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中枢神経原発悪性リンパ腫の発症を支持する脳内免疫環境細胞の同定

研究課題

研究課題/領域番号 23K15316
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分54010:血液および腫瘍内科学関連
研究機関筑波大学

研究代表者

服部 圭一朗  筑波大学, 医学医療系, 講師 (10832024)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2024年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2023年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード中枢神経原発悪性リンパ腫
研究開始時の研究の概要

nCounterシステムを用いて神経炎症に関連した770遺伝子をターゲットとした中枢神経原発悪性リンパ腫のRNA定量解析を既に30症例分行っており、volcano plotを用いて予後不良群と良好群とで比較した結果48個の遺伝子が予後不良群において有意に高発現していることを発見した。これらの遺伝子は、オリゴデンドロサイトなどの中枢神経の免疫環境に関連していたことから、PCNSLの免疫環境細胞が臨床予後に関係している可能性があることが示唆される。更に正確な評価を行うために、シングルセルシークエンス解析を通じて、予後予測のためのバイオマーカーの同定を行うことを目標とする。

研究実績の概要

中枢神経系原発悪性リンパ腫(Primary central nervous system lymphoma: PCNSL)は脳内に原発する悪性リンパ腫で、殆どの症例はびまん性大細胞性B細胞リンパ腫 (Diffuse large B cell lymphoma; DLBCL)の病理形態を示す。
ゲノム解析を通じて、約70%の患者において腫瘍からL265P MYD88変異が認められることを確認した(British Journal of Haematology 2016)。全身性DLBCLにおいても同様の遺伝子変異は報告されているものの、それらと比較するとPCNSLにおける変異頻度のほうが各段に高いことが示された。特に免疫異常に関係する遺伝子の変異(B2M、CD58、HLA-A/-B)や、PDL-1/PDL-2の発現上昇やゲノム増幅をPCNSLにおいて高頻度に認めたことから、全身性DLBCLとの遺伝子型と表現型の違いの原因として、脳内の特殊な免疫環境が影響しているという仮説を立てた。
その検証のために、新規核酸定量システムnCounterを使用して40症例のサンプルに対してRNA定量解析を行い、腫瘍細胞及び環境因子に関連した遺伝子発現のレベルを確認した。並行して、DLBCLで高頻度に変異が見られる遺伝子をターゲットとして、同一サンプルに対して変異解析を行った。
現在、PCNSLの微小環境の解明のため、遺伝子変異と免疫細胞の分布パターンとの関連について解析中である。解析の際には、Newmanらの開発した、各細胞腫の構成比を推定する手法であるCIBERSORT や、東大医科研のスーパーコンピュータSHIROKANEを用いて小川、宮野らが開発したパイプラインであるGENOMON を用いて解析を行った。いずれの解析技術も申請者はすでに確立し、殆どのサンプルにおいて結果を得ている

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究成果を昨年度血液学会総会で発表をしている。
現在、研究成果を論文にまとめて投稿することを検討している

今後の研究の推進方策

PCNSLの生検体をセルソーターによって腫瘍と腫瘍以外の細胞に分離した上で、10XGenomicsを利用したシングルセルシークエンスを行うことで、特定の発現プロファイルをとる微小環境細胞の分布や細胞間相互作用を一細胞レベルで明らかにしていく。
並行して、PCNSLで高頻度に変異が見られる30遺伝子について変異解析を行い、遺伝子変異プロファイルと微小環境細胞の分布との関連を調べる。その際、Newmanらの開発した、各細胞腫の構成比を推定する手法であるCIBERSORTx や( Newman, Nature biotechnology 2019)、東大医科研のスーパーコンピューターSHIROKANEを用いて小川、宮野らが開発したパイプラインであるGENOMONを用いて解析を行う。いずれの解析技術も申請者は既に確立している。
次に、免疫細胞サブセットに関連するマーカー遺伝子を基にパネルをカスタマイズし、nCounterシステムでFFPEの解析を行う。生存予後を始めとした臨床データとの関連を解析し、層別化を図る。加えて、各免疫細胞サブクラスターに最も特異的な蛋白発現を利用して、筑波大学附属病院に保存している約100 症例分のFFPEに対して免疫組織染色を行い、蛋白発現をしている細胞を特定し、発現量と臨床データ(生存期間、再発
の有無など)との関連を解析し、nCounter解析結果の検証を行う。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 1件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 4件)

  • [雑誌論文] Impact of CD34 positive cell dose in donor graft on the outcomes after haploidentical peripheral blood stem cell transplantation with post-transplant cyclophosphamide ? A retrospective single-center study with a Japanese cohort2024

    • 著者名/発表者名
      Maruyama Yumiko、Nishikii Hidekazu、Kurita Naoki、Sakamoto Tatsuhiro、Hattori Keiichiro、Suehara Yasuhito、Yokoyama Yasuhisa、Kato Takayasu、Obara Naoshi、Sakata-Yanagimoto Mamiko、Chiba Shigeru
    • 雑誌名

      Blood Cells, Molecules, and Diseases

      巻: 105 ページ: 102820-102820

    • DOI

      10.1016/j.bcmd.2023.102820

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Triple-negative Thrombocythemia and Subsequent Acute Lymphoblastic Leukemia with Additional Somatic Mutations2023

    • 著者名/発表者名
      Tsuboi Y, Sakamoto T, Makishima K, Suehara Y, Hattori K, Kurita N, Yokoyama Y, Kato T, Nishikii H, Obara N, Matsumura F, Matsuoka R, Chiba S, Sakata-Yanagimoto M.
    • 雑誌名

      Internal Medicine

      巻: 62 号: 10 ページ: 1527-1530

    • DOI

      10.2169/internalmedicine.0269-22

    • ISSN
      0918-2918, 1349-7235
    • 年月日
      2023-05-15
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Tumor heterogeneity and immune-evasive T follicular cell lymphoma phenotypes at single-cell resolution2023

    • 著者名/発表者名
      Suma Sakurako、Suehara Yasuhito、Fujisawa Manabu、Abe Yoshiaki、Hattori Keiichiro、Sakata-Yanagimoto Mamiko
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 38 号: 2 ページ: 340-350

    • DOI

      10.1038/s41375-023-02093-7

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Safety of romiplostim administered immediately after cord-blood transplantation: a phase 1 trial2023

    • 著者名/発表者名
      Kurita Naoki、Nishikii Hidekazu、Maruyama Yumiko、Suehara Yasuhito、Hattori Keiichiro、Sakamoto Tatsuhiro、Kato Takayasu、Yokoyama Yasuhisa、Obara Naoshi、Maruo Kazushi、Ohigashi Tomohiro、Yamaguchi Hitomi、Iwamoto Toshiro、Minohara Hideto、Matsuoka Ryota、Hashimoto Koichi、Sakata-Yanagimoto Mamiko、Chiba Shigeru
    • 雑誌名

      Annals of Hematology

      巻: 102 号: 10 ページ: 2895-2902

    • DOI

      10.1007/s00277-023-05410-3

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Repeated immunosuppressive rabbit antithymocyte globulin therapy for adult patients with relapsed or refractory aplastic anemia2023

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Tatsuhiro、Obara Naoshi、Maruyama Yumiko、Kato Takayasu、Kurita Naoki、Hattori Keiichiro、Suehara Yasuhito、Nishikii Hidekazu、Yokoyama Yasuhisa、Sakata‐Yanagimoto Mamiko、Usuki Kensuke、Chiba Shigeru
    • 雑誌名

      European Journal of Haematology

      巻: 111 号: 5 ページ: 768-776

    • DOI

      10.1111/ejh.14075

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Successful treatment of DOCK8 deficiency by allogeneic hematopoietic cell transplantation from alternative donors2023

    • 著者名/発表者名
      Kono Asuka、Wakamatsu Manabu、Umezawa Yoshihiro、Muramatsu Hideki、Fujiwara Hiroki、Tomomasa Dan、Inoue Kento、Hattori Keiichiro、Mitsui Tetsuo、Takada Hidetoshi、Minegishi Yoshiyuki、Takahashi Yoshiyuki、Yamamoto Masahide、Mori Takehiko、Kanegane Hirokazu
    • 雑誌名

      International Journal of Hematology

      巻: 118 号: 4 ページ: 519-525

    • DOI

      10.1007/s12185-023-03613-y

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 高度な骨髄線維化を認めたリンパ形質細胞性リンパ腫2023

    • 著者名/発表者名
      宝田亜矢子, 百瀬春佳, 栗田尚樹, 松岡亮太, 中村直哉, 坂本竜弘, 加藤貴康, 服部圭一朗, 末原泰人, 横山泰久, 錦井秀和, 丸山ゆみ子, 小原 直, 千葉 滋, 坂田(柳元)麻実子
    • 雑誌名

      臨床血液

      巻: 64 号: 1 ページ: 54-59

    • DOI

      10.11406/rinketsu.64.54

    • ISSN
      0485-1439, 1882-0824
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 免疫抑制療法後に<i>ASXL1</i>変異クローンで造血が回復した重症再生不良性貧血2023

    • 著者名/発表者名
      清水 百萌、服部 圭一朗、丸山 ゆみ子、南谷 泰仁、小川 誠司、坂田(柳元) 麻実子、千葉 滋、小原 直、錦井 秀和、飯塚 正、松岡 亮太、栗田 尚樹、坂本 竜弘、横山 泰久、加藤 貴康、末原 泰人
    • 雑誌名

      臨床血液

      巻: 64 号: 1 ページ: 49-53

    • DOI

      10.11406/rinketsu.64.49

    • ISSN
      0485-1439, 1882-0824
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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