• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

生体・環境・地質試料に汎用可能な包括的分子骨格組成解析による分子化石研究の新展開

研究課題

研究課題/領域番号 23K03558
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分17050:地球生命科学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

中村 英人  北海道大学, 理学研究院, 助教 (00785123)

研究分担者 朝比奈 健太  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 地質調査総合センター, 研究員 (40728276)
安藤 卓人  秋田大学, 国際資源学研究科, 助教 (30852165)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード分子化石 / バイオマーカー / テルペノイド / 続成変化 / 化学分類
研究開始時の研究の概要

分子化石は生物進化や古環境の証拠となるが、生体環境試料と地質試料を結びつける共通の解析方法がないことが新規分子化石の探索や古環境指標の較正の足かせとなっている。本研究では、複雑に修飾された生体テルペノイドを地質試料中の分子化石の存在形態である基本炭素骨格へと高効率に変換し、その組成を明らかにする手法「炭素骨格プロファイリング」を開発する。さらに、同手法が現生種や未熟成な環境・地質試料を用いた分子化石研究の新たな推進方法として有効かどうかを実証形式で確かめることで、近現世と大過去の分子化石記録の連結を目指す。

研究実績の概要

2023年度は研究実施内容は (I) 有機化学反応プロセスの開発、(II) 現生種や植生情報が既知の試料における検証のための試料採取と予備分析、(III) リファレンス環境・地質試料の選定と予備分析に大別され、主な成果は次の通りである。

(I) モデル化合物を用いた反応プロセスの検証に着手した。トリテルペノイドのモデル化合物として、オレアナン型骨格に環内不飽和結合と複数の含酸素置換基(ヒドロキシ基、カルボキシ基)を有するオレアノール酸を選定し、ヒドリド還元、ハロゲン化、不均一触媒による飽和化/脱ハロゲン化など複数の反応ステップによるトリテルペノイド炭化水素の生成に部分的に成功した。ただし、想定外の骨格変換や一部反応段階における低収率など、現生種・環境試料への適用に先立ち解決すべき課題も浮き彫りになった。
(II) 文献調査、データベースの活用により、化合物組成が特有な分類群や、分子化石研究上の要請の高い分類群(基部被子植物、小葉類等)の天然物化学分野の文献調査を行い、炭素骨格レベルでの化学分類学的データを整理した。小葉類、モクレン類、針葉樹類の生体試料を採取し、一部試料について粗抽出物の代謝産物解析を行った。同定された代謝産物の組成は、想定された化学分類学的特性と概ね調和的であったが、未同定ピークを含む多様な誘導体が存在するため骨格組成の定量的比較には課題が残る。
(III) 有機物の起源や熟成度の異なるリファレンス試料とするため、地質試料・環境試料の採取と分子化石組成の記載を行った。北海道、岩手県、福井県において、中生代から新生代の植物化石(ソテツ類、被子植物、針葉樹類)、樹脂化石(琥珀・コーパル)、石炭(褐炭、瀝青炭)、完新世の土壌や植物遺体試料を採取して分析に供した。得られた化学分類学的成果の一部は国内外の学会で報告した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

有機化学反応プロセス開発に想定以上に時間を要している。モデル化合物の炭化水素化には一部成功したが、想定外の骨格変換や一部反応段階における低収率などの問題も浮き彫りとなった。生体・環境試料への適用はプロセスの改善を待って行う必要があるため、今年度中の着手には至らなかった。一方、生体試料や環境・地質試料の代謝産物組成や分子化石組成の解析は順調であり、植物化石由来の新規分子化石候補化合物の発見や、裸子植物樹脂中の分子化石組成の特徴と熱熟成に伴う構造変化の特徴の解明などの進展があった。

今後の研究の推進方策

炭素骨格プロファイリングの要となる、骨格構造の特徴を保持した炭化水素化反応プロセスの開発を重点的に進める。オレアノール酸以外のモデル化合物も併用して、骨格変換を抑制する反応条件や順序を検討し、反応プロセスを確立する。
生体・環境・地質試料の採集・解析も継続し、炭素骨格プロファイリングの検討に用いる基準試料を用意する。これには、選定された生物種や環境・地質試料から抽出された、前処理の有無や精製度の異なる抽出物や精製画分が含まれる。一部確保済みの藻類試料と湖沼・堆積物試料についても追加の確保・サンプリングと、代謝産物・分子化石組成の解析に着手する。
モデル化合物での反応プロセスが一定レベルに到達次第、炭素骨格プロファイリングの実試料への適用に着手する。代表種の炭素骨格プロファイルを従来方式による代謝産物解析結果と比較し、新手法の特徴や精度を評価する。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 6件)

  • [雑誌論文] Large igneous province activity drives oceanic anoxic event 2 environmental change across eastern Asia2024

    • 著者名/発表者名
      Takashima R., Selby D., Yamanaka T., Kuwahara Y., Nakamura H., Sawada K., Ikeda M. A., Ando T., Hayashi K., Nishida M., Usami T., Kameyama D.. Nishi H., Kuroyanagi A., Gyawali B. R.
    • 雑誌名

      Communications Earth & Environment

      巻: 5 号: 1 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1038/s43247-024-01214-z

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Aliphatic hydrocarbons in the lichen class Lecanoromycetes and their potential use as chemotaxonomic indicators and biomarkers2023

    • 著者名/発表者名
      Ikeda Masashi A.、Nakamura Hideto、Sawada Ken
    • 雑誌名

      Organic Geochemistry

      巻: 179 ページ: 104588-104588

    • DOI

      10.1016/j.orggeochem.2023.104588

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] DNA metabarcoding focusing on the plankton community: an effective approach to reconstruct the paleo-environment2023

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Yasuhide、Ogiso-Tanaka Eri、Seto Koji、Ando Takuto、Katsuki Kota、Saito Yoshiki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1 ページ: 21642-21642

    • DOI

      10.1038/s41598-023-48367-z

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 下部白亜系手取層群北谷層北谷恐竜化石発掘現場の蛇行河川堆積物中有機物に記録された堆積環境の多様性2023

    • 著者名/発表者名
      矢野滉紀,中村英人,湯川弘一,安藤卓人
    • 学会等名
      日本地質学会第130年学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 北海道むかわ町の蝦夷層群函淵層産絶滅ソテツ類化石のバイオマーカー分析による分子化石の探索2023

    • 著者名/発表者名
      固本悠杜,中村英人,沢田健
    • 学会等名
      日本地質学会第130年学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 北海道および北米カリフォルニアにおける白亜紀海洋無酸素事変層準堆積岩のバイオマーカー分析:古植生変動の復元と比較2023

    • 著者名/発表者名
      池田雅志,沢田健,安藤卓人,中村英人,高嶋礼詩,西弘嗣
    • 学会等名
      日本地質学会第130年学術大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Variations in terpenoid composition in Japanese amber extracts: diagenesis and chemotaxonomy2023

    • 著者名/発表者名
      Hideto Nakamura,Aya Kubota,Yasuhiro Iba,Hiroki Yano,Masashi A. Ikeda,Takuto Ando
    • 学会等名
      Water-Rock Interaction WRI-17/Applied Isotope Geochemistry AIG-14
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigation of fossilization processes of tree fossils by pyrolysis and thermochemolysis.2023

    • 著者名/発表者名
      Ken Sawada,Jinya Nakamura,Masashi A. Ikeda,Hideto Nakamura,Minoru Tsukagoshi
    • 学会等名
      Water-Rock Interaction WRI-17/Applied Isotope Geochemistry AIG-14
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Climate, vegetation and oceanographic change in the eastern margin of Asia during Oceanic Anoxic Event 2 driven by pulsed Large Igneous Province activity2023

    • 著者名/発表者名
      Reishi Takashima,David Selby,Toshiro Yamanaka,Yoshihiro Kuwahara,Hideto Nakamura,Ken Sawada,Masashi A. Ikeda,Takuto Ando,Keiichi Hayashi,Hiroshi Nishi,Azumi Kuroyanagi,Babu Ram Gyawali
    • 学会等名
      2nd Asian Palaeontological Congress (APC2)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Terrestrial and marine molecular fossil fingerprints of the Yezo Group record the Late Cretaceous paleoenvironmental evolution in the NW Pacific Margin.2023

    • 著者名/発表者名
      Hideto Nakamura,Takuto Ando,Masashi A. Ikeda,Ken Sawada,Reishi Takashima,Hiroshi Nishi
    • 学会等名
      2nd Asian Palaeontological Congress (APC2)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Reconstruction of the Early Cretaceous terrestrial paleoenvironment by biomarker analysis of the fluvial sediments of the Kitadani Dinosaur Quarry, Central Japan.2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Yano,Hideto Nakamura,Hirokazu Yukawa,Takuto Ando
    • 学会等名
      2nd Asian Palaeontological Congress (APC2)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 手取層群北谷層の芳香族炭化水素組成に記録された前期白亜紀の陸上生態系における火災活動2023

    • 著者名/発表者名
      矢野滉紀,中村英人,湯川弘一
    • 学会等名
      日本地球惑星連合大会2023年大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会

URL: 

公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi