研究課題/領域番号 |
23K11313
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
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研究機関 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 |
研究代表者 |
本野 千恵 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (80415752)
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研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2024年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2023年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
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キーワード | アロステリック効果 / タンパク質 / 残基間コンタクト / 進化 / 分子動力学シミュレーション |
研究開始時の研究の概要 |
アロステリック効果は、タンパク質が環境からの合図を認識し、認識部位から離れた部位に反応を引き起こす基本的なメカニズムである。その分子メカニズムは十分に解明されず、相同タンパク質間でのアロステリック効果の保存性の有無も解決されていない。 本研究では、比較的短時間の2つの分子動力学計算結果から、残基間コンタクトを比較して、アロステリック効果を伝える分子内ネットワークを推定する手法を提案する。その手法により、相同なタンパク質のアロステリックネットワークの差異を解析し、保存性の程度や保存のメカニズム(相互作用する残基の共進化、不活性化変異を相補する別のネットワーク形成)を明らかにする。
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