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DNAナノデバイスの複合化で挑む多応答性ヒドロゲルの創出

研究課題

研究課題/領域番号 23K17860
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分28:ナノマイクロ科学およびその関連分野
研究機関三重大学

研究代表者

鈴木 勇輝  三重大学, 工学研究科, 准教授 (50636066)

研究分担者 佐藤 佑介  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 准教授 (60830560)
研究期間 (年度) 2023-06-30 – 2026-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2025年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2024年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2023年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードDNAナノテクノロジー / DNA液滴 / DNAゲル / ナノデバイス / 刺激応答性 / DNAオリガミ / DNAナノデバイス / バイオマテリアル
研究開始時の研究の概要

本研究課題では,人工的に設計・構築した刺激応答性DNAオリガミナノデバイスを,自在に組み合わせてゲル化させることで,多機能・多応答性DNAヒドロゲルを実現する.具体的には,①DNAナノアクチュエータを構成要素としたネットワークの形成,②複数種の刺激応答性DNAナノアクチュエータの複合化,に取り組むことで,多刺激応答性DNAヒドロゲルを開発する.本挑戦を通して,ナノスケールのデバイス機能をマクロスケールのシステム機能へと統合するための学理の抽出を図るとともに,スマートバイオマテリアルの階層的かつモジュラーな設計・構築法を確立する.

研究実績の概要

本研究課題では,人工的に設計・構築した複数種の刺激応答性DNAオリガミナノデバイスを複合化し,ゲル化させることで,多機能・多応答性DNAヒドロゲルを構築することを目的としている。分子スケールの素材特性とマクロスケールの物性を,ナノ構造の設計で繋ぐことで,DNAヒドロゲルの階層的かつモジュラーな設計・構築法を確立することを目指す。
研究初年度となる2023年度は,DNAオリガミ法により二種類(pH応答性およびカリウムイオン応答性)のベンディングナノアクチュエータを構築し,それらをさまざまな配向で接続する手法を検討した。二種類の構造の複合化に必要な直交塩基配列を設計し,電気泳動法および原子間力顕微鏡により,多量体形成を評価した。特に,二種のナノアクチュエータを並列的に接続する場合においては,90%に近い収率で二量体から四量体までを階層的に構築することができた。液中原子間力顕微鏡観察により,複合化した多量体構造がpH応答性およびカリウムイオン応答性を有する多重応答性構造であることを確認した。
DNAゲルの構成要素となるDNA分岐モチーフとDNAオリガミを複合化する手法についても検討を進めた.具体的には,あらかじめ三分岐DNAモチーフの自己集合により作製したDNA液滴に対して,その表面を覆うように3次元状のDNAオリガミ構造体を結合させた。共焦点レーザー顕微鏡観察により,DNAオリガミにより被覆されたDNA液滴は,被覆なしの液滴に比べ,液滴同士の融合が抑えられていることが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究初年度のうちに,二種類のDNAオリガミナノデバイスの複合化の基礎検討を完了することができた。さらに,DNA液滴へのDNAオリガミ構造の導入についても見通しを立てることができた。

今後の研究の推進方策

23年度に確立したDNAオリガミデバイスの多量体化手法を発展させ,複数種の刺激応答性DNAナノアクチュエータから成るネットワーク構造の構築を進める。DNA液滴の内部にナノアクチュエータを導入する手法についても検討を進める。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 4件)

  • [雑誌論文] Multi-Reconfigurable DNA Origami Nanolattice Driven by the Combination of Orthogonal Signals2023

    • 著者名/発表者名
      Kotaro Watanabe, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Yuki Suzuki
    • 雑誌名

      JACS Au

      巻: To appear 号: 5 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1021/jacsau.3c00091

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chemo-mechanical forces modulate the topology dynamics of mesoscale DNA assemblies2023

    • 著者名/発表者名
      Karna Deepak、Mano Eriko、Ji Jiahao、Kawamata Ibuki、Suzuki Yuki、Mao Hanbin
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 6459-6459

    • DOI

      10.1038/s41467-023-41604-z

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Real-time monitoring of the amyloid β1-42 monomer-to-oligomer channel transition using a lipid bilayer system2023

    • 著者名/発表者名
      Numaguchi Yuri、Tsukakoshi Kaori、Takeuchi Nanami、Suzuki Yuki、Ikebukuro Kazunori、Kawano Ryuji
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 3 号: 1

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgad437

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Multi-responsive and reconfigurable DNA origami nanostructures2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Suzuki
    • 学会等名
      DNA 29
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Hierarchical self-assembly of DNA origami nanoactuators toward large deformation of cellular-sized liposomes2023

    • 著者名/発表者名
      Reo Toho, Shin Watanabe, Ibuki Kawamata, Yuki Suzuki
    • 学会等名
      DNA 29
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Hierarchical self-assembly of multi-stimuli-responsive DNA origami nanoactuator2023

    • 著者名/発表者名
      Shin Watanabe, Reo Toho, Ibuki Kawamata, Yuki Suzuki
    • 学会等名
      The 50th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Multi-reconfigurable DNA nanodevice actuated by the combination of orthogonal signals2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Suzuki, Kotaro Watanabe, Yuri Kobayashi, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata
    • 学会等名
      The 50th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (ISNAC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2023-07-04   更新日: 2024-12-25  

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