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卵巣癌におけるゲノムワイドな5hmC解析と臨床病理学的因子に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 23K08800
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分56040:産婦人科学関連
研究機関九州大学

研究代表者

小野山 一郎  九州大学, 大学病院, 講師 (00444802)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2024年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード卵巣癌 / 5hmC / DNA脱メチル化
研究開始時の研究の概要

がんにおけるエピゲノム研究はこれまでDNAメチル化、ヒストン修飾に着目され研究が発展してきた。本研究では、DNAの脱メチル化の中間産物である5hmCに着目した研究であり、世界を見渡してもこれまで研究が進んでいない分野である。近年の研究には欠かせないツールとなっている次世代シークエンサーや質量分析計といった機材を使用し、今まで検出できなかった微細なゲノム修飾の変化を捉え、臨床の場に生かすことを目標として研究を進めて行く。

研究実績の概要

本研究では、メチル化DNAが脱メチル化する時の中間産物である5hmCの量とゲノムワイドな分布が、卵巣癌においてどのように変化するのか明らかにすることを目的として研究を行っている。
令和5年度は研究に用いるための卵巣癌症例を集積とそのサンプリングを行った。またDNAの抽出する条件を整えた。また、癌細胞における5hmCの基礎研究として、これまで解析していたBraf、Kras変異が起こった時のメチル化DNAの変化に加えて、Pten遺伝子に変異が起きた後のメチル化DNAの変化について解析を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

卵巣癌の臨床検体サンプリングまでは順調に進んでいるが、その後のDNA抽出作業が進んでいないため、進捗状況としてはやや遅れている状態にある。原因としてはすでにデータを取得済みであったPten欠損細胞のゲノムワイドなDANメチル化のデータ解析を行っていたためである。

今後の研究の推進方策

卵巣癌臨床検体からのDNA抽出作業に注力する。質の良いDNAが抽出できれば、メチル化DNAの定量と5hmCシークエンス用のライブラリー作成も効率よく進めることができる。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2024

すべて 学会発表 (1件)

  • [学会発表] Initial epigenetic alteration induced by aberrant activation of RAS-MAPK signaling in non-transformed cells.2024

    • 著者名/発表者名
      Ichiro Onoyama, Hiroshi Yagi, Kazuo Asanoma, Minoru Kawakami, Kazuhisa Hachisuga, Hiroshi Tomonobe, Shoji Maenohara, Keisuke Kodama, Masafumi Yasunaga, Hideaki Yahata, Kiyoko Kato
    • 学会等名
      第76回日本産科婦人科学会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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