ギャップ（挿入/欠失）の進化情報を含めた系統樹作成手法

• 研究課題/領域番号: 23K05880
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分45020:進化生物学関連
• 研究機関: 東京理科大学
• 研究代表者: 佐藤 圭子 東京理科大学, 創域理工学部情報計算科学科, 准教授 (30366439)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2023年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
• キーワード: 分子系統樹

研究開始時の研究の概要

本研究では、進化の過程で起きた変化、つまり、置換、挿入、欠失の観点から進化モデルを考え、変化の多様性を捉えることができる情報論的尺度を配列間の進化的な関わりを推定するのに取り入れることで、あらゆる生物研究において礎となる進化の過程に沿った系統樹を作成する手法を確立すること目的とする。さらに、申請者が公開しているWebアプリケーションの系統解析ツール（P*R*O*P）にて、その手法による系統推定を提供する。