データベースとAIの組み合わせによる古細菌新規膜タンパク質複合体の機能解析

• 研究課題/領域番号: 23K05663
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分43020:構造生物化学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 福田 善之 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特任講師 (60571099)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2025年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: テルモプラズマ・アシドフィルム / 膜タンパク質 / クライオ電子線トモグラフィー / Alphafold2 / String

研究開始時の研究の概要

生命において、様々な機能を担うタンパク質の多くは複合体を形成し、その複合体の構造状態が動的に変化することで協調的に目的の機能を果たしていると考えられています。したがって、生理的環境下にあるタンパク質複合体の動的構造変化を解明することで、その機能の解明につながり、生命現象の理解に重要な知見をもたらすことが期待されます。本研究では、in situビジュアルプロテオミクスとタンパク質データベース、そしてAIによる構造予測法を組み合わせて、タンパク質複合体のサブユニット解析法を開発し、古細菌テルモプラズマ・アシドフィルム細胞膜上の新規鳥かご型構造体を対象とした構造－機能相関の解明を試みます。