| 研究課題/領域番号 |
23K05713
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43040:生物物理学関連
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| 研究機関 | 金沢大学 |
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研究代表者 |
NGO XUANKIEN 金沢大学, ナノ生命科学研究所, 特任助教 (60778190)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
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| キーワード | ABC transporter / MsbA / LptC / HS-AFM / E. coli / FRET / LptB2FG / High-speed AFM |
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| 研究開始時の研究の概要 |
The applicant will unveil how ATP binding and hydrolysis in the NBDs of MsbA allosterically regulate conformational transitions in the TMDs and elucidate how MsbA, LptC, and LptB2FG synergistically work together for extracting and transporting lipid A/LPS from Inner Membrane toward Outer Membrane.
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| 研究実績の概要 |
1)Successfully prepared 2D crystal structures of MsbA within lipid membranes containing both with and without Kdo2 lipid A; 2) Achieved high spatial and temporal imaging of both NBD and TMD sides of MsbA embedded in these lipid membranes; 3) Developed new methods for the automatic analysis of AFM data; 4) completed the construction of plasmids and transfected E. coli cells with the target plasmids aimed for FRET measurements.
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
I am potentially investigating a novel pathway for the gate operation of Lipopolysaccharide (LPS) induced by ABC transporters MsbA and LptC in E. coli.
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| 今後の研究の推進方策 |
In FY2024, my planned research agenda includes the following tasks: 1)Finalize the data analyses of AFM data; 2) Develop a protein-membrane model suitable for Molecular Dynamics simulation and/or Coarse-Grained simulation; 3) Investigate the interaction of MsbA with target protein in E. coli using FRET techniques; 4) Draft the manuscript detailing the findings.
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