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複製ストレス応答におけるDNA修復因子SLX4の局在制御ネットワークの解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K11419
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分63020:放射線影響関連
研究機関九州大学

研究代表者

勝木 陽子  九州大学, 薬学研究院, 助教 (00645377)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2024年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードSLX4 / 内因性複製ストレス / lacO-LacI相互作用 / ユビキチン結合ドメイン / SUMO認識モチーフ / 複製ストレス / DNA修復 / DNA-タンパク質複合体
研究開始時の研究の概要

本研究の目的は、DNA修復因子SLX4の停止した複製フォークへの局在を制御する分子経路の解明である。DNA-タンパク質複合体やゲノム上のリピート配列による二次構造の形成は、内因性の複製ストレスとなる。増殖の盛んながん細胞では慢性的に複製ストレスが生じるため、その生存は複製ストレス修復機構に大きく依存することが明らかとなりつつある。近年申請者の所属研究室で構築されたシステムにおいて、SLX4が複製ストレス応答の初期シグナルに必要であることが示された。本システムを用いて内因性の複製ストレス応答によるゲノム安定性維持機構を明らかにすることで、がんの分子標的治療薬の開発等に貢献することが期待される。

研究実績の概要

本研究は、複製ストレス応答機構において重要な役割を担う、DNA修復因子SLX4の異常停止した複製フォークへの局在を制御する分子経路の解明を目的とする。テロメアやセントロメア等、ゲノム上の機能的な長いリピート配列に形成されたDNAタンパク質複合体は、内因性の複製障害の原因となる。複製障害部位にSLX4が集積する分子メカニズムには、比較的よく知られているN末端のユビキチン結合ドメインUBZ4を介した経路以外に、C末端のSUMO認識モチーフ(SIM)を介した経路の存在が近年示唆されている。しかしながら、いずれも複製ポリメラーゼの阻害剤や化学療法剤を用いて解析されており、内因性の複製ストレスに応答してSLX4が停止フォークに集積する分子機構は未解明のままである。
今年度はまず、当研究室で構築された大腸菌由来lacO-LacI相互作用による内因性複製ストレス誘導モデル(lacO-LacIシステム)を用い、UBZ4ドメイン非依存的なSLX4の集積機構の検討を行った。本モデル系において、UBZ4ドメインを有するN末端SLX4(1-900aa, SLX4-N)はLacI結合lacOリピートに効率よく集積する。ところがSLX4-Nはその複合体因子として機能するXPFヌクレアーゼの結合ドメインを有するにもかかわらず、XPFの集積を促進することができず、ドミナントネガティブ変異体である可能性が示唆されている。一方C末端SLX4(901-1834aa, SLX4-C)や、SUMO化阻害剤等を用いて内在性SLX4, XPFの局在を解析した結果、本系においてはSIM依存的なSLX4の集積が重要であることが示されつつある。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

2023年度は、SLX4-NとSLX4-C安定発現細胞を用いて、LacI結合後lacO領域への両変異体の集積のタイムコースを検討した。S期に同調し、リリースと同時にLacI結合を誘導した時点を0時間とし、1-8時間後のLacIとの共局在頻度を調べたところ、SLX4-NはLacI結合部位への集積の経時的な上昇が認められた。一方SLX4-Cは、先行研究で示された内在性のSLX4と同様に、複製ストレス誘導後の集積に顕著な変化は認められず、lacOリピート配列がとりうる二次構造等に集積している可能性もあることが示唆された。
次にユビキチン化、SUMO化経路の活性化酵素E1の各阻害剤を用いて、SLX4-N, SLX4-Cおよび内在性のSLX4, その複合体因子であるXPFの集積に与える影響を検討した。予想した通り、UBZ4ドメインを有するSLX4-Nの集積はユビキチンE1阻害剤で著しく減弱した一方、SIMが存在するSLX4-Cの集積はSUMO E1阻害剤で顕著に減少した。またSUMOタンパク質との結合ができないアミノ酸置換変異を導入したSLX4 SIM変異体は、複製ストレス部位に全く集積できなかった。さらに内在性SLX4とXPFは、ユビキチンE1阻害剤処理によって有意ではあるものの、その集積はわずかに減弱した程度であった一方、SUMO E1阻害剤では著しい集積の低下が認められた。以上の結果から、本系による内因性複製ストレス応答においてSLX4-XPF複合体の停止フォークへの集積は、SUMO-SIM相互作用に依存している可能性が高いことが示唆された。

今後の研究の推進方策

次年度は予定通り、UBZ4ドメインを欠失し、XPF結合ドメインを有するSLX4変異体(SLX4 393-1539)発現ウイルスベクターの構築とその安定発現細胞の樹立を行い、本システムにおいてUBZ4ドメイン非依存的にSLX4がXPFをリクルート可能かどうか検討する。また、アフィニティー精製ー質量分析法を用いてSLX4のSIMに結合するSUMO化因子やSUMO化に関わるE3リガーゼ等の制御因子の探索を行う予定である。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2023 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Mouse Slfn8 and Slfn9 genes complement human cells lacking SLFN11 during the replication stress response2023

    • 著者名/発表者名
      Alvi Erin、Mochizuki Ayako L.、Katsuki Yoko、Ogawa Minori、Qi Fei、Okamoto Yusuke、Takata Minoru、Mu Anfeng
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05406-9

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Two distinct ubiquitination pathways coordinating DNA interstrand crosslink repair in human cells2023

    • 著者名/発表者名
      Yoko Katsuki
    • 学会等名
      Sussex Japan Genome Stability Meeting
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Elucidation of ubiquitin signaling for recruitment of SLX4 during replication-coupled DNA interstrand crosslink repair2023

    • 著者名/発表者名
      Y. Katsuki, M. Abe, H. Kosako, M. Takata and M. Fujita
    • 学会等名
      The 19th Ataxia-Telangiectasia workshop (ATW2023Kyoto)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 複製ストレス応答におけるDNA修復因子SLX4の局在制御機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      勝木陽子
    • 学会等名
      第 10 回 DNA 損傷応答ワークショップ
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト染色体上における内因性複製ストレス誘導モデルを用いた修復因子SLX4-XPFの局在制御の解明2023

    • 著者名/発表者名
      勝木陽子、岡野拓真、藤井純平、松村友輝、吉田和真、藤田雅俊
    • 学会等名
      第27回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト染色体上における内因性複製ストレス誘導モデルを用いた修復因子SLX4-XPFの局在制御の解明2023

    • 著者名/発表者名
      勝木陽子、岡野拓真、藤井純平、松村友輝、吉田和真、藤田雅俊
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト染色体上における内因性複製ストレス誘導モデルを用いた修復因子SLX4-XPFの局在制御機構2023

    • 著者名/発表者名
      勝木陽子、岡野拓真、藤井純平、松村友輝、吉田和真、藤田雅俊
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 医薬細胞生化学ホームページ

    • URL

      https://tansaku.phar.kyushu-u.ac.jp/saito/top.html

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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