| 研究課題/領域番号 |
23K16987
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
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| 研究機関 | 筑波大学 |
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研究代表者 |
吉野 龍ノ介 筑波大学, 医学医療系, 助教 (50817575)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2025年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2024年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2023年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
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| キーワード | 分子動力学計算 / PROTAC / 作用機序解析 / 分子設計 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
E3ユビキチンリガーゼと特定の標的タンパク質を認識する機能性低分子であるPROTACの活性の発現には、両タンパク質を繋ぐ適切なリンカーの設計が重要である。PROTACは本来の相互作用ペアではないタンパク質同士を結合させるモダリティであるため、設計の基準となる三元複合体モデルの構築が求められている。
本研究では拡張サンプリングを適用した分子動力学法による三元複合体モデル予測を提案する。各タンパク質が複合体構造を形成する挙動のみを採用するサンプリング法を適用し、それらの結果から適切なリンカーが持つ物理化学的な特徴を抽出することによってリンカー構造の評価手法の確立を目指す。
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