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ミトコンドリア-ER接触場(MAM)の光顕-電顕相関観察による構造的多様性解析

研究課題

研究課題/領域番号 23K06329
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分48010:解剖学関連
研究機関久留米大学

研究代表者

太田 啓介  久留米大学, 医学部, 教授 (00258401)

研究分担者 伴 匡人  久留米大学, 分子生命科学研究所, 准教授 (00579667)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2025年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2024年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2023年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
キーワードMAM / ミトコンドリア / オルガネラ間接触 / CLEM / コンタクトサイト
研究開始時の研究の概要

細胞内ではミトコンドリアと小胞体が頻繁に接触している。近年この接触場に様々な分子が集まり、代謝障害など病気にも関係することが指摘されている。現在この接触場を光学顕微鏡で可視化する方法がいくつも開発され、これにより細胞機能との関連が評価されている。しかし、光学顕微鏡で捉えた機能的な接触場が、はたして電子顕微鏡レベルでどのような姿なのかは十分評価されていない。我々はこれまでに、光学顕微鏡で観察した場所そのものを同じ試料上で電子顕微鏡観察し、三次元的に比較検討できる3D-CLEMという新しい技術を開発してきた。本研究は、この技術を使い光学顕微鏡的に検出される接触場の本当の姿を明らかにするものである。

研究実績の概要

ミトコンドリア小胞体接触領域(Mitochondria-associated membrane; MAM)は、ミトコンドリア外膜上にシグナル分子が集積する特異な膜ドメインとして、生理学的機能や疾患との関連から注目されている。これまで、光学顕微鏡レベルでMAMを検出・解析するために、split-GFP、NanoBiT、近接ライゲーションアッセイ(PLA)など複数のレポーターが開発されてきたが、これらが電子顕微鏡(EM)レベルでどのような構造と相関するかは明らかでない。本研究では、三次元光学-電子相関顕微鏡(3D-CLEM)を用いて、これらのレポーターで観察されたMAMが、電子顕微鏡的にどのような構造に対応するのかを同一試料上で解析し、MAMの構造的多様性と機能的意義との関連を明らかにすることを目的とした。
今年度は、上述の3種のレポーターによるMAM検出の再評価を行い、その一部について3D-in resin CLEMによる構造解析を実施した。特に、MAM研究で広く用いられるPLA法では、IP3RとVDAC間の近接を検出することでMAMの可視化が可能とされている。HeLa細胞およびMEF細胞を用いて既報に準じた条件で実施した結果、同様の蛍光シグナルを確認したが、同一試料を用いた3D-CLEM観察では、MAM構造が存在しない領域にも多数の近接シグナルが検出されることが明らかとなった。
この結果は、MAM検出に用いられるレポーターの中には、使用法や解釈に注意を要するものがあることを示唆しており、今後の解析にはEMとの相関観察が不可欠であることを示している。

現在までの達成度
現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

本課題における中核技術であるArray Tomographyを用いた三次元相関顕微鏡(3D-CLEM)については、実際の生物試料を用いた解析により、構造評価が可能な画像データを得ることができ、その一部は学会報告を行った。これにより、本手法が本研究対象に対して有効に機能することを確認できた。
一方、免疫組織化学的CLEMを用いたMAMの可視化については、検討した抗体の一部のラベリング結果が期待されるMAM構造を十分に反映していない可能性が示唆されており、これらの結果を踏まえて、今後は抗体等の再検討・改善を行う予定である。
3DデータのAI解析については、ステップワイズ学習法を基盤とした画像分類モデルの構築を行い、条件の異なる画像群に対しても同一の識別モデルにより比較検討が可能となる運用手順を確立した。現在、本モデルを用いた解析が実際に稼働しており、今後の構造評価の効率化・標準化に資することが期待される。
以上の点を踏まえ、現時点では各技術項目において概ね順調に進捗していると判断している。引き続き、得られた結果に基づいた手法の最適化と実証を進め、MAM構造の多様性と機能的意義に関する包括的理解の構築を目指す。

今後の研究の推進方策

現在、免疫組織化学的検出およびPLA(Proximity Ligation Assay)によるMAM検出については、より精密な位置情報の取得が可能なin-resin CLEM法を適用し、新たに導入した色素を用いたプロトコールで実証を進めている。一部のレポーター系(例:split-GFP等)では、これらの新規色素との併用が技術的に困難であるため、従来法を用いた解析を継続する方針である。
免疫組織化学的検出法については、これまでの検証において、明らかにMAM構造とは一致しないシグナル分布が観察されるケースが確認されており、これらについてはCLEM解析を行わず、有望なレポーターのみを選択的に対象として詳細な解析を進める予定である。
今年度前半までに各検出法に基づく画像データの取得と初期解析を完了させることを目標とし、後半にかけて得られた知見をもとに学会発表および論文作成へと進める計画である。これに向けて、現在各手法の再現性・信頼性の検証および必要な条件検討を含めて進めている。

報告書

(2件)
  • 2024 実施状況報告書
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2025 2024 2023

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (16件) (うち招待講演 9件)

  • [雑誌論文] Ro5-4864, a translocator protein ligand, regulates T cell-mediated inflammatory responses in skin2025

    • 著者名/発表者名
      Sendai Y, Takeda K, Ohta K, Nakae S, Koshika K, Kitamura K, Higuchi M, Ichinohe T, Azuma T, Okumura K, Ohno T.
    • 雑誌名

      Int Immunol

      巻: 37 号: 4 ページ: 221-234

    • DOI

      10.1093/intimm/dxae065

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mitochondrial damage and ER stress in CB1 receptor antagonist-induced apoptosis in human neuroblastoma SH-SY5Y cells2025

    • 著者名/発表者名
      Mori Kazuaki、Togo Akinobu、Yamashita Kota、Sakuragi Shigeo、Bannai Hiroko、Umezawa Taishi、Ohta Keisuke、Asahi Toru、Nozaki Chihiro、Kataoka Kosuke
    • 雑誌名

      Neuropharmacology

      巻: 273 ページ: 110440-110440

    • DOI

      10.1016/j.neuropharm.2025.110440

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondria?giant lipid droplet proximity and autophagy suppression in nitrogen-depleted oleaginous yeast <i>Lipomyces starkeyi</i> cells2024

    • 著者名/発表者名
      Duan Lan、Togou Akinobu、Ohta Keisuke、Okamoto Koji
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 177 号: 1 ページ: 15-25

    • DOI

      10.1093/jb/mvae069

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Excess microtubule and F-actin formation mediates shortening and loss of primary cilia in response to a hyperosmotic milieu2024

    • 著者名/発表者名
      Otani Hiroshi、Nakazato Ryota、Koike Kanae、Ohta Keisuke、Ikegami Koji
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 137 号: 16

    • DOI

      10.1242/jcs.261988

    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Three‐dimensional ultrastructural and anatomical analysis of prostatic neuroendocrine cells in mice2024

    • 著者名/発表者名
      Uemura Kei‐Ichiro、Togo Akinobu、Hiroshige Tasuku、Ohta Keisuke、Ueda Kosuke、Nishihara Kiyoaki、Nakiri Makoto、Hirashima Shingo、Igawa Tsukasa、Nakamura Kei‐Ichiro
    • 雑誌名

      The Prostate

      巻: 84 号: 9 ページ: 866-876

    • DOI

      10.1002/pros.24705

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 補助治具を用いたSEM観察用準超薄連続切片の作製手法2023

    • 著者名/発表者名
      若崎 眞由美、武田-神谷 紀子、佐藤 繭子、太田 啓介、豊岡 公徳
    • 雑誌名

      顕微鏡

      巻: 58 号: 3 ページ: 123-127

    • DOI

      10.11410/kenbikyo.58.3_123

    • ISSN
      1349-0958, 2434-2386
    • 年月日
      2023-12-30
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Three-Dimensional Ultrastructural and Volume Analysis of the Redundant Nuclear Envelope of Developing and Matured Sperm in Mice2023

    • 著者名/発表者名
      Uemura Kei-ichiro、Miyazono Yoshihiro、Hiroshige Tasuku、Ohta Keisuke、Ueda Kosuke、Nishihara Kiyoaki、Nakiri Makoto、Hirashima Shingo、Igawa Tsukasa、Nakamura Kei-ichiro
    • 雑誌名

      Microscopy and Microanalysis

      巻: 29 号: 2 ページ: 832-840

    • DOI

      10.1093/micmic/ozad003

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensional architecture and assembly mechanism of the egg-shaped shell in testate amoeba Paulinella micropora2023

    • 著者名/発表者名
      Nomura Mami、Ohta Keisuke、Nishigami Yukinori、Nakayama Takuro、Nakamura Kei-Ichiro、Tadakuma Kenjiro、Galipon Josephine
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 11 ページ: 1232685-1232685

    • DOI

      10.3389/fcell.2023.1232685

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Behavioral and neurological effects of Vrk1 deficiency in zebrafish2023

    • 著者名/発表者名
      Carrasco Apolinario Magdeline E.、Umeda Ryohei、Teranishi Hitoshi、Shan Mengting、Phurpa、Sebastian Wulan Apridita、Lai Shaohong、Shimizu Nobuyuki、Shiraishi Hiroshi、Shikano Kenshiro、Hikida Takatoshi、Hanada Toshikatsu、Ohta Keisuke、Hanada Reiko
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 675 ページ: 10-18

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.07.005

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Organ Level Wide Field Correlative Light and Electron Microscopy2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      ミトコンドリアサイエンスワークショップ 2024
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] 近接ライゲーションアッセイを利用した小胞体ミトコンドリア接触領域 (MAM)検出シグナルの光-電子相関顕微鏡法(CLEM)観察2024

    • 著者名/発表者名
      鈴木将史,太田啓介
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会九州支部学術講演会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアのダイナミクスをvEMで解析する2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      第23回日本ミトコンドリア学会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Volume EM特にアレイトモグラフィー法の実際とCLEM観察への展開2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      医学生物学電子顕微鏡技術学会第40回学術講演会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] CLEM 観察アップグレード:SEM を用いた最新ワークフロー2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会67回シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光学顕微鏡と電子顕微鏡を横断する先端的相関観察法2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      第65回日本組織細胞化学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アレイトモグラフィー2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      顕微鏡サマースクール2024
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Volume EMで観てはじめてわかる皮膚のメソスケール2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      第49回日本香粧品学会
    • 関連する報告書
      2024 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 考える細胞 考える組織2024

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      第18回久留米大学高次脳疾患研究所市民公開講座, 久留米
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エチレングリコール誘導腎障害モデルにおける近位尿細管の微細変化12023

    • 著者名/発表者名
      糸山貴子, 都合亜記暢, 船津貴志, 太田啓介
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第79回学術講演会, 島根
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 試料包埋用樹脂の電子線ダメージによる変形2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介, 都合亜記暢
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会 2023年度 第1回ソフトマテリアル分科会講演会, 東京
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 樹脂包埋生物試料SEM組織像観察のかんどころ2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      SCANTECH2023、東京
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エチレングリコール誘導腎障害における近位尿細管ミトコンドリアの三次元的形態変化2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      トコンドリア・サイエンス・ワークショップ2023, 長崎
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 電子顕微鏡画像のAIセグメンテーションモデルのトレーニング実践2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      第55 回日本臨床分子形態学会学術集会, 福岡
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 止めない600枚連続超薄切片作製TIPS2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      電子顕微鏡学会多次元相関顕微鏡第一回研究会, 和光
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ディープラーニングセグメンテーションのための適切なステップワイズトレーニングと転移学習2023

    • 著者名/発表者名
      太田啓介
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第65回九州支部学術講演会, 北九州
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2025-12-26  

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