| 研究課題/領域番号 |
23K08567
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分56010:脳神経外科学関連
|
|---|
| 研究機関 | 大阪大学 |
|---|
研究代表者 |
梅原 徹 大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (20792469)
|
|---|
| 研究分担者 |
有田 英之 大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (60570570)
高垣 匡寿 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (70724433)
木嶋 教行 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (80534627)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
|
| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2025年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2023年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
|
|---|
| キーワード | 膠芽腫 / 腫瘍内細菌叢 / メタゲノム / 腫瘍微小環境 / 腫瘍内細菌 |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
近年、従来「無菌」と考えられてきた中枢神経組織に由来する膠芽腫において「腫瘍内細菌」が存在することが明らかとされた。腫瘍微小環境とマイクロバイオーム(主に腸内細菌叢)との双方向的な関係性に対する理解が深まっており、膠芽腫の腫瘍内細菌叢についても何らかの生理機能を持つ可能性が示唆される。本研究では、膠芽腫における腫瘍内細菌叢のバイオマーカーとしての意義を検討する。さらに網羅的メタゲノム解析を用いて、腫瘍内細菌叢の分子系統樹作成や機能組成評価を行い、腫瘍微小環境の理解、臨床応用への橋渡しを目指す。
|
| 研究実績の概要 |
大阪大学大学院医学系研究科および医学部付属病院の臨床研究倫理審査の承認(承認番号 No.846, および No.19122)を得た上で、研究計画に基づき、膠芽腫症例のサンプル(腫瘍、糞便、血液、唾液、髄液)、臨床情報(年齢、性別、生存期間、治療内容、治療反応性など)を前向きに集積している。先行研究計画（20K17965）に沿って、取得した血液サンプルからのゲノムDNAを精製し、SNPタイピングをすでに実施している。膠芽腫を対象とした腫瘍、糞便サンプルからのバクテリアゲノムDNA精製、16S rRNA 解析、ショットガンメタゲノム解析については準備段階にあり、本学微生物研究所感染症センターと連携して行っていく。膠芽腫と平行して、疾患頻度の高い慢性硬膜下血腫を対象とした腸内細菌叢解析を開始しており、糞便サンプル収集及び、Qiime2 などの解析ツールを用いて自ら菌叢解析を実行している。膠芽腫における腫瘍内細菌叢の診断、治療、予後のバイオマーカーとしての意義を検討することに加えて、分野横断的にSNPデータ、腫瘍体細胞変異、画像特徴、腸内細菌叢を誘導したゲノム・オミクスデータベースの構築を目指している。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
腫瘍内細菌叢解析に必要な腫瘍、糞便サンプルの集積は進んでいるものの、バクテリアゲノムDNA精製、16S rRNA 解析、ショットガンメタゲノム解析は初年度の段階では準備段階であり、やや遅れている状況である。
|
| 今後の研究の推進方策 |
膠芽腫腫瘍サンプルを用いて、バクテリアゲノムDNAを精製する手技を確立した上で、腫瘍内細菌叢プロファイリングを行い、診断、治療、予後のバイオマーカーとしての意義を検討する。また臨床・画像情報や腫瘍分子プロファイルとの横断的統合解析を行うことにより、腫瘍微小環境における腫瘍内細菌叢の機能理解を進めることを、本研究の最終目標とする。
|
