研究課題/領域番号 |
23K18039
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研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
中区分39:生産環境農学およびその関連分野
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研究機関 | 公益財団法人かずさDNA研究所 |
研究代表者 |
平川 英樹 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, 主任研究員 (80372746)
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研究分担者 |
小野寺 康之 北海道大学, 農学研究院, 准教授 (80374619)
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研究期間 (年度) |
2023-06-30 – 2026-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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配分額 *注記 |
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2025年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2024年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
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キーワード | Alphafold2 / 高次的機能SNP / タンパク質立体構造 / 機能部位 / 原因遺伝子 |
研究開始時の研究の概要 |
多型解析で検出される膨大なSNPから有力な原因遺伝子の候補を絞り込むため,ホウレンソウとトマト,アブラナ属作物において,Alphafold2で予測されたタンパク質立体構造上の非同義置換の位置を特定し,機能・活性に直接的に影響を与える「高次機能的SNP遺伝子」を同定し,栽培化,エリート品種の成立,変種の分化,地域適応および性分化と関連性を示すものの発現パターンの違いを調べる.ホウレンソウおよびアブラナ属作物を宿主とするキュウリモザイクウイルス由来のベクターを用いたウイルス誘導ジーンサイレンシング系を用い,高次機能的SNP遺伝子をノックダウンし,表現型の変化に基づく機能同定を行う.
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