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Evolutionary forces driving the diversity of protist symbioses

研究課題

研究課題/領域番号 23K14256
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関沖縄科学技術大学院大学

研究代表者

HUSNIK Filip  沖縄科学技術大学院大学, 進化・細胞・共生の生物学ユニット, 准教授 (30886130)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2024年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
2023年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードsymbiosis / protist / bacteria / archaea / genomics / organelle / evolution / mitochondrion
研究開始時の研究の概要

I will the diversity of symbioses in microbial eukaryotes. I will use advanced single-cell sequencing and microscopy methods to predict the symbiont function(s), uncover their cellular localization, and understand their evolution. The results of the project will clarify the current symbiosis theory and propose new fundamental mechanisms for how symbioses evolve.

研究実績の概要

Our major published achievements so far include work on 7 (6 symbiont-derived) genomes in a single cryptomonad cell (George et al., Cur Biol 2023) and a study showing that previously reported symbionts in Symbiomonas were misidentified giant viruses (Cho et al., PLoS Genetics, 2024).

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

Due to the solid preparation status with many samples already collected or cultured in my group, the initial plan to screen a diversity of protists for symbionts is largely finished.

今後の研究の推進方策

In the FY2024, we will proceed with a detailed characterization of the selected systems. So far, we published our work on 2 species (Cryptomonas and Symbiomonas). A manuscript on 7 species of large benthic foraminifera is currently drafted and additional manuscripts on >5 systems are in preparation. We will thus reach the number of ~10 characterized systems as proposed in the application.

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Genomic analyses of Symbiomonas scintillans show no evidence for endosymbiotic bacteria but do reveal the presence of giant viruses2024

    • 著者名/発表者名
      Anna Cho ,Gordon Lax,Samuel J. Livingston,Yumiko Masukagami,Mariia Naumova,Olivia Millar,Filip Husnik,Patrick J. Keeling
    • 雑誌名

      PLoS Genetics

      巻: NA 号: 4 ページ: e1011218-e1011218

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1011218

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A single cryptomonad cell harbors a complex community of organelles, bacteria, a phage, and selfish elements2023

    • 著者名/発表者名
      George EE, Barcyte D, Lax G, Livingston S, Tashyreva D, Husnik F, Lukes J, Elias M, Keeling PJ
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 33 号: 10 ページ: 1982-1996

    • DOI

      10.1016/j.cub.2023.04.010

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Cataloging Marine Symbioses with Omics and Advanced Imaging Methods.2024

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      WPI AIMEC (Tohoku University/JAMSTEC)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Integrating Diverse Subcellular, Single-Cell, and Three-Dimensional Methods to Understand How Endosymbionts Become Organelles.2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Animal-Microbe Symbioses
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Integrating omics with 3D imaging to understand how endosymbionts become organelles2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      ECOP-ISOP Joint Meeting
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Two Billion Years of Eukaryotic Symbioses: Major Transitions and Cellular Innovations2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      SymbNET PhD Summer School on Host-Microbe Symbioses
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Integrating omics with 3D imaging for symbioses of uncultivated aquatic protists.2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      SymbNET PhD Summer School on Host-Microbe Symbioses
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Integrating omics with 3D imaging to understand how endosymbionts become organelles.2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      Beijing Normal University
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Eukaryotic symbioses of large benthic foraminifera2023

    • 著者名/発表者名
      Langlet D., Ruppli R., Suzuki N.H., Sur O., Phua Y.H., Fujita K., and Husnik F.
    • 学会等名
      FORAMS
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Exploring Marine Symbioses with Genomics, Advanced Imaging, and AI Tools2023

    • 著者名/発表者名
      Husnik, F
    • 学会等名
      Tohoku University
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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