• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

RNAモドミクスを基軸とする新規核酸生理学の開拓

研究課題

研究課題/領域番号 23K21370
補助金の研究課題番号 21H02659 (2021-2023)
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金 (2024)
補助金 (2021-2023)
応募区分一般
審査区分 小区分48020:生理学関連
研究機関東北大学

研究代表者

魏 范研  東北大学, 加齢医学研究所, 教授 (90555773)

研究分担者 小川 亜希子  東北大学, 加齢医学研究所, 助教 (00868565)
松田 盛  東北大学, 加齢医学研究所, 助教 (00884272)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2024年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
キーワードRNA / RNA修飾 / GPCR / 核酸代謝 / 受容体 / 免疫応答
研究開始時の研究の概要

本申請者は、多彩な生体高次機能を調節しうる新しいカテゴリーの液性因子群を発見した。この液性因子群は多様な化学修飾を含むRNA塩基(修飾ヌクレオシド)で構成されており、刺激に応じて分泌が亢進し、特定の受容体を活性化し免疫応答を惹起するといった生理活性を有するものを見いだしつつある。本研究は、メチルアデノシン(m6A)に焦点を絞り、分子生理学や構造生物学など様々な角度からm6Aの生理機能の全貌解明に注力するとともに、機能未解明な修飾ヌクレオシドについては、受容体の同定や生理活性の解析を加速する。これらの研究を通して、修飾ヌクレオシドを基軸とする「新核酸生理学」の開拓と確立を目指す。

研究実績の概要

本計画研究の代表者は新しいカテゴリーの液性因子群を発見した。この液性因子群は多様な化学修飾を含むRNA塩基(修飾ヌクレオシド)で構成されており、中には刺激に応じて分泌が亢進し、特定の受容体を活性化し免疫応答を調節するといった生理活性を有するものも存在する。修飾ヌクレオシドは従来の概念にないものであり、多彩な生命現象を調節しうる。本研究では、修飾ヌクレオシドの一種である、メチルアデノシン(m6A)に焦点を絞り、分子生理学や構造生物学など様々な角度からm6Aの生理機能の全貌解明に注力しつつ、機能未解明な修飾ヌクレオシドについては、受容体の同定や生理活性の解析を進める。2023年度においては共同研究者とともにm6Aが結合するアデノシンA3受容体のクライオ電顕解析を進め、立体構造に関する詳細な情報を得られた。また、得られた立体構造をもとにアミノ酸置換変異体を作成し、m6Aによる受容体活性化能の変化を検討することで、当該アミノ酸残基の重要性をバリデーションした。その結果、結合ポケットに存在する疎水性アミノ酸はA3受容体とm6Aの結合特異性に重要であることが明らかになった。構造解析に加え、2023年度においてm6Aの代謝機構について研究を進め、m6Aに作用するリン酸化酵素と脱アミノ化酵素の作用を見出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

構造解析と修飾ヌクレオシドの代謝機構に関する解析が順調に進んでおり、論文化の目処が立ったため

今後の研究の推進方策

2024年度は最終年度であり、前年度の成果に基づきm6AによるA3受容体活性化の分子基盤をさらに進める。具体的には、前年度から進めている受容体のアミノ酸置換変異体のバリエーションをさらに増やし、その後受容体の活性化アッセイや細胞内カルシウムイメージングといった機能解析を通して、m6Aによる活性化の分子メカニズムの全貌を明らかにするとともに、m6A以外の修飾ヌクレオシドについてスクリーニングを進める。
また、m6Aの代謝機構については、リン酸化酵素や脱アミノ化酵素のノックアウトマウスの表現型解析、臓器のプロテオーム解析やメタボローム解析、トランスクリプトーム解析といったマルチオミクスを実施し、m6A代謝の生理意義を明らかにする。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 4件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 5件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Steep increase in the number of transthyretin-positive cardiac biopsy cases in Japan: evidence obtained by the nation-wide pathology consultation for the typing diagnosis of amyloidosis2023

    • 著者名/発表者名
      Naiki H, Yamaguchi A, Sekijima Y, Ueda M, Ohashi K, Hatakeyama K, Ikeda Y, Hoshii Y, Shintani-Domoto Y, Miyagawa-Hayashino A, Tsujikawa H, Endo J, Arai T, Ando Y.
    • 雑誌名

      Amyloid

      巻: 30 号: 1 ページ: 321-326

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04680-x

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epitranscriptomics in metabolic disease.2023

    • 著者名/発表者名
      Matsumura Y, Wei FY, Sakai J.
    • 雑誌名

      Nat Metab

      巻: 5(3) 号: 3 ページ: 370-384

    • DOI

      10.1038/s42255-023-00764-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書 2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mitochondrial alterations in the cochlea of Cdk5rap1-knockout mice with age-related hearing loss2023

    • 著者名/発表者名
      Miwa Toru、Katsuno Tatsuya、Wei Fan‐Yan、Tomizawa Kazuhito
    • 雑誌名

      FEBS Open Bio

      巻: 13 号: 7 ページ: 1365

    • DOI

      10.1002/2211-5463.13655

    • URL

      https://pure.teikyo.jp/en/publications/0f25790c-1007-49d1-bd8f-0a356c8b3ed6

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Supersulphides provide airway protection in viral and chronic lung diseases2023

    • 著者名/発表者名
      Matsunaga Tetsuro、Sano Hirohito、Takita Katsuya、Morita Masanobu、Yamanaka Shun、Ichikawa Tomohiro、Numakura Tadahisa、Ida Tomoaki、Jung Minkyung、Ogata Seiryo、Yoon Sunghyeon、Fujino Naoya、Kyogoku Yorihiko、Akaike Takaaki、et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 4476-4476

    • DOI

      10.1038/s41467-023-40182-4

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Supersulfide biology and translational medicine for disease control2023

    • 著者名/発表者名
      Barayeu Uladzimir、Sawa Tomohiro、Nishida Motohiro、Wei Fan-Yan、Motohashi Hozumi、Akaike Takaaki
    • 雑誌名

      British Journal of Pharmacology

      巻: - ページ: 1-11

    • DOI

      10.1111/bph.16271

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Pathological mutations promote proteolysis of mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1 (MTU1) via mitochondrial caseinolytic peptidase (CLPP)2023

    • 著者名/発表者名
      Ahmad Raja Norazireen?Raja、Zhang Long-Teng、Morita Rikuri、Tani Haruna、Wu Yong、Chujo Takeshi、Ogawa Akiko、Harada Ryuhei、Shigeta Yasuteru、Tomizawa Kazuhito、Wei Fan-Yan
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 52 号: 3 ページ: 1341-1358

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1197

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Extracellular N6-isopentenyladenosine (i6A) addition induces co-transcriptional i6A incorporation into ribosomal RNAs.2022

    • 著者名/発表者名
      Yakita M, Chujo T, Wei FY, Hirayama M, Kato K, Takahashi N, Naganuma K, Nagata M, Kawahara K, Nakayama H, Tomizawa K.
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 28 号: 7 ページ: 1013-1027

    • DOI

      10.1261/rna.079176.122

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Movements of Ancient Human Endogenous Retroviruses Detected in SOX2-Expressing Cells2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuaki Monde, Yorifumi Satou, Mizuki Goto, Yoshikazu Uchiyama, Jumpei Ito, Taku Kaitsuka, Hiromi Terasawa, Nami Monde, Shinya Yamaga, Tomoya Matsusako, Fan-Yan Wei, Ituro Inoue, Kazuhito Tomizawa, Akira Ono, Takumi Era, Tomohiro Sawa, Yosuke Maeda
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: NA 号: 9

    • DOI

      10.1128/jvi.00356-22

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Aberrant RNA processing contributes to the pathogenesis of mitochondrial diseases in trans-mitochondrial mouse model carrying mitochondrial tRNALeu(UUR) with a pathogenic A2748G mutation2022

    • 著者名/発表者名
      Tani Haruna、Ishikawa Kaori、Tamashiro Hiroaki、Ogasawara Emi、Yasukawa Takehiro、Matsuda Shigeru、Shimizu Akinori、Kang Dongchon、Hayashi Jun-Ichi、Wei Fan-Yan、Nakada Kazuto
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: 16 ページ: 9382-9396

    • DOI

      10.1093/nar/gkac699

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] t6A and ms2t6A Modified Nucleosides in Serum and Urine as Strong Candidate Biomarkers of COVID-19 Infection and Severity2022

    • 著者名/発表者名
      Nagayoshi Y、Nishiguchi K、Yamamura R、Chujo T、Oshiumi H、Nagata H、Kaneko Hi、Yamamoto K、Nakata H、Sakakida K、Kunisawa A、Adachi M、Kakizoe Y、Mizobe T、Kuratsu Ji、Shimada S、Nakamori Y、Matsuoka M、Mukoyama M、Wei FY、Tomizawa K
    • 雑誌名

      Biomolecules

      巻: 12 号: 9 ページ: 1233-1233

    • DOI

      10.3390/biom12091233

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Extracellular modified nucleosides derived from RNA catabolism activates GPCR2023

    • 著者名/発表者名
      小川亜希子、魏 范研
    • 学会等名
      The 28th Annual Meeting of the RNA SOCIETY (RNA2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 呼気オミックス・エアロバイオミックス2023

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      第76回日本酸化ストレス学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA Epitranscriptome in neurological disease2023

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      Karolinska Institutet and Tohoku University Meeting
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 超硫黄によるミトコンドリアtRNA修飾制御と代謝疾2023

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA Modification of Mitochondrial tRNAs in Life and Disease2023

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      OsakaMito 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Sulfur modification in humn mitochondrial tRNAs and the pathophysiological roles2022

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      Redox week in sendai 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Sulfur modification in mitochondrial RNA and its pathological relevance2022

    • 著者名/発表者名
      魏 范研
    • 学会等名
      第95回日本生化学学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi