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汎熱帯海流散布植物の分布周縁における進化過程の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23K20303
補助金の研究課題番号 20H03310 (2020-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2020-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関京都大学

研究代表者

高山 浩司  京都大学, 理学研究科, 准教授 (60647478)

研究分担者 田村 実  京都大学, 理学研究科, 教授 (20227292)
布施 静香  京都大学, 理学研究科, 准教授 (30344386)
梶田 忠  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (80301117)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2024年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2023年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2022年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2021年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2020年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
キーワード海流散布 / 海流散布植物 / 系統地理 / 種子散布 / 種分化 / 局所適応 / 集団ゲノミクス / 日本列島 / 小笠原諸島 / 遺伝的多様性 / 周辺種分化 / 広域分布種
研究開始時の研究の概要

汎熱帯海流散布植物の分布の北限域である日本列島の温帯海岸域や小笠原諸島では、汎熱帯海流散布植物を母種として分化したと推測される地域固有種が複数種知られている。これらの地域固有種は、分布周縁部における地域的な選択圧や集団隔離が、種子散布によって維持される集団間の遺伝子流動の効果を上回ったために、平行的に種分化してきたと考えられる。本研究では、温帯域への適応や島嶼環境での地理的隔離が汎熱帯海流散布植物の分布周縁部での種分化をもたらしたという仮説を、複数の種群を対象にした集団ゲノミクス解析等により検証し、海流散布植物を中心とした海洋分散型生物の多様性維持創機構の理解に貢献する。

研究実績の概要

本研究では、汎熱帯海流散布植物の分布周縁における地域固有種の進化過程を解明することを目的としている。日本列島の温帯海岸域や小笠原諸島には、汎熱帯海流散布植物から派生したと推測される地域固有種が複数存在する。これら複数の分類群に着目して、(1)地域固有種を生み出した集団動態、(2)種分化・集団分化のパターンをもたらす自然選択、(3)地域固有種を生み出した地史的背景を解明する。
1.試料収集:オオハマボウ、ナガミハマナタマメ、ハマオモト、グンバイヒルガオ、イワタイゲキのDNAおよびRNA試料を日本国内、台湾およびグアムで収集した。
2.広義ハマオモトの系統地理:葉緑体ゲノムおよびゲノムワイド一塩基多型解析により、ハマオモト種内の系統関係と集団の遺伝構造を解析した。現在までのところ日本列島の集団が単一起源である可能性が示されている。さらに琉球列島付近を境にした南北の集団遺伝構造が見られることが明らかとなった。
3.イワタイゲキの系統地理:中琉球を境に南北で遺伝的分化が見られることが明らかとなった。生態ニッチモデリングおよび分岐年代推定から、最終氷期から現在にかけての集団の移動拡散がイワタイゲキ種内に見られた遺伝構造に強く影響していることが推察された。本内容を国際誌に発表した。
今後は、他の種についても同様の解析を進め、種間の遺伝構造の共通性と固有性を明らかにしていく。また、集団遺伝学的解析に加え、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、分布形成過程を解明していく予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

海外での試料収集が遅れていたが、台湾およびグアムで試料採集を行い、遅れを取り戻しつつある。最も解析が進んでいるオオハマボウとイワタイゲキニついて誌上発表まで行うことができた。種間比較の結果から、ハマボウ、ハマオモト、イワタイゲキでは、それぞれ異なる種内の遺伝構造が存在することが示されている。この違いに関しては、集団遺伝学的解析に加え、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、分布形成過程を解明していく予定である。

今後の研究の推進方策

今年度は未解析の分類群(グンバイヒルガオとハマナタマメ)を中心に既存のサンプルを用いて遺伝解析を進めていく。さらに、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、多面的アプローチにより分布形成過程を解明していく予定である。また、これまでの研究成果を国際植物学会議(IBC 2024)で発表する予定である。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 1件、 招待講演 5件)

  • [国際共同研究] 台湾中興大学(その他の国・地域)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] グアム大学(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Spatiotemporal process of long‐distance seed dispersal in a pantropically distributed sea hibiscus group2023

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Yuri、Kajita Tadashi、Takayama Koji
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: 32 号: 7 ページ: 1726-1738

    • DOI

      10.1111/mec.16836

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 沈水植物マツモの南大東島からの初報告 ― 沖縄島(うるま市)および石垣島の集団との比較 ―2023

    • 著者名/発表者名
      梶田結衣、赤井賢成、梶田 忠
    • 雑誌名

      沖縄生物学会誌

      巻: 61 ページ: 25-31

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] First record of potential bird pollination in the holoparasitic genus <i>Orobanche</i> L.2022

    • 著者名/発表者名
      Nishimura Akihiro、Takayama Koji
    • 雑誌名

      Plant Species Biology

      巻: 38 号: 1 ページ: 6-17

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12389

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The complete chloroplast genome of a coastal plant, <i>Euphorbia jolkinii</i> (Euphorbiaceae)2022

    • 著者名/発表者名
      Iwata Hiroyuki、Ito Takuro、Kokubugata Goro、Takayama Koji
    • 雑誌名

      Mitochondrial DNA Part B

      巻: 7 号: 3 ページ: 569-570

    • DOI

      10.1080/23802359.2022.2055502

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Multiple origins of two Ochrosia (Apocynaceae) species endemic to the Bonin (Ogasawara) Islands2022

    • 著者名/発表者名
      Noda Hiroshi、Nishimura Akihiro、Kato Hidetoshi、Naiki Akiyo、Xiao Wei、Martinez Mario、Marutani Mari、McConnell James、Takayama Koji
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      巻: 171 ページ: 107455-107455

    • DOI

      10.1016/j.ympev.2022.107455

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 非調和な森が織りなす小笠原諸島固有植物の進化2021

    • 著者名/発表者名
      高山浩司
    • 雑誌名

      milsil

      巻: 14 ページ: 9-11

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] The complete chloroplast genome of a pantropical legume, Canavalia rosea2021

    • 著者名/発表者名
      Imai Ryosuke、Kajita Yui、Yamamoto Takashi、Takayama Koji、Kajita Tadashi
    • 雑誌名

      Mitochondrial DNA Part B

      巻: 6 号: 2 ページ: 295-296

    • DOI

      10.1080/23802359.2020.1859341

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] グミ属における小笠原諸島固有種から伊豆諸島の広域分布種への遺伝子浸透2024

    • 著者名/発表者名
      塚本佳生、高山浩司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 海流散布植物ハマオモトの日本列島集団の起源と遺伝構造2024

    • 著者名/発表者名
      小嶋健太、野田博士、高山浩司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 小笠原固有寄生植物シマウツボにおける集団動態と宿主転換の歴史性2024

    • 著者名/発表者名
      西村
    • 学会等名
      日本植物分類学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 小笠原諸島西之島に定着したスベリヒユの起源2024

    • 著者名/発表者名
      野田博士、中野智之、川上和人、上條隆志、高山 浩司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 海洋島固有植物の分岐による種分化と分岐によらない種分化2023

    • 著者名/発表者名
      高山浩司
    • 学会等名
      第55回種生物学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本列島におけるハマウツボとオカウツボの系統解析2023

    • 著者名/発表者名
      西村明洋、高山浩司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第22回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 植物の生物地理・系統地理 -海浜植物を中心に-2022

    • 著者名/発表者名
      高山浩司
    • 学会等名
      日本土壌生物学会第44回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 日本海浜における海流散布植物イワタイゲキ(トウダイグサ科)の地理的遺伝構造2022

    • 著者名/発表者名
      岩田寛之、伊東拓朗、國府方吾郎、野田博士、高山 浩司
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 日本列島におけるハマオモトの遺伝構造2022

    • 著者名/発表者名
      小嶋健太、野田博士、高山浩司
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 小笠原固有寄生植物シマウツボにおける宿主転換の歴史と遺伝的背景2022

    • 著者名/発表者名
      西村明洋、高山浩司
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 海洋島における海流散布植物の内陸適応と進化2021

    • 著者名/発表者名
      高山浩司
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 小笠原諸島の自然環境と固有種2021

    • 著者名/発表者名
      高山浩司
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 南方起源海流散布植物ハマボウの集団遺伝構造と種子散布能力2021

    • 著者名/発表者名
      山﨑由理・Marina Cho,・Ji Young Yang・髙山浩司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第20回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Endemic species on an uninhabited island as a witness for extinct lineages: an example from the Bonin Islands2020

    • 著者名/発表者名
      Koji Takayama
    • 学会等名
      Island Biology Symposium 2020
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-12-25  

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