研究課題/領域番号 |
23K08800
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分56040:産婦人科学関連
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研究機関 | 九州大学 |
研究代表者 |
小野山 一郎 九州大学, 大学病院, 講師 (00444802)
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研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円)
2024年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
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キーワード | 卵巣癌 / 5hmC / DNA脱メチル化 |
研究開始時の研究の概要 |
がんにおけるエピゲノム研究はこれまでDNAメチル化、ヒストン修飾に着目され研究が発展してきた。本研究では、DNAの脱メチル化の中間産物である5hmCに着目した研究であり、世界を見渡してもこれまで研究が進んでいない分野である。近年の研究には欠かせないツールとなっている次世代シークエンサーや質量分析計といった機材を使用し、今まで検出できなかった微細なゲノム修飾の変化を捉え、臨床の場に生かすことを目標として研究を進めて行く。
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研究実績の概要 |
本研究では、メチル化DNAが脱メチル化する時の中間産物である5hmCの量とゲノムワイドな分布が、卵巣癌においてどのように変化するのか明らかにすることを目的として研究を行っている。 令和5年度は研究に用いるための卵巣癌症例を集積とそのサンプリングを行った。またDNAの抽出する条件を整えた。また、癌細胞における5hmCの基礎研究として、これまで解析していたBraf、Kras変異が起こった時のメチル化DNAの変化に加えて、Pten遺伝子に変異が起きた後のメチル化DNAの変化について解析を行った。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
卵巣癌の臨床検体サンプリングまでは順調に進んでいるが、その後のDNA抽出作業が進んでいないため、進捗状況としてはやや遅れている状態にある。原因としてはすでにデータを取得済みであったPten欠損細胞のゲノムワイドなDANメチル化のデータ解析を行っていたためである。
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今後の研究の推進方策 |
卵巣癌臨床検体からのDNA抽出作業に注力する。質の良いDNAが抽出できれば、メチル化DNAの定量と5hmCシークエンス用のライブラリー作成も効率よく進めることができる。
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