研究課題/領域番号 |
23K06709
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
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研究機関 | 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室) |
研究代表者 |
土岐 典子 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 血液内科, 部長 (80762054)
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研究分担者 |
貞任 大地 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 臨床検査科, 臨床研究支援員(ゲノム情報解析) (20868773)
大保木 啓介 公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医学研究センター, 副参事研究員 (80415108)
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研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2025年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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キーワード | 染色体異常 / コピー数中立ヘテロ接合性喪失 |
研究開始時の研究の概要 |
造血器を含む腫瘍において、コピー数中立ヘテロ接合性喪失(CN-LOH: copy-neutral loss-of-heterozygosity)の検出を中心に研究する。染色体異常は細胞遺伝学的方法や蛍光プローブ等によって検出されるが、これらではCN-LOHのように2倍体でありながら片親性のアリルを2つ有する染色体変化を捉えることができない。現在、CN-LOH検出に染色体マイクロアレイ技術が研究として利用されているが、保険診療下の検査としては先天疾患に限られる。本研究では、近年臨床へ導入の進む次世代シークエンス(NGS)によって得られるデータから、CN-LOHを検出するアルゴリズムを確立する。
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