切断点のゲノム・エピゲノム解析が明らかにする染色体構造異常の発生メカニズム

• 研究課題/領域番号: 23K08855
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 審査区分: 小区分56040:産婦人科学関連
• 研究機関: 藤田医科大学
• 研究代表者: 倉橋 浩樹 藤田医科大学, 医科学研究センター, 教授 (30243215)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2025年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2024年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 染色体構造異常

研究開始時の研究の概要

本研究では、複雑構造異常の切断点を、（１）成熟精子のChIP-seqのデータにマップし、ヒストン修飾やクロマチン構造との関連を検討する。（２）成熟精子のATAC-seqやMNase-seqのデータにマップし、ヌクレオゾーム構造との関連を検討する。（３）成熟精子のHi-Cのデータにマップし、切断点のクラスターと核内配置、遺伝子発現ユニットとしてのトポロジー関連ドメイン（TAD）との関連を検討する。