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生活習慣病に関連するDNAメチル化領域の探索およびライフスタイル要因の影響

研究課題

研究課題/領域番号 23K16331
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分58030:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含まない
研究機関佐賀大学

研究代表者

古川 拓馬  佐賀大学, 医学部, 客員研究員 (50963659)

研究期間 (年度) 2023-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2026年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2025年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2024年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードDNAメチル化 / 生活習慣病 / ライフスタイル
研究開始時の研究の概要

【背景】
生活習慣病に対し遺伝子情報を活用した個別化予防・医療が期待され、DNAメチル化等のエピゲノムも注目されているが、具体的な対応策につながる研究は不十分である。
【目的】
本研究では生活習慣病に関連するDNAメチル化領域を探索し、経時的な影響やライフスタイル要因の関連について、詳細な検証を行うことを目的とする。
【意義】
遺伝子関連要因だけではなく、ライフスタイル要因や追跡調査を含む多くのデータを有するコホート研究内で検証することによって、生活習慣病に関するエピゲノム特性に応じた効果的かつ具体的な対処戦略につながる新たな研究成果が期待される。

研究実績の概要

本研究の目的は、生活習慣病に関連するDNAメチル化領域を探索し、ライフスタイル要因がどのように関連しているのかを明らかにすることであり、生活習慣病の個別化予防・個別化医療につながるエピゲノム特性に応じた具体的対処戦略に貢献する研究成果を挙げることを目指している。
初年度は主にDNAメチル化解析を行うためのデータ収集、解析環境整備を進めた。本研究では日本多施設共同コーホート研究-佐賀地区-(Japan Multi-Institutional Collaborative Cohort -Saga Region-: J-MICC Study Saga)に参加した約1万2千人の一般住民を対象とした。これまでの追跡研究において、基本情報や生活習慣、血液成分、疾患の罹患、死亡等を含む多くのデータが蓄積されている。DNAメチル化については、遺伝子解析および研究使用に同意が得られた成人男女904人において、網羅的なDNAメチル化測定(43万ヵ所以上)のデータ収集が行われた。
コホートにおける生活習慣病データおよびその他共変量となる因子等を解析用データセットとして整備し、ベースライン時において、糖尿病122人、高血圧171人、高脂血症115人などの有病が確認された。DNAメチル化測定データについて、コホートデータと統合して解析を行うための前処理、解析プログラムの作成・調整を進めた。今後、生活習慣病と関連するDNAメチル化領域を探索するエピゲノムワイド関連分析(Epigenome-wide association study: EWAS)を実施していく。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

現在までに約1万2千人のコホート研究データについて解析データセットの整備を行い、メインアウトカムとなる生活習慣病の有病状況等を確認した。
DNAメチル化については、904人分の網羅的なDNAメチル化測定(43万ヵ所以上)が行われているが、2種類のメチル化アレイキットが用いられており、前処理や解析プログラムの作成・調整にやや時間を要している。
生活習慣病と関連するDNAメチル化領域を、EWAS解析によって特定するまでには至っておらず、今後解析を進めていく必要がある。

今後の研究の推進方策

本年度のできるだけ早い段階でベースラインデータを用いたEWAS解析を実施し、生活習慣病と関連するDNAメチル化領域の探索を行う。
発見されたメチル化領域について、追跡調査における生活習慣病発症との関連を生存分析で検証し、二次調査時(5年後)の症状変化(血圧、血糖、脂質指標の改善および増悪)との関連についても分析を進める。
さらなる研究の展開としては、DNAメチル化状態と生活習慣病との関連について、ライフスタイル因子(身体活動、食事など)の調整や層別に分けた解析等を計画する。DNAメチル化と生活習慣病との関連にライフスタイル要因がどう影響するか、交互作用や経時的な変化を含めて検証することで、生活習慣病リスク低減のために有効なエピゲノム特性に応じた具体的な要因を明らかにすることを目指す。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Interaction between Habitual Green Tea and Coffee Consumption and ACTN3 Genotype in Association with Skeletal Muscle Mass and Strength in Middle-Aged and Older Adults2024

    • 著者名/発表者名
      Iwasaka C.、Nanri H.、Hara M.、Nishida Y.、Shimanoe C.、Yamada Y.、Furukawa T.、Higaki Y.、Momozawa Y.、Nakatochi M.、Wakai K.、Matsuo K.、Tanaka K.
    • 雑誌名

      Journal of Frailty & Aging

      巻: - 号: 3 ページ: 267-275

    • DOI

      10.14283/jfa.2024.3

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dose-response relationship between daily step count and prevalence of sarcopenia: A cross-sectional study.2023

    • 著者名/発表者名
      Iwasaka C, Yamada Y, Nishida Y, Hara M, Yasukata J, Miyoshi N, Shimanoe C, Nanri H, Furukawa T, Koga K, Horita M, Higaki Y, Tanaka K.
    • 雑誌名

      Exp Gerontol.

      巻: 175 ページ: 112135-112135

    • DOI

      10.1016/j.exger.2023.112135

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association of appendicular extracellular-to-intracellular water ratio with age, muscle strength, and physical activity in 8,018 community-dwelling middle-aged and older adults.2023

    • 著者名/発表者名
      Iwasaka C, Yamada Y, Nishida Y, Hara M, Yasukata J, Miyoshi N, Shimanoe C, Nanri H, Furukawa T, Koga K, Horita M, Higaki Y, Tanaka K.
    • 雑誌名

      Arch Gerontol Geriatr.

      巻: 108 ページ: 104931-104931

    • DOI

      10.1016/j.archger.2023.104931

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association Between the Appendicular Extracellular-to-Intracellular Water Ratio and All-Cause Mortality: A 10-Year Longitudinal Study2023

    • 著者名/発表者名
      Iwasaka Chiharu、Yamada Yosuke、Nishida Yuichiro、Hara Megumi、Yasukata Jun、Miyoshi Nobuyuki、Shimanoe Chisato、Nanri Hinako、Furukawa Takuma、Koga Kayoko、Horita Mikako、Higaki Yasuki、Tanaka Keitaro
    • 雑誌名

      The Journals of Gerontology: Series A

      巻: 79 号: 2

    • DOI

      10.1093/gerona/glad211

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 日本人におけるポリジェニックリスクスコアと糖尿病の関連:J-MICC Study2024

    • 著者名/発表者名
      古川拓馬,西田裕一郎,原めぐみ,島ノ江千里,岩坂知治,田中恵太郎,J-MICC Study Group
    • 学会等名
      第34回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳がんのPolygenic Risk Scoreによる乳がん罹患予測:J-MICC Study2024

    • 著者名/発表者名
      原めぐみ, 古川拓馬, 西田裕一郎, 島ノ江千里, 田中恵太郎, J-MICC Study Group
    • 学会等名
      第34回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸がん・乳がん罹患リスクに対する身体活動とVTI1A・TCF7L2遺伝子多型の交互作用2024

    • 著者名/発表者名
      西田裕一郎, 原めぐみ, 田口尚人, 岩坂知治, 古川拓馬, 島ノ江千里, 堀田美加子, 檜垣靖樹, 田中恵太郎
    • 学会等名
      第34回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 糖尿病患者の高血圧とグルココルチコイド活性マーカーとの関連:J-MICC Study SAGA2024

    • 著者名/発表者名
      島ノ江千里, 松本明子, 原めぐみ, 西田裕一郎, 古川拓馬, 田中恵太郎, J-MICC study group
    • 学会等名
      第34回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Baseline Serum Zinc Levels Positively Associated with Humoral Response to COVID-19 Vaccine in Japanese Women2024

    • 著者名/発表者名
      M. Said Ashenagar, Megumi Hara, Mikiko Tokiya, Takuma Furukawa, Chiharu Iwasaka, Takeshi Sawada, Yoshio Hirota, Akiko Matsumoto
    • 学会等名
      第94回 日本衛生学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Association between Specific T Cell Responses and rs671 Polymorphism Following COVID-19 Vaccination: Prospective Study in the Japanese General Population2024

    • 著者名/発表者名
      Sudarma Bogahawaththa, Megumi Hara, Takuma Furukawa, Chihara Iwasaka, Takeshi Sawada, Gouki Yamada, Mikiko Tokiya, Kyoko Kitagawa, Yasunobu Miyake, Yoshio Hirota, Akiko Matsumoto
    • 学会等名
      第94回 日本衛生学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Humoral immunogenicity of COVID-19 mRNA vaccines: a prospective study focusing on blood selenium and vitamin D levels at baseline.2024

    • 著者名/発表者名
      Gouki Yamada, Akiko Matsumoto, Takuma Furukawa, Chiharu Iwasaka, Takeshi Sawada, Mikiko Tokiya, M.Said Ashenagar, Mikako Horita, Tadayuki Tsujita, Megumi Hara
    • 学会等名
      17th Vaccine Congress
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Dynamics of lymphocyte subsets during the COVID-19 vaccination process in Japanese general population2023

    • 著者名/発表者名
      Takuma Furukawa,Gouki Yamada,Akiko Matsumoto,Chiharu Iwasaka,Takeshi Sawada,Mikiko Tokiya,Mikako Horita,Megumi Hara
    • 学会等名
      17th Vaccine Congress
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] COVID-19ワクチン接種過程におけるリンパ球サブセットの動態2023

    • 著者名/発表者名
      古川拓馬,山田剛暉,松本明子,岩坂知治,澤田孟志,土器屋美貴子,堀田美加子,原めぐみ
    • 学会等名
      ワクチンの有効性・安全性と効果的適用に関する疫学研究班 令和5年度 第1回班会議
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 四肢切断症例における再切断および死亡リスクに対する糖尿病の関連:レセプトデータ分析による検証2023

    • 著者名/発表者名
      古川 拓馬,藤本 賢治,永渕 美樹,美奈川 仁美,原 めぐみ,吉田 倫子,石川 慎一郎,高橋 宏和,安西 慶三
    • 学会等名
      第23回日本糖尿病インフォマティクス学会年次学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2023-04-13   更新日: 2024-12-25  

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