細胞内立体トランスクリプトームダイナミクスの配列的理解

• 研究課題/領域番号: 23K16991
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 小嶋 泰弘 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (00881731)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2025年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2024年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: 空間トランスクリプトーム / 細胞内局在 / 深層生成モデル

研究開始時の研究の概要

細胞内部ではRNAを含む多様な生体分子が、その機能的な空間分布を状況に応じて変化させることにより、細胞の環境適応的、かつ多様な振る舞いを実現している。それでは、細胞はいかにして数千種類にも及ぶRNA分子の機能的な時空間動態を実現しているのであろうか。本研究では、申請者独自のトランスクリプトームの確率的動態を推定する深層生成モデルと二次元画像からの立体再構築手法を組み合わせることにより、Subcellularトランスクリプトーム観測から細胞内部の転写産物の時空間動態をRNA配列や転写制御配列と紐づけて推定するための新技術を開発する。