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実験と計算科学の融合による任意の標的ガングリオシドに選択的な人工レクチンの開発

研究課題

研究課題/領域番号 23K06190
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47050:環境および天然医薬資源学関連
研究機関長崎国際大学

研究代表者

藤井 佑樹  長崎国際大学, 薬学部, 准教授 (80610063)

研究分担者 小関 準  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域 細胞分子工学研究部門, 主任研究員 (20616669)
大関 泰裕  横浜市立大学, 理学部, 教授 (70275022)
鎌田 健一  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 共同研究員 (80936568)
J・R・H Tame  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (00336588)
川嵜 達也  長崎国際大学, 薬学部, 講師 (70722073)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2026年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2024年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワード人工レクチン / ガングリオシド / シアル酸 / β-トレフォイル型 / ムール貝
研究開始時の研究の概要

申請者はガングリオシド糖脂質への結合を介すがん細胞の増殖抑制効果を解明した。本研究はで本レクチンを用いて、その骨格を計算科学で設計し直し、種々の構造を有すガングリオシド糖鎖と結合できる人工レクチンの開発に取り組む。ガングリオシドを発現する培養細胞に投与し、理論通りに糖鎖と結合して、抗がん作用を起こすかを実験的に解析する。本研究で任意のガングリオシド構造に結合する人工レクチンの設計法が開発する。

研究実績の概要

私たちはこれまでにがん糖鎖Gb3に結合する天然レクチンを改変した人工レクチン、ミツバ-1の作製に成功している。レクチンの糖鎖結合能を保持しつつ、タンパク質の構造安定性の向上を目的に8000種類のβ-トレフォイル構造を計算科学で比較することで対称性に優れたタンパク骨格を見出すことに成功した。ミツバ-1はそれを骨格とすることで、糖鎖結合能を保持しつつ、室温でも長期保存が可能となった。本研究ではタンパク質の安定性の向上に加え、糖鎖結合能を改変する技術を確立することを目的として研究を計画した。
ミツバ-1を出発物質として、計算科学と分子軌道計算により、シアル酸に結合する新規人工レクチンを数種類デザインした。そのうち、人工レクチンCC-5 はシアル酸との相互作用が最も安定であることが計算科学により、推測された。これはCC-5の糖鎖認識部位にトリプトファンやヒスチジンを導入することで、シアル酸の相互作用を安定させていることが考えられる。CC-5の配列を挿入したプラスミドベクターを作製し形質転換を行うと、目的タンパク質CC-5は大腸菌1L培養あたり、1 mgのタンパク質発現に成功した。
精製CC-5を蛍光標識し、50種類の糖鎖が固定されたチップに加え、糖鎖結合能を解析した。その結果、ガラクトース結合能を消失したものの、シアル酸への結合は見られなかった。これは設計したCC-5は糖鎖の末端にあるシアル酸ではなく、単糖のシアル酸を認識していることが推察される。設計したレクチンはシアル酸含有糖鎖を認識しなかったものの、立体構造を保持しつつ、ある程度のタンパク量を発現することが可能な系の確立には至った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

設多くのβ-トレフォイル構造は二量体を形成し安定性を保っている。しかし、β-トレフォイル型タンパク質を単量体化すると不溶化が度々起こることが知られる。設計したCC-5は単量体のβ-トレフォイル型タンパク質でありながら、立体構造を保持しながら、十分量のタンパク質発現を行うことが出来た。同時に当該年度、検討されたタンパク質発現条件は今後の人工レクチンの開発に役立てることができる。

今後の研究の推進方策

今後、分子動力学法と量子化学法を用いて、新たにシアル酸含有糖鎖を認識する人工レクチンの設計を行っていく。目的の糖鎖に結合する人工レクチンをより高い可能性で得られるように昨年度より、多い複数の配列をデザインし発現に取り組んでいくと共に安定してmgレベルのタンパク質を得られるような発現系を確立していく。設計・発現の進行度が順調である場合は分子ドッキング法によりSiaα2-3やSiaα2-6を識別できる人工レクチンも開発していくことも検討する。発現した人工レクチンが設計通りの立体構造を保持しているかを、X線結晶構造解析、円偏光二色性(CD)スペクトルにより解析していく。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 4件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] ラジシャヒ大学(バングラデシュ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] チッタゴン大学(バングラデシュ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] トリエステ大学(イタリア)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Physicochemical properties and antimicrobial activities of MytiLec-1, a member from the mytilectin family of mussels2023

    • 著者名/発表者名
      Hossain Md. Mikail、Rajia Sultana、Ohkawa Mayuka、Yoshimoto Suzuna、Fujii Yuki、Kawsar Sarkar M.A.、Ozeki Yasuhiro、Hasan Imtiaj
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 253 ページ: 127628-127628

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2023.127628

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Taxonomic Distribution and Molecular Evolution of Mytilectins2023

    • 著者名/発表者名
      Gerdol Marco、Nerelli Daniela Eugenia、Martelossi Nicola、Ogawa Yukiko、Fujii Yuki、Pallavicini Alberto、Ozeki Yasuhiro
    • 雑誌名

      Marine Drugs

      巻: 21 号: 12 ページ: 614-614

    • DOI

      10.3390/md21120614

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Antibiofilm Activity of Lectins from Plants and Marine Invertebrates: A Comparative Study2023

    • 著者名/発表者名
      Imtiaj Hasan, A. K. M. Asaduzzaman, Sultana Rajia, Yuki Fujii, S. M. A. Kawsar, Yasuhiro Ozeki
    • 雑誌名

      Trends in carbohydrate research

      巻: 15 ページ: 56-61

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] β-Trefoil Lectins of the Family Mytilidae from a Comparative Perspective2023

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kamata Mayuka Ohkawa Yuki Fujii Yukiko Ogawa Sultana Rajia Suzuna Yoshimoto Imtiaj Hasan S.M. Abe Kawsar Ryuya Ishiwata Shun Takakusaki Ryuhei Hayashi Daisuke Adachi Takashi Hayashi Masao Yamada Bishnu Pada Chatterjee Yasuhiro Ozeki
    • 雑誌名

      Trends in carbohydrate research

      巻: 15 ページ: 47-55

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] イガイ科に由来するβ-トレフォイル型レクチンの構造と機能の比較2024

    • 著者名/発表者名
      藤原 滉生, 平嶋 聖, 野田 恭平, 藤田 英明, ジェルドール マルコ, 大関 泰裕,藤井 佑樹
    • 学会等名
      日本薬学会 第144年会(横浜)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] カイメンレクチンの構造、糖鎖結合と培養細胞への影響2024

    • 著者名/発表者名
      野田 恭平、平嶋 聖、藤原 滉生、ジェルドール マルコ、林 龍平、大関 泰裕、藤田 英明、藤井 佑樹
    • 学会等名
      日本薬学会 第144年会(横浜)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Discovery of the first R-type lectin from Mytilidae (sea mussels) and its cellular function2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Fujii, Jun Koseki, Kenichi Kamata, Marco Gerdol, Hijiri Hirashima, Kyohei Noda, Kosei Fujihara, Ryuhei Hayashi, Ryuya Ishiwata, Suzuna Yoshimoto, Mayuka Ohkawa, Masamitsu Konno, Masao Yamada, Yukiko Ogawa, Hideaki Fujita, Jeremy Tame, Yasuhiro Ozeki
    • 学会等名
      Glyco26(2023, Taipei, Taiwan)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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