連続時間隠れマルコフモデルとiPS細胞技術を用いた神経変性疾患進行の予測

• 研究課題/領域番号: 23K16994
• 研究種目: 若手研究
• 配分区分: 基金
• 審査区分: 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
• 研究機関: 広島大学
• 研究代表者: 矢田 祐一郎 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 特任助教 (80805797)
• 研究期間 (年度): 2023-04-01 – 2026-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2023年度)
• 配分額: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2025年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2024年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2023年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 神経変性疾患 / 連続時間隠れマルコフモデル / iPS細胞

研究開始時の研究の概要

本研究では、ALS患者では運動スコアの低下として観測される疾患状態進行を、患者毎に状態遷移速度パラメータが異なる連続時間隠れマルコフモデルで表現する。この状態遷移速度パラメータが患者のiPS 細胞由来運動ニューロンの表現型で表されると仮定し、ALS患者コホートから運動スコア等を経時的に観察した臨床経時データ、およびコホート参加患者から作製したiPS細胞由来運動ニューロンの表現型データからモデルパラメータを推定する。未知の患者でiPS細胞由来運動ニューロンの表現型から状態遷移速度パラメータを予測できるか検証する。