研究課題/領域番号 |
23K05941
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分45040:生態学および環境学関連
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研究機関 | 龍谷大学 |
研究代表者 |
山中 裕樹 龍谷大学, 先端理工学部, 准教授 (60455227)
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研究分担者 |
源 利文 神戸大学, 人間発達環境学研究科, 教授 (50450656)
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研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2024年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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キーワード | 環境DNA / メタバーコーディング / アーティファクト |
研究開始時の研究の概要 |
環境DNAメタバーコーディングは生物多様性情報の取得に利用されるようになっているが、種の構成比率の情報をどれほど正確に反映したデータを得られているのかについては情報の蓄積が少ない。本研究ではレアな配列まで高感度に検出できるライブラリー調整手法の開発を行うと同時に、DNA試料中での種間のDNA量比をライブラリー調整中に変化させないPCR手法の開発を行う。これが達成できれば、シーケンシングで得られる種間のリード数の比へのバイアスも抑えられ、既存の手法よりも種間のDNAの量比をより正確に保存したデータを得られるようになる。
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