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酵素化学知見に基づく耐性細菌の出現抑制を目指したβラクタマーゼ阻害薬合剤の最適化

研究課題

研究課題/領域番号 23K06267
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分47060:医療薬学関連
研究機関藤田医科大学

研究代表者

河合 聡人  藤田医科大学, 医学部, 講師 (20435150)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード抗菌薬耐性 / β-ラクタマーゼ / 酵素速度論解析 / 分子動力学計算 / X線結晶構造解析 / 薬剤耐性細菌 / β-ラクタム薬 / β-ラクタマーゼ阻害薬
研究開始時の研究の概要

β-ラクタム薬とβ-ラクタマーゼ阻害薬の合剤(BL/BLI合剤)は感染症治療成績を格段に向上させた。しかし、BL/BLI合剤の耐性細菌は存在し、変異型β-ラクタマーゼの関与が散見される。申請者は、BL/BLI合剤の組み合わせについて、分解性や阻害強度など基質としての性質が似ている薬を組み合わせると耐性菌の発現を抑え治療できるのではないか?と考えた。そこで、本研究では変異型クラスC β-ラクタマーゼについて、各種抗菌薬に対する酵素学的、構造生物学的な解析により薬剤耐性機序を原子レベルで解明し、最適なβ-ラクタム薬とβ-ラクタマーゼ阻害薬の組み合わせを打ち出し、実際の耐性細菌でその効果を検証する。

研究実績の概要

薬剤耐性病原性細菌による感染症治療において、β-ラクタム薬とβ-ラクタマーゼ阻害薬の合剤(BL/BLI合剤)はその治療成績を格段に向上させた。しかし、BL/BLI合剤にも耐性を示す細菌は存在し、変異型β-ラクタマーゼの関与が散見される。申請者は、β-ラクタム薬とβ-ラクタマーゼ阻害薬の両者を基質とするβ-ラクタマーゼに対し、分解性や阻害強度など基質としての性質が似ている薬同士を組み合わせれば、耐性細菌の発生率を抑制できるのではないか?と考えた。この仮説の検証のため、まずはCeftazidime/Avibactam合剤の耐性に関与する変異型クラスC β-ラクタマーゼについて、各種抗菌薬に対する酵素学的、分子動力学計算を含む構造生物学的な解析により薬剤耐性機序を4次元の原子レベルで解明する。
本年度はプラスミド性クラスC β-ラクタマーゼCMY-2の4アミノ酸変異体(A114E、Q120K、V211S、N346Y)のCMY-185の酵素速度論解析、分子動力学計算を主に研究を進めた。結果、N346YによりAvibactamの結合を阻害し、A114EとQ120KがN346YのAvibactam結合阻害活性を増強することが明らかになった。また、V211SはCeftazidime分解におけるkcat値を向上させ分解効率を向上させることがわかった。また、X線結晶構造解析で解明していたY346残基の構造変化に加えて、分子動力学計算の結果によりY346以外の置換されたアミノ酸はそれぞれ水素結合または塩橋の分子内相互作用を新たに形成することで酵素表現型を示すことが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

CMY-185の分子メカニズムを原子レベルで解明することができ、論文として発表することまでできたため。

今後の研究の推進方策

別途進めている他のβ-ラクタマーゼに関して、CMY-185と同様にX線結晶構造解析、酵素速度論解析、分子動力学計算を進める。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] テキサス大学MD Andersonがんセンター/ピッツバーグ大学医学部(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Structural insights into the molecular mechanism of high-level ceftazidime?avibactam resistance conferred by CMY-1852024

    • 著者名/発表者名
      Kawai Akito、Shropshire William C.、Suzuki Masahiro、Borjan Jovan、Aitken Samuel L.、Bachman William C.、McElheny Christi L.、Bhatti Micah M.、Shields Ryan K.、Shelburne Samuel A.、Doi Yohei
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 15 号: 2

    • DOI

      10.1128/mbio.02874-23

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High-level ceftazidime/avibactam resistance in<i>Escherichia coli</i>conferred by the novel plasmid-mediated β-lactamase CMY-185 variant2023

    • 著者名/発表者名
      Shropshire William C、Endres Bradley T、Borjan Jovan、Aitken Samuel L、Bachman William C、McElheny Christi L、Wu Chin-Ting、Egge Stephanie L、Khan Ayesha、Miller William R、Bhatti Micah M、Saharasbhojane Pranoti、Kawai Akito、Shields Ryan K、Shelburne Samuel A、Doi Yohei
    • 雑誌名

      Journal of Antimicrobial Chemotherapy

      巻: 78 号: 10 ページ: 2442-2450

    • DOI

      10.1093/jac/dkad249

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] N346Y変異型AmpC β-ラクタマーゼの基質特異性変化の分子構造基盤2024

    • 著者名/発表者名
      河合聡人、土井洋平
    • 学会等名
      日本薬学会第144年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] CMY-185によるセフタジジムーアビバクタム高度耐性化機構の検討2023

    • 著者名/発表者名
      河合聡人、土井洋平
    • 学会等名
      第52回薬剤耐性菌研究会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] セフタジジム-アビバクタム合剤治療中に単離された大腸菌が有したβ-ラクタマーゼの構造生物学研究2023

    • 著者名/発表者名
      河合聡人、土井洋平
    • 学会等名
      フジタEXPO2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 研究室ホームページ

    • URL

      https://www.fujita-hu.ac.jp/~microb/

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] プレスリリース

    • URL

      https://www.fujita-hu.ac.jp/news/j93sdv000000q98z.html

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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