低環境負荷のオンサイト植物病診断を実現する核酸増幅技術の開発

• 研究課題/領域番号: 23K13864
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分38020:応用微生物学関連
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 宮崎 彰雄 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教 (70847748)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2025年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2024年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 核酸増幅法 / 低環境負荷 / RPA法 / 低温細菌 / 酵素活性評価

研究開始時の研究の概要

PCR法に代表される核酸増幅技術は病原体の検出に重宝されるが、加温を要するためフィールドなどの末端臨床現場では利用しづらい。本研究ではこの課題にアプローチすべく、温度条件が最もゆるく37℃で実施可能なRPA法の温度をさらに引き下げることを目指す。RPA法において温度制約は２つの酵素の活性に依存するため、低温域において高い活性を維持するものがあれば有用であると考えられる。そこで、データベースに蓄積されたゲノム情報に基づいて低温菌の当該酵素を作出・評価し、組み合わせて低温RPA系を構築する。本研究が目指す加温処理の不要化は、臨床現場向けの利便性を向上するとともに、低環境負荷にも繋がり革新的である。