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光化学系の集光機能を調節するメガ複合体化の普遍性と調節因子の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K14216
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分44030:植物分子および生理科学関連
研究機関基礎生物学研究所

研究代表者

金 恩哲  基礎生物学研究所, 環境光生物学研究部門, 助教 (30836359)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2025年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード光合成 / 集光 / 光防御 / 光化学系 / メガ複合体
研究開始時の研究の概要

植物は安全で効率的な光合成のため、弱光条件では光を効率的に集光し、強光条件では光ダメージを防止し安全に集光する仕組みを持っている。最近、ほうれん草の光化学系がメガ複合体を形成することでその集光機能が調節されることが明らかになったが、このメガ複合体形成の調節因子は不明であり、メガ複合体形成が緑色植物の普遍的特性であるかどうかも明確ではない。本研究は多様な緑色植物の光化学系メガ複合体形成を分析して集光制御における普遍性を調べること、またメガ複合体形成の調節因子を調べることを目的とする。本研究により、超複合体レベルよりも一つ上の階層のメガ複合体レベルでの集光機構調節の実態が明らかになると期待される。

研究実績の概要

本研究は、緑色植物における光化学系メガ複合体の形成とその機能に焦点を当てている。緑色植物は進化の過程で様々な光合成機構を進化させてきたが、特に集光システムの最適化は重要な課題だ。この研究では、メガ複合体の形成が様々な種でどのように調節されるのか、そしてそれが最終的に集光システムの調節にどのように寄与するのかを明らかにすることを目指している。1年目は、オステオコッカス(プラシノ藻類)、クロレラ、クラミドモナス、ゼニコケ、イネ、シロイヌナズナ、ほうれん草など、様々な植物からメガ複合体の形成とその機能の基礎的な分析に焦点を当てた。Amphipolを使用したショ糖密度勾配超遠心分離法とClear Native-PAGEにより、各植物種の特性に応じたメガ複合体の形成パターンを詳細に調査した。緑藻植物門では、メガ複合体が減少またはPSI-PSIIが発達し、ストレプト植物ではPSII-PSIIメガ複合体が発達している傾向が見られた。特に、クラミドモナスとクロレラで異なるパターンを示したことは重要な発見だった。さらに、光条件、温度などの環境条件下でモデル植物であるシロイヌナズナを用いた実験を通じて、これらの環境的要因がメガ複合体の形成にどのような影響を与えるかを調査した。また、ネガティブ染色を用いた電子顕微鏡と単粒子分析を通じて、精製されたメガ複合体の構造を詳細に分析した。これらの分析を通じて、緑色植物におけるメガ複合体の普遍性と調節因子を示す初期データを収集した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

ネプロセルミス藻類だけは培養の問題で分析が遅れているが、他の植物種の分析は順調に計画よりも早く進んでいる。

今後の研究の推進方策

今後の研究推進方策として、まずはさらに多くの植物種に焦点を当て、特に異なる生態系や光環境に適応した種を選定し、熱帯雨林、砂漠、寒冷地など、極端な環境に適応した植物からのサンプル収集を強化する。これにより、メガ複合体形成の多様性と進化的背景を広範囲にわたり調査することが可能となる。また、最新の生化学的および分子生物学的手法を導入し、特にクライオ電子顕微鏡(Cryo-EM)を用いた構造解析や、次世代シーケンシングを活用した遺伝子発現解析でメガ複合体の詳細な構造と機能解析を行う。さらに、光条件、温度、水分といった異なる環境ストレスに対するメガ複合体の応答を詳細に調査し、これによりメガ複合体が植物の環境適応性にどのように寄与しているかを調べる。
メガ複合体形成の調節因子を明らかにするため、メガ複合体の形成に関係する遺伝子発現パターンを調べる。遺伝子発現量を比較するために、基本的に利用可能なRNA-seqデータを使用し、実際に使用したサンプルのRNA-seqデータが必要な際は、RNA-seq解析を行う。
また、光化学系メガ複合体の機能と性質の分析を行う。集光能力を分析するためには、光化学系の反応中心の電子分離によるPSIIの蛍光誘導曲線と光化学系Iの吸収誘導分析方法を活用し、光防御能力を分析するために蛍光寿命分析方法を活用し、エネルギー消去程度を調べる。また、光化学系間の結合性質を分析するために熱力学的解離速度論分析法を活用する。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] On breakthroughs and limits: Resolving structural fine-tuning of photosynthetic supercomplexes2024

    • 著者名/発表者名
      Kim Eunchul、Dann Marcel
    • 雑誌名

      Molecular Plant

      巻: 17 号: 2 ページ: 224-226

    • DOI

      10.1016/j.molp.2023.12.016

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] How much heat does non-photochemical quenching produce?2024

    • 著者名/発表者名
      Murakami Aoi、Kim Eunchul、Minagawa Jun、Takizawa Kenji
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 15

    • DOI

      10.3389/fpls.2024.1367795

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Formation of a stable PSI-PSII megacomplex in rice that conducts energy spillover2023

    • 著者名/発表者名
      Kim Eunchul、Yokono Makio、Tsugane Kazuo、Ishii Asako、Noda Chiyo、Minagawa Jun
    • 雑誌名

      Plant And Cell Physiology

      巻: - 号: 8 ページ: 858-865

    • DOI

      10.1093/pcp/pcad037

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overexpression of LHCSR and PsbS enhance light tolerance in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      Wilson Sam、Kim Eunchul、Ishii Asako、Ruban Alexander V.、Minagawa Jun
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology

      巻: - ページ: 112718-112718

    • DOI

      10.1016/j.jphotobiol.2023.112718

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] The binding of light-harvesting antennae to PsaB suppresses the PSII to PSI spillover2023

    • 著者名/発表者名
      Yokono Makio、Kim Eunchul、Minagawa Jun
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1864 号: 4 ページ: 148995-148995

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2023.148995

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Light quality as a driver in adapting photosynthetic acclimation to niche partitioning2023

    • 著者名/発表者名
      Kim Eunchul
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Botany

      巻: 74 号: 21 ページ: 6413-6416

    • DOI

      10.1093/jxb/erad409

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 分子構造を用いたエネルギーネットワーク解析~クロロフィルa とb の共存による集光機構の最適化~2024

    • 著者名/発表者名
      Eunchul Kim, Daekyung Lee, Souichi Sakamoto, Akihito Ishizaki, Jun Minagawa, Heetae Kim
    • 学会等名
      第65回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クロロフィルaとbの共存による集光機構の最適化 ―分子構造を用いたエネルギーネットワーク解析―2023

    • 著者名/発表者名
      金 恩哲, Daekyung Lee, 坂本 想一, Ju-Yeon Jo, Mauricio Vargas, 石崎 章仁, 皆川 純, Heetae Kim
    • 学会等名
      第23回日本光生物学協会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 集光システムの調節における 物理化学的分子メカニズム2023

    • 著者名/発表者名
      金 恩哲
    • 学会等名
      第28回光合成学会若手の会セミナー
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulatory Factors and Formation of Photosystem Megacomplexes2023

    • 著者名/発表者名
      Eunchul Kim, Asako Ishii, Makio Yokono, Kazuo Tsugane, Chiyo Noda, Jun Minagawa
    • 学会等名
      第13回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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