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難治性神経芽腫の分子データベースの構築と小児がん個別化医療への応用

研究課題

研究課題/領域番号 23K07239
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分52050:胎児医学および小児成育学関連
研究機関地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所)

研究代表者

大平 美紀  地方独立行政法人埼玉県立病院機構埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 主幹 (20311384)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード神経芽腫
研究開始時の研究の概要

本研究では国内の神経芽腫組織バンクを解析対象に、網羅的ゲノム・エピゲノムデータ(全ゲノム/全エクソームシークエンス、RNA-seq、ゲノムコピー数、遺伝子発現、メチローム)と臨床情報をメタオミックス解析し、分子的背景の異なる腫瘍サブグループの洗い出しと特徴的なマーカーの抽出、グループ毎の治療標的の同定と解析を行う。日本小児がん研究グループが行う臨床試験の登録例と、再発例を含む難治性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析を行い、テロメア/クロマチン維持機構異常や各種ゲノムマーカーの検証を通して、次世代のがんゲノム医療に向けた日本人神経芽腫分子データベースの作製と分子診断システムの構築を行う。

研究実績の概要

小児の代表的な固形腫瘍である神経芽腫(年間発症約150例)は、しばしば自然退縮がみられる予後良好なタイプがある一方で、全症例の約半数を占める4期症例の生存率は未だ40%程度と非常に難治性である。本研究では、このような多様な臨床像を示す神経芽腫サブセットの分子背景を複数のオミックスデータから明らかにし、それぞれについて最適な治療戦略をたてることを目的とする。特に、最近の研究から明らかになってきたテロメア維持機構の異常が関わるサブタイプについては、難治性腫瘍群の半数以上を占めることがわかってきたが、関与する遺伝子群や悪性化機構について未だ不明な部分も多いため、これらの腫瘍群を中心に解析を進める。これまでに全エクソーム解析を行った神経芽腫187例について、テロメア維持機構異常の有無を検索した。Alternative Lengthening of Telomere (ALT)陽性群の抽出はC-circleアッセイ法を用いた。これまでに52例のALT陽性群が見出され、さらに解析を進行中である。従来の報告の通り、ALT陽性群はすべてMYCN非増幅例であった。今後は初発時検体ー再発時検体ペアの解析を加え、臨床予後情報、病理診断情報、遺伝子変異プロファイルと比較し、ALT陽性例の分子的特徴を抽出する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画通り、全エクソーム解析を行った187例の高ステージ神経芽腫のC-circleアッセイをほぼ完了した。

今後の研究の推進方策

次年度は初発時検体ー再発時検体ペアの解析を加え、臨床予後情報、病理診断情報、遺伝子変異プロファイルと比較し、ALT陽性例の分子的特徴を抽出する。テロメア維持機構異常プロファイルにATRX, DAXXなどALT関連遺伝子の変異情報を追加する。これらの情報を、遺伝子発現プロファイルと共にクラスタリングし比較検討することにより、腫瘍サブタイプに関連するプロファイルを抽出する。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] A nationwide phase II study of delayed local treatment for children with high‐risk neuroblastoma: The Japan Children's Cancer Group Neuroblastoma Committee Trial JN‐H‐112024

    • 著者名/発表者名
      Yoneda Akihiro、Shichino Hiroyuki、Hishiki Tomoro、Matsumoto Kimikazu、Ohira Miki、Kamijo Takehiko、他14名
    • 雑誌名

      Pediatric Blood Cancer

      巻: 71 号: 6

    • DOI

      10.1002/pbc.30976

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Pediatric Precision Medicine at the National Cancer Center Japan: Prospective Genomic Study of Pediatric Patients with Cancer as Part of the TOP-GEAR Project2023

    • 著者名/発表者名
      Tao Kayoko、Ohira Miki、他19名
    • 雑誌名

      JCO Precision Oncology

      巻: 7 号: 7

    • DOI

      10.1200/po.22.00266

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ATM depletion induces proteasomal degradation of FANCD2 and sensitizes neuroblastoma cells to PARP inhibitors2023

    • 著者名/発表者名
      Parvin Sultana、Akter Jesmin、Takenobu Hisanori、Katai Yutaka、Satoh Shunpei、Okada Ryu、Haruta Masayuki、Mukae Kyosuke、Wada Tomoko、Ohira Miki、Ando Kiyohiro、Kamijo Takehiko
    • 雑誌名

      BMC Cancer

      巻: 23 号: 1 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1186/s12885-023-10772-y

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Development of an osteosarcoma model with <i>MYCN</i> amplification and <i>TP53</i> mutation in hiPS cell‐derived neural crest cells2023

    • 著者名/発表者名
      Mukae Kyosuke、Takenobu Hisanori、Endo Yuki、Haruta Masayuki、Shi Tianyuan、Satoh Shunpei、Ohira Miki、Funato Michinori、Toguchida Junya、Osafune Kenji、Nakahata Tatsutoshi、Kanda Hiroaki、Kamijo Takehiko
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: - 号: 5 ページ: 1898-1911

    • DOI

      10.1111/cas.15730

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] JCCG-JNBSG登録神経芽腫605例の後方視的リスクマーカー解析とINRGデータベース登録2023

    • 著者名/発表者名
      大平美紀、中村洋子、瀧本哲也、他11名
    • 学会等名
      第162回小児血液腫瘍免疫懇話会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Genome analysis of 95 cases registered in JCCG-JNBSG JN-H-11 and JN-H-07 clinical studies for high-risk neuroblastoma2023

    • 著者名/発表者名
      大平美紀、春田雅之、菅原基樹、上條岳彦、他13名
    • 学会等名
      Advances in Neuroblastoma Research 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Retrospective analysis of INRG clinical and genomic markers for 605 neuroblastomas in Japan: A report from JCCG-JNBSG2023

    • 著者名/発表者名
      大平美紀、上條岳彦 他11名
    • 学会等名
      Advances in Neuroblastoma Research 2023
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Comparative epigenomics by machine learning approach for neuroblastoma2023

    • 著者名/発表者名
      杉野隆一、大平美紀、萬斎清香、上條岳彦
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 再発神経芽腫のゲノムコピー数解析2023

    • 著者名/発表者名
      大平美紀、春田雅之、上條岳彦 他12名
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] JCCG-JNBSG神経芽腫過去登録例の初回治療後または再発/増悪時検体と初発時検体のゲノムコピー数解析2023

    • 著者名/発表者名
      大平美紀、春田雅之、上條岳彦 他7名
    • 学会等名
      第65回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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