| 研究課題/領域番号 |
23K03344
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
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| 研究機関 | 大阪公立大学 |
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研究代表者 |
森次 圭 大阪公立大学, 大学院理学研究科, 教授 (80599506)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2025年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2023年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
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| キーワード | アクチン / フィラメント形成 / 分子シミュレーション / MSES法 / 重み付きアンサンブル法 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
アクチンの筋収縮や細胞運動といった機能は、原子レベルでのダイナミックなフィラメント形成が担っている。本研究では、構造探索法(MSES法)や重み付きアンサンブル法といった計算手法を駆使し、アクチンの構造変化とフィラメントへの結合/解離過程が共役した過程をシミュレートする。ATP結合アクチンがフィラメントに重合するパス(G型からF型への構造変化→フラグミン結合)とADP結合アクチンがフィラメントから脱離するパス(フラグミン解離→F型からG型への構造変化)に沿った自由エネルギー地形を比較し、ヌクレオチドに依存したフィラメント形成の不可逆性とその構造起因を明らかにする。
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