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遺伝子プロファイルとctDNAに基づくサブタイプ別膵癌精密医療実装のための探索的研究

研究課題

研究課題/領域番号 23K08158
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55020:消化器外科学関連
研究機関札幌医科大学

研究代表者

木村 康利  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (80311893)

研究分担者 今村 将史  札幌医科大学, 医学部, 講師 (00404608)
竹政 伊知朗  札幌医科大学, 医学部, 教授 (50379252)
村上 武志  札幌医科大学, 医学部, 研究員 (50619830)
久木田 和晴  札幌医科大学, 医学部, 助教 (60563484)
及能 大輔  札幌医科大学, 医学部, 助教 (70563485)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード膵癌 / サブタイプ / RNA sequence / ctDNA / 包括的遺伝子プロファイリング / 遺伝子プロファイリング / 精密医療
研究開始時の研究の概要

高い浸潤・転移能を有し極めて不良な予後を呈する膵癌克服への課題は、早期発見困難、大多数を占める診断時進行症例に対する治療介入の限界、高率な根治術後再発である。本研究は、包括的遺伝子プロファイリングにより膵癌亜型毎の薬物療法を最適化し、治療介入後の微小残存病変をctDNAにより監視し、新規の分子標的治療法のバイオマーカーを確立するなど、膵癌精密医療を加速する一助となる。

研究実績の概要

先行研究 (膵癌特異的ゲノム変異のliquid biopsyによる超早期術後再発診断法の開発; 基盤研究(C)/19K09179)では、患者血液のリキドバイオプシーによる網羅的ctDNA監視の妥当性を検証し(Watanabe K, Kimura Y, et al. Int J Mol Sci. 2022, Watanabe K, Kimura Y, 投稿準備中)、膵癌根治術後転移再発の超早期診断に関する知見を集積した。本研究では、上記コホートを引き継ぎ、1) 診断時生検・切除検体の包括的遺伝子プロファイリングによる膵癌亜型が一次薬物療法選択に資するコンパニオン診断となり得るか? 2) 治療介入後のctDNAはMRDを反映し、分子標的治療法選択のガイド、となり得るかを検証する。
1)19K09179コホート(2019/05~2021/09, 膵癌204例)における臨床情報と遺伝子・ctDNAプロファイリングの突合; 本コホートには、切除・非切除症例が含まれており、非切除症例における診断時生検材料に対するctDNAプロファイル結果の整理、薬物療法種別、治療奏効、根治術後再発、転帰等の臨床情報を固定した。
2)既存コホート(19K09179)の組織遺伝子プロファイルによる膵癌亜型と代替分子マーカー(古典型; GATA6/基底型; CK5, 17)の一致率の検証;上記1)での報告通り、RNA sequencingのサンプル数と予算を含めた条件検討中である。一方、GATA6免疫染色については、パイロットサンプルに対して実施し、良好な結果を得た。
3)新規膵癌症例の前向き観察研究コホート;先行の19K09179コホートに加え、ctDNA、MRD、RNA sequencingによる膵癌亜型と膵癌再発・増悪等のイベントを登録すべく、臨床研究の立案中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

上記で述べたとおり、概ね計画通りの進捗である。RNA sequenceのコストが高額なことから、サンプルサイズの調整にやや時間を要しておる。しかし、これもパイロットサンプルを選定し実施調整済みである。

今後の研究の推進方策

19K09179コホートの組織遺伝子プロファイルによる膵癌亜型と代替分子マーカー(古典型; GATA6/基底型; CK5, 17)の一致率の検証;RNA sequencingのサンプル数と予算を含め、実施に向かう。GATA6免疫染色については、パイロットサンプルでの条件にて予定症例の染色と解析を行う。
新規膵癌症例の前向き観察研究コホート;先行の19K09179コホートに加え、ctDNA、MRD、RNA sequencingによる膵癌亜型と膵癌再発・増悪等のイベントを登録すべく、臨床研究を策定、IRB等の事務手続きを完了する。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Reconsidering Resectable Oncological Conditions in Pancreatic Tail Cancer: A Multicenter Retrospective Study on Prognostic Factors in Pancreatic Tail Cancer after Resection (HOPS Pt-01).2024

    • 著者名/発表者名
      Yasutoshi Kimura
    • 雑誌名

      Pancreatology

      巻: 24 号: 1 ページ: 109-118

    • DOI

      10.1016/j.pan.2023.12.004

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 膵癌切除後の微小残存病変 (MRD)と術後再発における腫瘍情報に基づくctDNAモニタリングの多施設共同研究2024

    • 著者名/発表者名
      木村康利
    • 雑誌名

      癌の臨床

      巻: 67 ページ: 257-268

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Gastric intramural metastasis caused by needle tract seeding after preoperative fine needle aspiration for pancreatic body cancer subsequently resected by total pancreatectomy: a case report and literature review.2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshida E, Kimura Y, Takemasa I. et al.
    • 雑誌名

      World J Surg Oncol

      巻: 21(1) 号: 1 ページ: 418-418

    • DOI

      10.1186/s12957-023-02914-0

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Standard versus delayed initiation of S-1 adjuvant chemotherapy after surgery for pancreatic cancer: a secondary analysis of a nationwide cohort by the Japan Pancreas Society2023

    • 著者名/発表者名
      Tomimaru Y, Eguchi H, Shimomura Y, Kitamura T, Inoue Y, Nagakawa Y, Ohba A, Onoe S, Unno M, Hashimoto D, Kawakatsu S, Hayashi T, Higuchi R, Kitagawa H, Uemura K, Kimura Y, Satoi S, Takeyama Y; Committee of Clinical Research, Japan Pancreas Society.
    • 雑誌名

      J Gastroenterol

      巻: 58 号: 8 ページ: 790-799

    • DOI

      10.1007/s00535-023-01988-7

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 切除企図膵癌における術前ctDNAを用いた潜在性遠隔転移予測の多施設共同研究2024

    • 著者名/発表者名
      村上武志
    • 学会等名
      第124回日本外科学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 胆膵外科領域におけるゲノム研究の臨床応用~外科教室の取り組みの現状と課題~2024

    • 著者名/発表者名
      中村 透
    • 学会等名
      第124回日本外科学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 膵癌切除後の微小残存病変(MRD)と術後再発における腫瘍情報に基づくctDNAモニタリングの多施設共同研究2023

    • 著者名/発表者名
      木村康利
    • 学会等名
      第123回日本外科学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 膵尾部癌の予後因子に関する多施設後方視的コホート研究2023

    • 著者名/発表者名
      木村康利
    • 学会等名
      第78回日本消化器外科学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 切除不能膵癌に対するコンバージョン手術を見据えた集学的治療実態2023

    • 著者名/発表者名
      木村康利
    • 学会等名
      第54回日本膵臓学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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