異質六倍体コムギにおけるシングルトン同祖遺伝子の機能解析

• 研究課題/領域番号: 23K13932
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分39010:遺伝育種科学関連
• 研究機関: 国立研究開発法人理化学研究所
• 研究代表者: 江副 晃洋 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 基礎科学特別研究員 (70913945)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2028-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2027年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2026年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円); 2025年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2024年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
• キーワード: Evolution / Polyploidization / Functionalization

研究開始時の研究の概要

シングルトン遺伝子は、倍数体の各ゲノムに一つだけ存在する遺伝子である。シングルトン遺伝子は特徴的な機能を持つ傾向があるため、多くのモデル生物ではシングルトン遺伝子の機能解析が進められてきた。しかし、異質六倍体コムギのシングルトン遺伝子は、他のゲノムに存在する「シングルトン同祖遺伝子」と冗長性があるため、効率的な機能解析手法の適用が困難である。本プロジェクトでは、シングルトン同祖遺伝子の性質から冗長性を検出する予測モデルを開発し、シングルトン同祖遺伝子の機能解析を行う。