浮上・降河パターンとこれを捕食する本外来種の時空間移動に関する種間相互作用の行動学的解析も実施可能であることが明らかになってきた。
本年度はこのほか、研究分担者・協力者の補助を得つつ道北・道東・道南地方のサケマス遡上河川およびその沿岸、石狩川中流域の支流、北陸から山陰地方に至る日本海側のサケ遡上河川についてもサケの遡上が見込まれる秋や稚魚の降河が見込まれる春を中心に採水調査を実施した。これらサンプルは一部DNA抽出を完了しており、今後これを解析に供することで、全国規模でのサケマス遡上分布解明のための基盤情報が得られるものと期待される。またこれらの河川の一部には太平洋サケ属の魚だけでなく同じくサケ科に属しながら淡水依存性の強い絶滅危惧種イトウも生息しており、保全生物学的応用も視野に入れた解析を実施予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

2023年度は研究代表者(荒木)がサバティカル研修期間にあったため、4か月にわたり国内に本研究課題の代表者が不在の状況が生じたものの、事前の入念な打ち合わせやサバティカル期間中のオンラインでの打ち合わせにより、研究分担者・協力者による野外調査は予定通りに実施され、当初予定していた北海道内および日本海側のサケ遡上河川におけるサンプリングは全て実施できた。そのサンプルからのメタバーコーディング解析についても研究代表者の研究室助教である研究協力者(坂田)や本研究費で雇用した実験補助員(井上)の協力により年間を通して継続でき、良好な分析結果が得られつつある。

今後の研究の推進方策

野外調査については今年度も昨年度同様の頻度で継続し、生物分布、特に回遊魚分布・移動の季節変化だけでなく経変変化も検証できるデータの収集を目指す。更に調査地点として昨年度カバー出来なかった本州太平洋側河川を加え、サケの国内遡上河川の網羅的観測を実現する。また、これらサンプルの解析結果としての生物量定量性を向上するため、実験時に添加する内部標準(濃度既知の人工DNA)のプロトコル改良を行い、サケやその他回遊魚を含む多魚種同時生物量推定のための技術開発を実施する。

報告書

(2件)
  • 2023 審査結果の所見   実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 4件、 招待講演 3件)

  • [国際共同研究] McGill University(カナダ)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Environmental DNA unveils deep phylogeographic structure of a freshwater fish2024

    • 著者名/発表者名
      Yatsuyanagi Tetsu、Kanbe Takashi、Fujii Kazuya、Inoue Shouko、Araki Hitoshi
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: published online 号: 9

    • DOI

      10.1111/mec.17337

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 河川~海洋生態系でのヨコエビ類群集構造の変化:環境要因と生物地理の効果2024

    • 著者名/発表者名
      関岡寛知、仲岡雅裕
    • 学会等名
      日本生態学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNAで視る北海道の自然2023

    • 著者名/発表者名
      荒木仁志
    • 学会等名
      北海道大学哺乳類交流セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Environmental DNA for species distributions, migrations, and beyond2023

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Araki
    • 学会等名
      McGill CEEB seminar
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] eDNA-based biodiversity monitoring2023

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Araki
    • 学会等名
      GEOBON International Conference
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Environmental DNA: Beyond Species Identifications2023

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Araki
    • 学会等名
      University of Montreal Seminar
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Seasonal variation of fish fauna in Otsuchi Bay by environmental DNA metabarcoding analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Teruya M., Minegishi Y
    • 学会等名
      The eDNA Society International Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 環境DNA技術の可能性:水産業の観点から2023

    • 著者名/発表者名
      峰岸有紀
    • 学会等名
      日本水産学会理事会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2025-06-20  

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