| 研究課題/領域番号 |
23K08962
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分56050:耳鼻咽喉科学関連
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
岸川 敏博 大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (20756944)
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| 研究分担者 |
佐々 暢亜 大阪大学, 医学部附属病院, 医員 (90882241)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
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| キーワード | HPV関連中咽頭癌 / HPV16関連中咽頭癌 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
ヒトパピローマウイルス（human papillomavirus, HPV）関連中咽頭癌では、原因となるHPVの殆どをHPV16が占める。HPV16はゲノム配列の違いよって4つの系統（lineage）と16の亜系統（sublineage）に分類される。本研究では、日本人集団のHPV16関連中咽頭癌300例を対象に大規模なHPV16全ゲノムシーケンスを行い、本邦におけるHPV16亜系統の分布を明らかにするとともに一塩基多型（SNP）を検出する。更に、HPV16の亜系統やSNPと予後との相関について解析し、新たな予後因子を確立する。
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| 研究実績の概要 |
2023年4月までに多施設で集積したHPV16関連中咽頭癌296例の腫瘍検体341検体から採取したDNAを用いてHPV16 マルチプレックスPCRを実施した。得られたHPV16ゲノムを増幅したPCR産物を用いて次世代シーケンサーによるHPV全ゲノム解析を実施した。引き続き多施設で集積したHPV16関連中咽頭癌127例127検体を用いて同様にHPV全ゲノム解析を実施した。クオリティの保たれた465検体のシークエンスデータを用いて系統解析を実施した。20例のHPV16ゲノムに関して、サンガーシーケンスを追加した。引き続き、メタデータが集積可能な約380例を用いた予後解析を実施している。
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| 現在までの達成度 |
現在までの達成度
2: おおむね順調に進展している
理由
予定より早く、目標とした300例以上のHPV16関連中咽頭癌のHPV16ゲノムDNAを集積し、解析を開始できた。解析の行程でやや難渋しているが、概ね予定通りである。
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| 今後の研究の推進方策 |
集積したシークエンスデータの解析結果に関して、2025年度中の論文投稿、学会発表を目指す。
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