• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

誘導ラマンと機械学習による無標識・超多色・超解像イメージング

研究課題

研究課題/領域番号 23K17886
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分30:応用物理工学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

小関 泰之  東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60437374)

研究期間 (年度) 2023-06-30 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2024年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2023年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワード誘導ラマン散乱 / 機械学習 / 超多色イメージング / 超解像イメージング
研究開始時の研究の概要

本研究では、2色の光パルスを用いて分子振動を検出するSRS顕微法を用いて分子分光画像を得るとともに、ラマンプローブを用いた超多色イメージングおよび超解像ラマンイメージングを行い、複数視野の細胞を観察することで大量の教師データを生成し、それを用いて深層学習モデルをトレーニングする。これにより無標識生体試料のSRS像からの超多色画像および超解像画像の予測モデルを構築し、無標識生体試料の超多色・超解像イメージングを実現する。

研究実績の概要

2023年度はSRS顕微鏡の改良を進め、誘導ラマン散乱(SRS)による分子振動分光イメージングと、蛍光イメージングを同時かつ複数視野で行うことが可能になった。さらに、このシステムを用いて多数の細胞のハイパースペクトルSRS像と蛍光像を得て、SRS像から蛍光像を予測する機械学習モデルを開発した。
具体的には、ステージ走査をしながらSRS像と蛍光像を取得するにあたり、ステージ移動に伴う試料高さ変化や、データ取得用プログラムコードのバグを修正するとともに、細胞の蛍光染色条件を最適化した。並行して、90枚程度のハイパースペクトルSRS画像を入力データとして扱うための機械学習モデルを開発した。これらを用いて、ミトコンドリアの蛍光像とSRS像を同時取得し、SRS像からミトコンドリア像を予測することに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

多数の細胞のSRS像と蛍光像の同時取得および機械学習モデルの開発に成功したため。

今後の研究の推進方策

計画通り引き続きSRS像から蛍光像を予測する機械学習モデルの改良と超解像画像の予測に取り組む。

報告書

(1件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2024 その他

すべて 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [学会発表] Label-Free Organelle Imaging by Hyperspectral Stimulated Raman Scattering and Deep Learning2024

    • 著者名/発表者名
      Yang Ma, Takaha Mizuguchi, Spencer Spratt, Yasuyuki Ozeki
    • 学会等名
      第71回応用物理学会春季学術講演会、23p-12C-8、東京、2024年3月23日。
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] Ozeki Group

    • URL

      https://sites.google.com/site/ozekibp/

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2023-07-04   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi