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術前化学放射線療法後直腸癌の空間的解析による治療効果予測因子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 23K08171
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55020:消化器外科学関連
研究機関神戸大学

研究代表者

山下 公大  神戸大学, 医学部附属病院, 特命准教授 (80535427)

研究分担者 藤田 貢  近畿大学, 医学部, 准教授 (40609997)
掛地 吉弘  神戸大学, 医学研究科, 教授 (80284488)
齋藤 雅史  神戸大学, 医学研究科, 助教 (80826321)
高村 史記  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (90528564)
研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2024年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード直腸癌 / 化学放射線療法 / レジデントメモリーCD8+T細胞 (TRM) / CD8+T細胞 / 細胞間相互作用 / 空間的解析 / イメージサイトメトリー / 術前化学放射線療法
研究開始時の研究の概要

本研究はNACRT例に対し、抗腫瘍免疫応答における重要な役割を担う腫瘍内CD8+TRMを中心に腫瘍及びリンパ節を深層学習を基盤としたイメージングサイトメトリーを用いて空間的構造情報の解析を行い、治療効果や長期予後に対するより鋭敏なバイオマーカー検出を行う。同時にCRTマウスモデルを用いてTRM の分化解析を行う。NACRT後直腸癌に対して病理組織標本を用いた治療効果予測因子及び予後予測因子を同定、pCR症例のリンパ節によるpCR予測因子の探索、CD8+TRMの分化機構の解明に挑む。直腸癌腫瘍微小環境解析に基づく術前治療の治療体系を強固にし、将来の治療選択モデル構築に貢献する。

研究実績の概要

本研究は、直腸癌に対する術前化学放射線治療(NACRT)の効果と長期予後を予測するための新たなバイオマーカーの探索を目的としている。特に、腫瘍内レジデントメモリーCD8+T細胞(TRM)に着目し、独自開発の病理診断人工知能を基盤としたイメージングサイトメトリー「Cu-Cyto(キューサイト)」を用いて、腫瘍及びリンパ節における空間的構造情報の解析を行う。本研究では、NACRT後の直腸癌患者の病理組織標本(腫瘍組織、リンパ節)を用いて、治療効果及び予後予測因子を同定し、病理学的完全奏効(pCR)例のリンパ節を解析し、pCR予測因子を探索する。さらに、CRTマウスモデルを用いて、TRMの分化機構を解明する。これらの解析により、直腸癌における腫瘍免疫微小環境(TIME)の理解を深め、術前治療の効果予測や治療選択モデルの構築に貢献することが期待される。また、TRMを標的とした新たな免疫療法の開発にも繋がる可能性がある。本研究の成果は、直腸癌患者の術前治療戦略の最適化に寄与し、個別化医療の実現に向けた重要な一歩となるだろう。さらに、TRMの分化機構の解明は、がん免疫療法全般の発展にも貢献すると考えられる。Cu-Cytoによる詳細な解析と、マウスモデルを用いた基礎研究を組み合わせることで、直腸癌に対する革新的な治療法の開発が期待される。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

直腸癌に対する術前化学放射線治療(NACRT)後の腫瘍免疫微小環境(TIME)を解析するため、多重免疫組織化学染色条件の設定が完了し、深層学習アルゴリズムに基づくイメージサイトメトリー「Cu-Cyto」のアノテーション作業を経て、直腸癌のプログラムが完成した。サンプルの染色を行い、Cu-Cytoでの解析所見と病理医による顕微鏡での評価所見に大きな矛盾がないことから、一定の精度でTIMEを構成する細胞の識別が可能であることが確認された。特にCD8+TRM(CD103+CD8+T細胞と定義)の検出精度は90%以上を達成している。
また、細胞間相互作用を数値化する共局在指標(CLI)の解析プログラムを整備中であり、腫瘍細胞とCD8+T細胞の組み合わせにおいて、CLI高値群で良好な無再発生存期間を示す結果が得られている。Cu-Cytoの利点を活かし、識別可能な10種類以上の細胞についてCLIを算出し、治療効果の評価指標としてより適した組み合わせを自動化することで、効率的な評価方法の確立を目指している。
細胞検出アルゴリズムの検出精度管理については、近く成果をまとめることが可能であり、CLIの意義に関する報告の準備も進めている。全体の進捗状況としてはやや遅れが生じているものの、解析基盤の効率化、転移学習の精度向上、CLIの最適化を進めることで、研究の加速を目指している。

今後の研究の推進方策

Cu-Cytoによる直腸癌の腫瘍免疫微小環境(TIME)解析は、概ね順調に進行している。学習段階ごとの細胞識別精度評価を自動的に行えるシステムの構築が進んでおり、近日中に報告予定である。このシステムにより、Cu-Cytoの性能評価がより効率的かつ正確に行えるようになると期待される。
Co-localization index (CLI) の解析については、自動化プログラムを作成中である。このプログラムが完成すれば、TIMEにおける様々な細胞間相互作用を網羅的かつ迅速に評価することが可能となり、治療効果予測に有用なバイオマーカーの同定が加速すると考えられる。
本研究では、直腸癌の進展過程におけるTIMEの動的変化を詳細に解析するため、大腸癌の自然発生モデルの採用を検討しているが、導入は未だできていない。このため、モデルマウスを卵巣癌に変更することも検討する。これらのモデルを用いることで、新たな治療標的の同定や、より効果的な免疫療法の開発につながると期待される。
今後は、Cu-Cytoの性能評価システムの確立、CLIの自動解析プログラムの完成、およびマウスモデルの作成を着実に進めることで、直腸癌に対する新規術前療法の開発を加速させていく方針である。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Deep Learning-based Image Cytometry Using a Bit-pattern Kernel-filtering Algorithm to Avoid Multi-counted Cell Determination2023

    • 著者名/発表者名
      ABE TOMOKI、YAMASHITA KIMIHIRO、NAGASAKA TORU、FUJITA MITSUGU、SAITO MASAFUMI、SAWADA RYUICHIRO、HASEGAWA HIROSHI、MATSUDA TAKERU、KATO TAKASHI、HARADA HITOSHI、URAKAWA NAOKI、GOTO HIRONOBU、KANAJI SHINGO、YANAGIMOTO HIROAKI、OSHIKIRI TARO、AJIKI TETSUO、FUKUMOTO TAKUMI、KAKEJI YOSHIHIRO
    • 雑誌名

      Anticancer Research

      巻: 43 号: 8 ページ: 3755-3761

    • DOI

      10.21873/anticanres.16560

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 【免疫療法を支える基礎研究】深層学習アルゴリズムを基盤としたイメージングサイトメトリーによる大腸癌腫瘍免疫微小環境の解析2023

    • 著者名/発表者名
      山下 公大、長坂 暢、安達 祐里、阿部 智喜、掛地 吉弘
    • 雑誌名

      癌と化学療法

      巻: 50 ページ: 955-957

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 局所進行直腸癌術前療法における腫瘍内レジデントメモリー CD8+T 細胞の動態とその役割2023

    • 著者名/発表者名
      山下 公大
    • 学会等名
      第123回日本外科学会定期学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] AI 病理診断システムを用いた直腸癌の新規予後因子の探索2023

    • 著者名/発表者名
      阿部 智喜
    • 学会等名
      第123回日本外科学会定期学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] NACRT 後の直腸癌の腫瘍微小環境の変化~ AI を用いた新規予後因子の探索~2023

    • 著者名/発表者名
      阿部 智喜
    • 学会等名
      第48回日本外科系連合学会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] AI 組織診断を用いた術前化学放射線療法後直腸癌の腫瘍 CD8+T 細胞の評価法の開発とその応用2023

    • 著者名/発表者名
      山下 公大
    • 学会等名
      第78回日本消化器外科学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 腫瘍免疫微小環境に対する AI イメージサイトメトリーと共局在指標2023

    • 著者名/発表者名
      阿部 智喜
    • 学会等名
      第21回日本デジタルパソロジー・AI研究会 定時総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 腫瘍免疫微小環境における病理 AI イメージサイトメトリーと共局在指標2023

    • 著者名/発表者名
      長坂 暢
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 消化器癌の転移性脳腫瘍における三次リンパ構造の解析2023

    • 著者名/発表者名
      大野 真佐輔
    • 学会等名
      第82回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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