| 研究課題/領域番号 |
23K11312
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
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| 研究機関 | 千葉大学 |
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研究代表者 |
露崎 弘毅 千葉大学, 大学院医学研究院, 特任講師 (70769520)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2028-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2027年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2026年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2025年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2024年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
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| キーワード | バイオインフォマティクス / エピゲノム / シングルセルオミックス / 次元圧縮 / 機械学習 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
ある細胞集団からRNA-Seqとエピゲノムを個々に計測した場合、行も列も共有しないDiagonalなデータ構造となる。Diagonalなデータは一般的に利用できるアルゴリズムが少ない、解析が難しいデータとなる。Diagonalなデータ同士を統合するため、以下の3つの方針を考える。
・方針1: DiagonalなデータをHorizontalなデータに変換する
・方針2: シングルセルマルチオミックスのデータを利用する
・方針3: 細胞に紐づく別のモダリティのデータを利用する
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