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Artificial Intelligence analysis of the immune-checkpoint and immuno-oncology in B-cell non-Hodgkin lymphoma

研究課題

研究課題/領域番号 23K06454
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分49020:人体病理学関連
研究機関東海大学

研究代表者

カレーラス ジュアキム  東海大学, 医学部, 講師 (90637191)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードlymphoma / targeted sequencing / immuno-oncology / immune microenvironment / immune checkpoint / molecular pathology / hematological neoplasia / NGS / リンパ腫 / 免疫腫瘍学 / 人工知能 / 免疫チェックポイント / 次世代シーケンシング
研究開始時の研究の概要

この研究では、集学的アプローチを使用してリンパ腫の免疫チェックポイントを分析しています。B細胞性リンパ腫の解析を行います。重要なマーカーは、PD-L1、CSF1R、IL-10 などです。免疫組織化学、遺伝子発現解析、コピー数・LOH解析、次世代標的変異解析などを実施します。解析には、従来のバイオインフォマティクスだけでなく、人工知能(機械学習、ニューラルネットワーク)なども含まれます。

研究実績の概要

BCL6-rearrangement (BCL6-R) is associated with a favorable prognosis of follicular lymphoma (FL), but the mechanism is unknown. We analyzed the clinicopathological, immune microenvironment (immune checkpoint, immuno-oncology markers), and mutational profiles of 10 BCL6-R-positive FL, and 19 BCL6-R-positive diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) cases (both BCL2-R and MYC-R negative). A custom-made panel included 168 genes related to aggressive B-cell lymphomas and FL. Both BCL6-R-positive FL and BCL6-R-positive DLBCL had a common mutational profile; but also, differences. DLBCL cases had a higher density of microenvironment markers.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

The project is progressing well, and as expected.

今後の研究の推進方策

We will continue the evaluation of immuno-oncology markers in larger series of cases and plan next set of NGS analysis.

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 7件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 1件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Mutational, immune microenvironment, and clinicopathological profiles of diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma with BCL6 rearrangement2024

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim、Ikoma Haruka、Kikuti Yara Yukie、Miyaoka Masashi、Hiraiwa Shinichiro、Tomita Sakura、Kondo Yusuke、Ito Atsushi、Nagase Shunsuke、Miura Hisanobu、Kawada Hiroshi、Roncador Giovanna、Campo Elias、Hamoudi Rifat、Nakamura Naoya
    • 雑誌名

      Virchows Archiv

      巻: 484 号: 4 ページ: 657-676

    • DOI

      10.1007/s00428-024-03774-z

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Artificial Intelligence, Lymphoid Neoplasms, and Prediction of MYC, BCL2, and BCL6 Gene Expression Using a Pan-Cancer Panel in Diffuse Large B-Cell Lymphoma2024

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim、Nakamura Naoya
    • 雑誌名

      Hemato

      巻: 5 号: 2 ページ: 119-143

    • DOI

      10.3390/hemato5020011

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Artificial Intelligence Analysis and Reverse Engineering of Molecular Subtypes of Diffuse Large B-Cell Lymphoma Using Gene Expression Data2024

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim、Yukie Kikuti Yara、Miyaoka Masashi、Miyahara Saya、Roncador Giovanna、Hamoudi Rifat、Nakamura Naoya
    • 雑誌名

      BioMedInformatics

      巻: 4 号: 1 ページ: 295-320

    • DOI

      10.3390/biomedinformatics4010017

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Tumor heterogeneity and immune-evasive T follicular cell lymphoma phenotypes at single-cell resolution2023

    • 著者名/発表者名
      Suma Sakurako、Suehara Yasuhito、Fujisawa Manabu、Abe Yoshiaki、Hattori Keiichiro、Sakata-Yanagimoto Mamiko
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 38 号: 2 ページ: 340-350

    • DOI

      10.1038/s41375-023-02093-7

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hepatic niche leads to aggressive natural killer cell leukemia proliferation through transferrin-transferrin receptor 1 axis2023

    • 著者名/発表者名
      Kameda Kazuaki, Yanagiya Ryo, Miyatake Yuji, etal. and Kotani Ai
    • 雑誌名

      Blood Journal

      巻: 142(4) ページ: 352-364

    • DOI

      10.1182/blood.2022018597

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mutational Profile and Pathological Features of a Case of Interleukin-10 and RGS1-Positive Spindle Cell Variant Diffuse Large B-Cell Lymphoma2023

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim、Kikuti Yara Yukie、Miyaoka Masashi、Hiraiwa Shinichiro、Tomita Sakura、Ikoma Haruka、Kondo Yusuke、Ito Atsushi、Nagase Shunsuke、Miura Hisanobu、Roncador Giovanna、Colomo Lluis、Hamoudi Rifat、Campo Elias、Nakamura Naoya
    • 雑誌名

      Hematology Reports

      巻: 15 号: 1 ページ: 188-200

    • DOI

      10.3390/hematolrep15010020

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The pathobiology of follicular lymphoma2023

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim
    • 雑誌名

      Journal of Clinical and Experimental Hematopathology

      巻: 63 号: 3 ページ: 152-163

    • DOI

      10.3960/jslrt.23014

    • ISSN
      1346-4280, 1880-9952
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] My research life in Japan2024

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim
    • 学会等名
      第113回日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Gene expression and mutational profile of PD-L1 positive diffuse large B-cel l lymphoma2024

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim
    • 学会等名
      第113回日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] High Expression of Caspase-8 Associated with Improved Survival in Diffuse Large B-Cell Lymphoma2023

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim
    • 学会等名
      第112回日本病理学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] P-44. High PD-L1 expression correlated with poor prognosis of diffuse large B-cell lymphoma2023

    • 著者名/発表者名
      Carreras Joaquim
    • 学会等名
      第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] P-66. Surface CD3陰性Monomorphic epitheliotropic intestinal T-cell lymphoma 3例の遺伝子変異解析2023

    • 著者名/発表者名
      冨田さくら, Joaquim Carreras, 菊池イアーラ幸江, 堂本英治, Edoardo Missiaglia, Justine Bouilly, Andrey Leourneau, Laurence de Leval
    • 学会等名
      第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] P-68. Nodal marginal zone lymphomaの遺伝子発現解析2023

    • 著者名/発表者名
      生駒悠, Carreras Joaquim, 菊池イアーラ幸江, 中村直哉
    • 学会等名
      第63回日本リンパ網内系学会学術集会・総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] Research Activities of Joaquim Carreras

    • URL

      http://carreras.med.u-tokai.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] ORCID

    • URL

      https://orcid.org/0000-0002-6129-8299

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] Researchgate of Joaquim Carreras

    • URL

      https://www.researchgate.net/profile/Joaquim-Carreras

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] Loop Joaquim Carreras

    • URL

      https://loop.frontiersin.org/people/956781/publications

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] Scilit Joaquim Carreras

    • URL

      https://www.scilit.net/scholars/9538763

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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